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タバコモザイクウイルスゲノムの5′末端領域による翻訳制御機構の解析

タバコモザイクウイルスゲノムの5′末端領域による翻訳制御機構の解析
烟草花叶病毒基因组5末端区域的翻译控制机制分析
批准号:
22K14896
负责人:
吉田 哲也
金额:
$3.0万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2025-03-31

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项目成果

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植物プラス鎖RNAウイルスの一種であるタバコモザイクウイルス(TMV)のゲノムの5′末端領域は翻訳のエンハンサーとして働くことが報告されているが、当該領域による翻訳制御の分子機構の詳細は明らかとなっていない。これまでに、TMVゲノムRNAの5′末端領域内の様々な配列を持ついくつかの短鎖RNA断片が試験管内系におけるRNAの翻訳をトランスに阻害することを見出していた。このことから、翻訳阻害活性を持つ短鎖RNA断片に相当する配列が、TMVゲノム上で翻訳制御に重要な役割を果たす可能性が考えられた。そこで、様々な変異を導入した短鎖RNA断片バリアントの翻訳阻害活性を調べたところ、一部のバリアントで翻訳阻害活性が低下した。また、これまで見出した翻訳阻害活性を持つ短鎖RNA断片はいずれもTMV複製タンパク質の開始コドンを含むことから、短鎖RNA断片内の開始コドン部分に変異を導入したところ、翻訳阻害活性が大きく低下した。このことから、短鎖RNA断片による翻訳阻害には複数の配列部分が関わるが、中でも開始コドン部分が予想外に大きな役割を果たすことが明らかとなった。続いて、TMVとは無関係な複数のRNAの5′末端領域に由来し、開始コドン部分を含む短鎖RNA断片を用いて同様の解析を行った。その結果、いずれも翻訳阻害活性を持つこと、その活性は開始コドンへの変異導入で大きく低下することが明らかとなった。以上から、本解析系において、短鎖RNA断片がトランスに翻訳を阻害する活性には、予想外に開始コドン配列が重要な役割を果たすことが明らかとなった。
期刊论文(1)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
計算折り紙に基づくスモッキングのパターン生成
  • 批准号:
    21K12542
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额:
    $2.66万
  • 财政年份:
    2021
  • 负责人:
    吉田 哲也
  • 依托单位:
レクチン遺伝子プールを利用した広域ウイルス抵抗性植物開発の新戦略
  • 批准号:
    15J11177
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额:
    $2.18万
  • 财政年份:
    2015
  • 负责人:
    吉田 哲也
  • 依托单位:
最小記述長原理に基づきデータからの帰納学習を統合する知識獲得技術の研究
  • 批准号:
    18700131
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
  • 资助金额:
    $2.11万
  • 财政年份:
    2006
  • 负责人:
    吉田 哲也
  • 依托单位:
ラベル付き・ラベル無しデータを統合的活用する共学習システムの構築方法に関する研究
海外基金