The search for drug targets and predictive biomarkers in hepatocellular carcinoma through integrative proteomics of PDX models

通过PDX模型的整合蛋白质组学寻找肝细胞癌的药物靶点和预测生物标志物

• 批准号: 21K16438
• 负责人: 奥野 正隆
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Aichi Cancer Center Research Institute
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K16438/
• 关键词: 肝臓癌; PDXモデル; PDC; プロテオミクス; 細胞表面タンパク質; 多層オミクス解析; CRISPR-Cas9; 合成致死; 分子標的治療; 薬剤感受性予測バイオマーカー

肝臓癌はもっとも予後が不良な固形癌のひとつである。近年のゲノム解析技術の目覚ましい進歩にもかかわらず、切除不能進行肝臓癌に対する有効な化学療法は限られており、革新的なアプローチによる新規治療法の開発が急務である。そこで、本研究では、プロテオミクスを用いた革新的なアプローチによって、肝臓癌の克服に取り組む。細胞表面タンパク質は、癌において機能的に重要な役割を果たしているだけでなく、その局在から、直接的な治療標的としても非常に有望である。細胞表面タンパク質は細胞内タンパク質に比べて極めて微量であることから、本研究では肝臓癌患者から外科手術によって採取された腫瘍検体を用いて患者腫瘍組織移植（patient-derived xenograft; PDX）モデルを樹立し、PDX腫瘍を用いて細胞表面タンパク質（サーフェスオーム）解析とリン酸化タンパク質解析による活性化シグナル経路同定を中心とした網羅的多層プロテオーム解析を行う。現在までに肝臓癌6症例についてPDXモデルを作成し、このうち1症例においては、さらに患者腫瘍由来細胞株（Patient-derived cells; PDC）を樹立できた。現在各PDX腫瘍のエクソーム解析、RNAシーケンス解析を行っており、またプロテオーム解析の準備を進めている。また、並行してマウス肝臓癌細胞株2株の樹立に成功した。マウス肝臓癌細胞株については、化学療法の感受性に関与する分子を網羅的に捕捉するために、CRISPR-Cas9システムによるゲノムワイド機能スクリーニングを進めている。

Hepatocellular carcinoma and solid cancer are not the same after treatment. In recent years, there have been advances in analytical technology for hepatocellular carcinoma that cannot be resected. Effective chemical therapy is limited, and the innovative new treatment method is urgent.そこで, this research では, プロテオミクスをなアプローチによって, the なアプローチによって, which was innovated by いた, and the にり组む for overcoming liver cancer. The cell surface quality is important for the function of cancer and cancer.けでなく, そのbureau in から, direct な treatment target としてもvery にhopeful である. Cell surface DNA and intracellular DNA are relatively small amounts of DNA, and this study is based on patients with liver cancer. The surgical procedure is to use patient-derived tissue transplantation to remove the tumor body. xenograft; PDX) モデルをEstablishment, PDX tumor をUsing いてCell surface texture (サーフェスオーム) analysis とリンThe multi-layered polyethylene terephthalate of acidified chlorine and chromatographic analysis of activated silica gel. Currently, there are 6 cases of hepatocarcinoma, についてPDX, モデルを成し, 1 case of このうち, においては, and さらに patient-derived cells; PDC) is established. Now each PDX tumor analysis, RNA analysis, analysis, and analysis are ready. He successfully established two liver cancer cell lines in parallel. Masato liver cancer cell lines, susceptibility to chemotherapy, and capture of molecular snaresスクリーニングを入めている.

项目成果

In-depth proteomic analysis of cancer models

癌症模型的深入蛋白质组学分析

• 发表时间: 2022
• 作者: Ayumu Taguchi;Yuichi Abe;Taisuke Kajino;Hisanori Isomura
• 通讯作者: Hisanori Isomura