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イネのレトロエレメント、p-SINE1の発現制御の分子機構と、転移様式の研究

水稻逆转录因子p-SINE1表达调控及转移模式的分子机制研究

基本信息

批准号：
11740415
负责人：
土本卓
金额：
$ 1.34万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份：
1999
资助国家：
日本
起止时间：
1999 至 2000
项目状态：
已结题

项目摘要

1.イネにおけるp-SINE1分子種の解析イネ植物体の各組織、およびDNAメチル化阻害剤5-アザシチジン(5-azaC)や熱(42℃)処理をしたイネOc培養細胞、におけるレトロポゾンp-SINE1の転写産物を5'RACE法とprimer extension法を用いて解析した。その結果、(1)いずれの組織、細胞においてもp-SINE1配列の5'端付近で始まる転写産物と、5'端に10塩基対以上の様々な付加配列を持つものとが発現していること、(2)全転写産物に対する5'端付近で始まる転写産物の割合が、植物体の穂や5-azaC処理をした培養細胞で顕著に大きいこと、(3)5'端付近で始まる転写産物の多くが、p-SINE1の特定のサブファミリーから転写されたものであること、が明らかになった。2.p-SINE1配列の転写制御に関与するメチル化塩基の特定ゲノムDNAにおけるp-SINE1配列のメチル化されている塩基を、bisulfite genomic sequencing法で特定したところ、p-SINE1配列内のCGおよびCNG配列のシトシン残基が全てメチル化されていることが示唆された。3.p-SINE1のRNAポリメラーゼIII(polIII)によるin vitro転写系の確立タバコBY-2細胞核抽出液を用いたin vitro転写系によって、polIIIによるp-SINE1の転写産物と思われるRNAを検出することに成功した。4.p-SINE1配列に挿入していた新規転移因子の同定p-SINE1の解析の過程で、p-SINE1配列に挿入していた転移因子を発見し、それが、30塩基対を単位とする縦列型反復配列を含む、ユニークな構造を持つイネの新規転移因子であることを明らかにした。

1. Analysis of p-SINE1 molecular species from various tissues, tissues, and DNA of plants. 5-azaC and heat treatment (42℃) were used to analyze the production of p-SINE1 by 5'RACE and primer extension methods. The results are as follows: (1) the development of the 5'-end start of the p-SINE1 alignment in tissues and cells,(2) the development of the 5'-end start of the p-SINE1 alignment in cultured cells, and (3) the development of the 5'-end start of the p-SINE 1 alignment in cultured cells.(3) The 5'end is close to the beginning of the writing product, and the p-SINE1 is specific to the writing. 2.p-SINE-1 alignment and sequence control related to the specific DNA sequence of the p-SINE-1 alignment and bisulfite genomic sequencing method for the specific CG and CNG alignment residues in the p-SINE-1 alignment. 3. The RNA of p-SINE 1 was detected successfully in vitro culture system and in vitro culture system. 4.p-SINE1 alignment, new shift factors, and the analysis of p-SINE 1 alignment, new shift factors, and the analysis of p-SINE 1 alignment.