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遺伝子相補性試験によるクラミドモナスのチャンネル遺伝子の単離と解析

通过基因互补试验分离和分析衣藻通道基因

基本信息

批准号：
11740457
负责人：
吉村建二郎
金额：
$ 1.47万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份：
1999
资助国家：
日本
起止时间：
1999 至 2000
项目状态：
已结题

项目摘要

細胞の物質代謝にはいろいろな種類のトランスポーターが関与している。本研究では前年度の研究により得られたクラミドモナスのリン酸トランスポーターの遺伝子の解析を行った。カリウムトランスポーターのノックアウト大腸菌をレスキューする遺伝子として単利されてきたcDNAは部分配列であったので5'RAXCEにより全長を決定した。全体として625アミノ酸の分子量約67KDaの蛋白であった。この配列を元に遺伝子データベースを検索したところクラミドモナスのESTライブラリに約80%の相同性のある遺伝子が登録されていることが分かった。これが、使っているstrainの違いによるかどうかをRT-PCRにより検討したところ、現在我々が使っているstrainには両方の遺伝子があることが判明した。そこで、ESTに登録されている5'側の配列を元に3'RACEにより第2の遺伝子の全長(600アミノ酸)を決定した。これら2つの遺伝子はともにナトリウム駆動性のリン酸トランスポーターと相同性が高く、プロトン駆動性のリン酸トランスポーターとは相同性が低かった。一般に植物ではナトリウム駆動性のリン酸トランスポーターの存在を疑問視されていることから、原生生物で葉緑体があるクラミドモナスがナトリウム駆動性のリン酸トランスポーターを持っていることは進化を考える上で興味深い。今回同定できたリン酸トランスポーターの発現様式を調べたところ、リン酸欠乏培地にクラミドモナスを移すとmRNA量が約8時間後に約8倍に増えることが分かった。従って、機能的にも活性のあるリン酸トランスポーターであろうと推論できた。

The metabolism of cellular substances depends on the type of substances involved. This study was conducted on the basis of previous studies. The total length of E. coli is determined by the sequence of cDNA fragments. The total molecular weight of the 625-mer acid is about 67KDa. The alignment of these sequences is based on the similarity of approximately 80% of the sequences in the EST profile. We are now able to identify the gene in the strain. The total length of the second gene (600 amino acids) is determined by the 5'side of the EST entry. The similarity of the two groups is high, and the similarity of the two groups is low. In general, the existence of plants is questionable, and protoplasts are highly interesting. At the same time, the mRNA expression of the protein was increased by about 8 times after 8 days.従って、功能的にも活性のあるリン酸トランスポーターであろうと推论できた。