オミクス解析を用いた口腔癌における歯周病原菌の役割の解明

使用组学分析阐明牙周病原体在口腔癌中的作用

• 批准号: 22K17202
• 负责人: 西山 今日子
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K17202/
• 关键词: 口腔癌; 歯周病原菌; 浸潤・転移; 癌微小環境; オミクス解析

口腔細菌感染である歯周病は口腔癌のリスク因子として挙げられ、歯周病原菌が原因の一つと考えられている。近年、TCGAデータを用いた網羅的な生体内分子解析(オミクス解析)によって生み出された大量のデータを、横断的に分析し生命現象を解明していくバイオインフォマティクスは急速に拡大・発展している。これまでに我々は、頭頸部癌における飢餓誘導遺伝子の予後への影響を次世代シークエンサーやTCGAデータを用いて解析を行ってきた。同様の方法で、今回我々は、頭頸部癌(HNSCC)への歯周病原菌が及ぼす影響を網羅的に解析し明らかにすることを目的とし研究を遂行した。その具体的な方法として、歯周病原菌P. gingivalis ATCC 33277またはF. nucleatum ATCC 25586（MOI:1）で口腔扁平上皮癌細胞株SASを処理し、RIsureを用いてRNAを抽出し次世代シークエンサーにて解析を行った。著明な発現変化を示す322遺伝子を抽出し、F. nucleatum感染細胞では120遺伝子の発現上昇と、202遺伝子の発現減少を認めた。また、P. gingivalis感染細胞では160遺伝子の発現上昇と、162遺伝子の発現減少を認めた。F. nucleatumもしくはP. gingivalis感染細胞で共通に著明な発現変化を示す遺伝子として31遺伝子（上昇）、48遺伝子（低下）を特定した。さらに、HNSCCのTCGAデータベースを用い、共通して変化を認めた遺伝子発現を調べたところ、CACYR、DHRS2、DLEU7、WISP1、AKAPS、C2orf88、KIAA1456、SLC47A1は、癌組織で正常組織と比較し発現に差を認めた。

Oral pathogenic bacteria cause oral cancer, and peripheral pathogenic bacteria cause oral cancer. In recent years, TCGA has been used to analyze a large number of biological phenomena. The effects of starvation on the development of head and neck cancer are analyzed in the next generation. In the same way, we are now conducting research on the impact of peripheral pathogens on head and neck cancer (HNSCC). The specific method of treatment is P. gingivalis ATCC 33277またはF. Nucleatum ATCC 25586 (MOI:1) was used to extract RNA from oral squamous cell carcinoma cell line SAS. 322. The development of new technologies and technologies in the field of science and technology. Nucleatum infected cells showed an increase in 120 genes and a decrease in 202 genes. P. gingivalis infected cells showed an increase in the expression of 160 genes and a decrease in the expression of 162 genes F. nucleatumもしくはP. Gingivalis infected cells are commonly identified as 31 genes (up) and 48 genes (down). In addition, HNSCC's TCGA profile is used, common changes are recognized, and gene development is regulated. CACYR, DHRS2, DLEU7, WISP1, AKAPS, C2orf88, KIAA1456, SLC47A1 are recognized in cancer tissues and normal tissues.

项目成果

Effect of oral bacteria on head and neck cancer cell lines and prognostic association.

口腔细菌对头颈癌细胞系的影响及其预后关联。

• 发表时间: 2022
• 作者: 西山今日子;稲葉裕明;濱田正和;吉田翔;松本(仲野)道代
• 通讯作者: 松本(仲野)道代

Prognostic association of starvation-induced genes in head and neck cancer

• DOI: 10.21203/rs.3.rs-420651/v1
• 发表时间: 2021-04
• 作者: Masakazu Hamada;Hiroaki Inaba;Kyoko Nishiyama;Sho Yoshida;Yura Yoshiaki;M. Matsumoto-Nakano;N. Uz