次世代シーケンサを活用した微生物検査室の分子疫学ネットワーク構築による耐性菌制御

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○研究目的 : 臨床上問題となる耐性菌の中には、世界規模での伝播が示唆されている世界流行系統の存在が明らかにされつつある。耐性大腸菌においてはST(sequence type)131-fimH30が注目されている。耐性菌の地域内伝播の制御には微生物検査室ネットワークが重要な役割を果たす可能性があるが、耐性菌の地域内伝播の実態は十分解明されていない。本研究では、秋田県の地域微生物検査室ネットワークAkita-ReNICSを活用し、ネットワーク内の二施設間の菌株を分子疫学的手法で比較することで、耐性菌の地域内伝播の実態を明らかにすることを目的として実施された。○研究方法 : (A)秋田大学医学部附属病院(秋田県秋田市)と(B)由利組合総合病院(秋田県由利本荘市)で臨床分離されたESBL(基質特異性拡張型βラクタマーゼ)産生大腸菌を対象として、fumC、fimHの両遺伝子の塩基配列解析による型決定およびESBL遺伝子の同定を行った。(A)は2017年4月から9月に分離された22菌株、(B)は2017年1月から2018年5月に分離された70菌株を対象とした。○研究成果 : fumC40(ST131と推定される型)-fimH30系統は(A)で12菌株(55%)、(B)で38菌株(54%)とほぼ同程度存在した。一方、この系統が保有するESBL遺伝子は、CTX-M-9群が(A)で10菌株(83%)、(B)で22菌株(58%)、CTX-M-1群が(A)で1菌株(8%)、(B)では13菌株(34%)と、傾向の相違がみられた。現在、両施設の菌株同士のドラフト全ゲノム解析の準備を進めており、ゲノムデータベース上の菌株情報との比較も含めた、解像度の高い系統解析による地域内の伝播経路の推定を計画している。