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マイクロサテライトＤＮＡマーカーを用いたシオミズツボワムシの遺伝的モニタリング

利用微卫星 DNA 标记对潮光轮虫进行遗传监测

基本信息

批准号：
26925023
负责人：
澤山英太郎
金额：
$ 0.32万
依托单位：
有限会社まる阿水産
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
财政年份：
2014
资助国家：
日本
起止时间：
2014-04-01 至 2015-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-26925023/
关键词：
シオミズツボワムシマイクロサテライトDNA クローン多様性

项目摘要

海産魚の種苗生産において初期餌料として用いられているシオミズツボワムシ(S型ワムシ)の個体数増減と遺伝的多様性についての関連を、マイクロサテライトDNAマーカーを用いたクローン解析により検討した。まず、クローン解析に必要なマイクロサテライトDNAマーカーの選定を行ったところ、4つのマイクロサテライトDNAマーカーを用いてクローン判別をすることで解析集団の全てのクローン型が特定でき、ミトコンドリアDNAのCOIハプロタイプとも一致することが分かった。次に、S型ワムシを1ヶ月間培養し、増殖良好時と培養不調時のワムシについて、ミトコンドリアDNA COI領域によるハプロタイプ解析とマイクロサテライトDNAマーカーによるクローン型解析を行った。ミトコンドリアDNA COI領域による株型判別の結果、全てのワムシはBrachionus plicatilis sp. “Cayman”と判別された。また、培養良好時には2～3種類のハプロタイプが混在していたが、培養不調時には1種類のハプロタイプのみが確認された。マイクロサテライトDNAによるクローン型解析を行ったところ、80個ものクローン型が識別された。また、培養良好時のワムシのクローン多様度は培養不調時と比べて高い傾向が見られた。以上の結果から、ワムシの培養が良好な時はワムシの遺伝的多様度が高いことが明らかとなり、ワムシの個体数増減に遺伝的要因が関与する可能性が示唆された。しかしながら、飼育環境が良好であることで隠蔽種も良好な増殖をし、その結果として遺伝的多様度が高まった可能性も否定できない。そのため、今後は本研究で見られた主要なクローン型を用い、単一クローンでの培養、ならびに複数クローンでの混合培養を行い、個体数の増減と遺伝的多様性の関係について実験的に解析していく必要がある。

Marine fish seedling production and initial bait use of S-shaped fish (S-type fish) are used to increase the number of fish. The polymorphism of the inheritance is related to the relationship between DNA and DNA, and the analysis method is based on the analysis method.まず、クローンanalysisになマイクロサテライトDNAマーカーの SelectionいてクローンDiscriminationをすることでanalytic set団の全てのクローンTYPE でき、ミトコンドリアDNAのCOIハプロタイプとも unanimous することが分かった. Sub-type, S-type ワムシを1 month culture し, when the proliferation is good and when the culture is not regulated, のワムシについて, ミトコンドリアDNA COI field によるハプロタイプanalytic とマイクロサテライトDNAマーカーによるクローン analytic を行った. The results of the identification of plant types in the field of DNA COI, and the identification of all types of Brachionus plicatilis sp. "Cayman".また, when the culture is good, it is 2~3 kinds of のハプロタイプが mixed in していたが, when the culture is not correct, 1 kind of のハプロタイプのみがconfirmation された.マイクロサテライトDNA によるクローン type analysis を行ったところ, 80 ものクローン type がidentification された. When it is well-bred, it has a tendency to be higher than when it is well-bred. The results of the above are the results of the training and the good training of the time. The main reason for the increase and decrease in the number of individuals of Ming and Naru, and the number of individuals is related to the possibility of the disease. The breeding environment is good, the breeding environment is good, the breeding environment is good, the breeding environment is good, and the breeding environment is good.し、そのRESULTS として伝The degree of possibility is high and できない is negated. This research will be carried out in the future It is necessary to analyze the relationship between the mixed culture and the increase and decrease of the number of individuals and the polymorphic relationship between them.