Development of prokaryotic growth accelerator using ribosomal RNA

利用核糖体RNA开发原核生长促进剂

• 批准号: 21K14771
• 负责人: 佐藤 悠
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Yamaguchi University (2022)Osaka University (2021)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K14771/
• 关键词: リボソームRNA; 増殖速度; バクテリア; プラスミド; 微生物操作技術

これまでに天然環境からさまざまな性質を有する原核生物が単離され、工業、医療、食品製造、水処理などの幅広い分野にて利用されてきた。一方、ユニークな性質を持ちながらも、増殖の遅さがネックとなり研究・開発を断念せざるを得ない微生物群が多々存在する。そのため、新たな産業応用の原石となる微生物を発掘するためには、原核生物の増殖速度を加速させる技術の開発が不可欠であり、本研究課題では微生物の増殖速度の制御が可能であるかどうかを検証する。環境微生物の増殖速度に関する1つの事実として、「タンパク質合成の翻訳機構に関与するリボソームRNA(rRNA)遺伝子をより多く有する種ほど増殖が速い傾向にある」。本知見より更に一歩踏み込み、rRNA遺伝子の発現量を人為的に改変させ、微生物の増殖速度への影響評価を行う。一般的な原核生物はゲノム上に複数コピーのrRNA遺伝子を持ち、種によってゲノム上の遺伝子の位置が異なる。また、全てのコピー間で塩基配列が同一でない場合があり、rRNA ごとに性質が同一でない可能性がある。上記の２つの問題により、一般的な原核生物を利用した検証は困難である。そこで本研究ではプラスミド上にのみ1種類のrRNA遺伝子を有する属細菌を利用し、そのコピー数を変化させることで問題の解決を試みた。当該年度は細菌の培養条件の最適化、有効な抗生物質マーカーの選抜、形質転換用のプラスミド構築を完了し、形質転換法を確立した。現在、同時並行にてError prone PCR法により推定複製領域に該当する部位に変異を導入した変異ライブラリーを構築している。

The nature of the natural environment is different from that of prokaryotes in isolation, industry, medical treatment, food production and water treatment. The nature of a party, a company, a company This research topic is to prove that it is possible to control the growth rate of microorganisms. The growth rate of environmental microorganisms is related to a number of factors, such as the tendency to increase the growth rate of species and RNA(rRNA) genes, and the tendency to increase the growth rate of species. This paper reviews the effects of artificial changes in rRNA gene production and microbial growth rate on the development of micro-organisms. In most prokaryotes, the position of the rRNA gene on the genome varies from one species to another. For example, if the rRNA gene is the same as the rRNA gene, the rRNA gene is the same as the rRNA gene. The above two problems are difficult to detect and use in prokaryotes in general. This study is aimed at solving the problem of bacterial utilization and transformation of the number of species and rRNA genes in the genus. This year, the optimization of bacterial culture conditions, the selection of effective antibiotic substances, the construction of equipment for form and quality conversion were completed, and the form and quality conversion method was established. Now, simultaneous Error prone PCR method is used to construct the domain of presumptive replication.

项目成果

温度適応に必要なものは何か？ー例外的な微生物を例にー

温度适应需要什么？

• 发表时间: 2022
• 作者: 佐藤 悠;岡野憲司;本田孝祐;佐藤 悠
• 通讯作者: 佐藤 悠

原核生物における多様な温度適応機構（Mechanisms underlying the temperature adaptation in prokaryotes）

原核生物温度适应的机制

• 发表时间: 2021
• 期刊: 環境バイオテクノロジー学会誌
• 作者: 佐藤 悠;岡野憲司;木村浩之;本田孝祐
• 通讯作者: 本田孝祐

好熱菌由来のヒートショックタンパク質による大腸菌のストレス耐性強化

嗜热菌衍生的热休克蛋白增强大肠杆菌的应激耐受性

• 发表时间: 2022
• 作者: 佐藤 悠;岡野憲司;本田孝祐
• 通讯作者: 本田孝祐

好熱好酸性アーキアThermoplasma acidophilum由来の2種類のセリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼの異種発現及び機能解析

嗜热嗜酸古菌嗜酸热原体两种丝氨酸羟甲基转移酶的异源表达和功能分析

• 发表时间: 2021
• 作者: 佐藤 悠;Maruf Ilma Fauziah;佐々木 由佳;Krebs Anastasia;Nieber Jochen;谷口 博範; 岡野 憲司;木谷 茂; Restiawaty Elvi;Akhmaloka;本田 孝祐
• 通讯作者: 本田 孝祐

Production of optically pure D-lactic acid from renewable resources

利用可再生资源生产光学纯 D-乳酸

• 发表时间: 2017
• 作者: 岡野憲司;濵真司;野田秀夫;近藤昭彦;本田孝祐;Kenji Okano
• 通讯作者: Kenji Okano