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Isolation of longevity related genes of prasitic nematodes with east epression system

东表达系统分离寄生线虫长寿相关基因

基本信息

批准号：
24659190
负责人：
MARUYAMA Haruhiko
金额：
$ 2.5万
依托单位：
University of Miyazaki
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2012
资助国家：
日本
起止时间：
2012-04-01 至 2014-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-24659190/
关键词：
線虫寄生寿命ゲノムインスリンシグナル寄生虫

项目摘要

Parasitic animals live longer as compared with related free-living species. In order to elucidate molecular basis for the longevity, we constructed a high-quality draft genome of an intestinal nematode, Strongyloides venezuelensis, to approach this issue with bioinformatics. Statistics of our draft genome were as follows; total size 55.5 Mb, longest scaffold 15Mb, N50 scaffold length 2Mb, with 18,048 predicted coding genes.One of the genes which exist only in parasitic nematodes but not in free-living nematodes was that for ferrochelatase, which catalyzes the final step of hem-biosynthesis. We confirmed that this gene of S. venezuelensis was perfectly functional, though all nematodes including animal parasitic nematodes do not synthesize hem by themselves. Phylogenetic analysis suggested that animal parasitic nematodes acquired this gene from bacteria through horizontal gene transfer. The physiological role could be to detoxify hem, which is highly toxic to cells.

寄生动物比相关的自由生活物种活得更长。为了阐明线虫长寿的分子基础，我们构建了一个高质量的委内瑞拉圆线虫基因组草图，从生物信息学的角度探讨这一问题。我们的基因组草图统计如下：总大小55.5 Mb，最长支架15 Mb，N50支架长度2 Mb，预测编码基因18，048个。其中一个仅存在于寄生线虫中而不存在于自由生活线虫中的基因是亚铁螯合酶，其催化血红素生物合成的最后一步。我们证实了该基因在S. Venezuelensis是完全功能性的，尽管包括动物寄生线虫在内的所有线虫自身不合成HEM。系统发育分析表明，动物寄生线虫是通过水平基因转移从细菌获得该基因的。其生理作用可能是解除血红素的毒性，血红素对细胞有很高的毒性。

项目成果

期刊论文数量（24）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Bacteria-like ferrochelatase in animal parasitic nematodes.

动物寄生线虫中的细菌样亚铁螯合酶。

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
0
作者：
E. Nagayasu;S. Ishikawa;S. Taketani;G. Chakraborty;A. Yoshida;Y. Inagaki;H. Maruyama
通讯作者：
H. Maruyama

Genome and transcriptome analysis of Strongyloides venezuelensis, an animal parasitic nematode.

动物寄生线虫委内瑞拉类圆线虫的基因组和转录组分析。

DOI：
发表时间：
2013
期刊：
影响因子：
0
作者：
E. Nagayasu;Y. Ogura;T. Ito;I. Yoshida;G. Chakraborty;T. Hayashi;H. Maruyama.
通讯作者：
H. Maruyama.

A novel C-type lectin identified by EST analysis in tissue migratory larvae of Ascaris suum

通过 EST 分析在猪蛔虫组织迁移幼虫中鉴定出一种新型 C 型凝集素

DOI：
10.1007/s00436-011-2677-9
发表时间：
2012
期刊：
Parasitology Research
影响因子：
2
作者：
Yoshida A;Nagayasu E;Horii Y;Maruyama H
通讯作者：
Maruyama H

Efficient de novo assembly of highly heterozygous genomes from whole-genome shotgun short reads.

DOI：
10.1101/gr.170720.113
发表时间：
2014-08
期刊：
Genome research
影响因子：
7
作者：
Kajitani R;Toshimoto K;Noguchi H;Toyoda A;Ogura Y;Okuno M;Yabana M;Harada M;Nagayasu E;Maruyama H;Kohara Y;Fujiyama A;Hayashi T;Itoh T
通讯作者：
Itoh T

Bacteria-like ferrochelatase in animal parasitic nematodes

动物寄生线虫中的细菌样亚铁螯合酶