ダイズ塩誘導性遺伝子群の機能解析を通した塩ストレス応答性代謝・生合成系の解明
ダイズ塩誘導性遺伝子群の機能解析を通した塩ストレス応答性代謝・生合成系の解明
批准号:
12760004
负责人:
小島 俊雄
金额:
$1.22万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份:
2000
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2000 至 2001
中文摘要
100mM塩化ナトリウム水耕液によるストレス処理を72時間施したダイズのRNAに対して、未処理のダイズRNAを用いたAFLP-based mRNA fingerprinting法(cDNA・AFLP法)の比較分析によって、106種類の塩ストレス特異的増幅断片(G__-alycine m__-ax T__-ranscript-d__-erived f__-ragment、以下GmTDF)をクローニングした。各GmTDFクローンの塩基配列と既知遺伝子とのBLAST相同性検索の結果、クエン酸関連酵素、ヒートショックタンパク質やジャスモン酸誘導性タンパク質といったストレス誘導性タンパク質、転写制御やシグナル伝達に関与するタンパク質など、これまで植物の塩ストレス応答性遺伝子として報告された遺伝子産物と高い相同性を示すGmTDFクローンが多数存在していた。一方、配列未知、機能未知なESTと相同性を示すGmTDFクローンも全体の約40%を占めており、(1)植物には未だ明らかとなっていない塩ストレス応答メカニズムが存在すること、(2)cDNA-AFLP法がダイズの環境ストレス応答性機構を解析する有用な方法であることが明らかとなった。さらに未解明なダイズ塩ストレス応答性機構を明らかとするため、既知未知なESTクローンと相同牲を示した44クローンについて、ノーザン法およびリバースノーザン法によって転写応答性の強いGmTDFクローンを選抜した。ESTクローンの由来などを考慮して群細に分類した結果、マメ科由来のESTとのみ高い相同性を示し、ストレス処理由来の情報があるカテゴリーができ、5クローンがそこに分類された。このカテゴリーに属する遺伝子はマメ科独自に存在する塩ストレス応答性機構に関与すると予想される。現在、これらのクローンについて、全長cDNAの単離、トランスジェニック植物を用いた機能解析を進めている。
英文摘要
100mM塩化ナトリウム水耕液によるストレス処理を72時間施したダイズのRNAに対して、未処理のダイズRNAを用いたAFLP-based mRNA fingerprinting法(cDNA・AFLP法)の比較分析によって、106種類の塩ストレス特異的増幅断片(G__-alycine m__-ax T__-ranscript-d__-erived f__-ragment、以下GmTDF)をクローニングした。各GmTDFクローンの塩基配列と既知遺伝子とのBLAST相同性検索の結果、クエン酸関連酵素、ヒートショックタンパク質やジャスモン酸誘導性タンパク質といったストレス誘導性タンパク質、転写制御やシグナル伝達に関与するタンパク質など、これまで植物の塩ストレス応答性遺伝子として報告された遺伝子産物と高い相同性を示すGmTDFクローンが多数存在していた。一方、配列未知、機能未知なESTと相同性を示すGmTDFクローンも全体の約40%を占めており、(1)植物には未だ明らかとなっていない塩ストレス応答メカニズムが存在すること、(2)cDNA-AFLP法がダイズの環境ストレス応答性機構を解析する有用な方法であることが明らかとなった。さらに未解明なダイズ塩ストレス応答性機構を明らかとするため、既知未知なESTクローンと相同牲を示した44クローンについて、ノーザン法およびリバースノーザン法によって転写応答性の強いGmTDFクローンを選抜した。ESTクローンの由来などを考慮して群細に分類した結果、マメ科由来のESTとのみ高い相同性を示し、ストレス処理由来の情報があるカテゴリーができ、5クローンがそこに分類された。このカテゴリーに属する遺伝子はマメ科独自に存在する塩ストレス応答性機構に関与すると予想される。現在、これらのクローンについて、全長cDNAの単離、トランスジェニック植物を用いた機能解析を進めている。
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专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
酸性分泌型PR-5タンパク質の塩吸着性に関する分子生物学的研究
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批准号:23K05485
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2023
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负责人:小島 俊雄
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依托单位:
DNAマーカーを用いたコムギ染色体の構造解析と直接的有用遺伝子単離法への応用
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批准号:98J05353
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1998
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负责人:小島 俊雄
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依托单位:
海外基金