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転写アクチベーターの作用と転写開始複合体の機能解析

转录激活剂作用和转录起始复合物的功能分析

基本信息

批准号：
10780418
负责人：
田上英明
金额：
$ 1.22万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份：
1998
资助国家：
日本
起止时间：
1998 至 1999
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-10780418/
关键词：
CRP RNA Polyinerase 転写開始反応 UP element RNA polymerase

项目摘要

空間的相互作用に関する情報が蓄積している大腸菌の転写装置(RNAP)とその代表的な転写制御因子CRPをモデル系として、転写開始反応とCRPによる転写活性化機構について解析を行った。これまでにCRPの作用点が転写開始複合体形成の促進までに限定されることを証明した。即ち転写開始複合体形成が転写制御のキーポイントなのである。本研究では転写開始複合体形成に焦点を当て解析を進めたところ、malTプロモーターにおいてはCRP非存在下で転写開始点付近のDNA2本鎖は開裂するものの伸長反応に移行できない新規の不活型転写複合体が形成されることを見出した。malTプロモーターは-35領域から9bp離れた位置にA/Tに富む配列をもつ。このA/Tに富む配列の転写開始複合体形成への影響を解析した結果、この領域がUPエレメントとして機能すること及びそのコアプロモーターとの相対位置によって転写複合体の性質に影響することが明かとなった。UPエレメントの位置による転写開始複合体の性質の変化は他の数種のコアプロモーターにおいても観察され、この結論の一般性が示唆される。次にmalTプロモーターのCRP転写活性化に対するUPエレメントの影響について検討した結果、UPエレメントはCRP作用に必要であった。即ち、UPエレメントによってRNAPのDNA結合活性が促進され、CRPがpost-recruitment段階においてRNAPと相互作用することで不活型から活性型転写複合体への変換を促進することが示唆される。本研究において得られたCRP,RNAP,DNA各々の相互作用の関係についての新たな知見がより一般的な転写調節機構の理解に繋がることが期待される。

The spatial interaction related information is accumulated in the Escherichia coli writing device (RNAP), which is represented by the writing control factor CRP, the writing system, the writing start reaction CRP, the writing activation mechanism and the analysis. The CRP action point is defined as the promoter of complex formation. That is to say, the complex of writing begins to form. In this study, the focus of the formation of the writing initiation complex was analyzed, and the formation of the inactive writing complex was observed in the absence of CRP. malT The analysis of the effect of the A/T rich alignment on the formation of the write initiation complex shows that the domain has an effect on the properties of the write initiation complex. The properties of the complex were investigated in several different ways, and the results were generalized. The effect of CRP activation on the UP profile is discussed in detail. The UP profile is necessary for CRP activation. That is, the DNA binding activity of RNAP is promoted by CRP and post-recruitment stage, and the interaction between RNAP and CRP is promoted by inactive or active type DNA binding complex. In this study, new insights into the interactions among CRP,RNAP, and DNA were obtained, and general understanding of regulatory mechanisms was expected.