多検体insitu hybridizationを用いた浸潤先進部発現遺伝子の探索

使用多样本原位杂交寻找高级侵袭区域表达的基因

• 批准号: 12770103
• 负责人: 藤井 元
• 金额: $ 1.41万
• 依托单位: National Cancer Center Research Institute and Research Center for Innovative Oncology, National Cancer Center Hospital East
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 2001
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-12770103/
• 关键词: in situ hybridization; 多検体; 浸潤先進部; スクリーニング; ポストゲノム; 遺伝子発現; 腫瘍; in situ Hybridization

本研究はライブラリー中の独立クローンを鋳型にin situ hybridization(ISH)を用いたscreeningを行うことで、部域的に発現の差異が認められる遺伝子の探索を行い、浸潤・転移機構解明への寄与を図るものである。平成13年度は研究計画の下、以下の実験・開発を行い、下記の実績を得た。1)多検体ISHの開発平成12年度の研究により実現したマルチウェルプレートを用いたDigoxigeninラベルcRNAプローブ高速作成・精製法を利用して、多検体でISHを行えるシステム全体の開発を行った。年度前半はサンプルとしてマウス移腫瘍組織をマイクロスライサーによって準薄切し、その厚切り切片に対するsemi-whole mount ISHを、独自に開発した生体サンプル容器(特許出願済)を用いて行うシステムを利用した。年度後半はより多くのサンプルが利用可能な人体組織パラフィン包埋標本を用いて対応できるようガラス製の96-LowWellPlateを開発し、より高速・高効率にスクリーニングが行えるような改良を加えた。2)大腸がん腫瘍部にて特異的に発現が上昇する遺伝子の探索実際の人体腫瘍組織で特異的に発現している遺伝子を探索する目的で、ヒト大腸がんを用いて解析を行った。スクリーニング効率を高めるため腫瘍組織CDNAに対して正常組織CDNAでSubtractive Suppress ive Hybridizationを施し、濃縮をかけたライブラリーを用いてISHによるスクリーニングを行うことで、病理学的所見を伴って腫瘍特異的に発現する遺伝子を探索した。残念ながら先進部などで特異的な発現を示す遺伝子は今回の探索では見つけられなかったが、大腸がん腫瘍部に特異的な発現を示す遺伝子を多数単離できた。中でもRack-1遺伝子は従来考えられていた様に腫瘍内に豊富に有る血管内皮細胞やリンパ球に発現しているのではなく、腫瘍組織自体に発現していることが確認された。この発見はISHによってスクリーニングを行ったからこそ見いだされた知見であり、この様な手法による遺伝子探索の発展性と有用性を示す好例となった。

In this study, the differences in the occurrence of partial screening in situ hybridization(ISH) were identified, and the mechanism of infiltration and migration was explored to explain the mechanism of site hybridization. In 2013, the following achievements were recorded in the implementation of the research plan. 1)The development of multi-mode ISH has been carried out in the past 12 years. In the first half of the year, the tissue was transferred to the semi-whole mount, and the tissue was opened independently. In the second half of the year, the use of human tissue to embed the 96-LowWellPlate was developed, and the high speed and high efficiency were improved. 2)The specific gene expression in the large intestine tissue was detected and analyzed during the exploration of human tumor tissue. CDNA of tumor tissue is compared with CDNA of normal tissue. Subtractive Suppressor Hybridization is applied, concentrated and used in ISH. Pathological findings are associated with tumor specific development. The first part of the book is about the discovery of the first part of the book. The second part is about the discovery of the first part of the book. The third part is about the discovery of the first part of the book. In the middle of the tumor, there are abundant vascular endothelial cells in the tumor, and the tumor tissue itself appears in the tumor. The development and usefulness of this discovery are illustrated by the following examples:

项目成果

Yamamoto Y, Sakamoto M, Fujii G, Kanetaka K, Asaka M, Hirohashi S: "Cloning and characterization of a novel gene, DRH1, down-regulated in advanced human hepatocellular carcinoma."Clinical Cancer Research. 7(2). 297-303 (2001)

Yamamoto Y、Sakamoto M、Fujii G、Kanetaka K、Asaka M、Hirohashi S：“在晚期人类肝细胞癌中下调的新基因 DRH1 的克隆和表征。”临床癌症研究。

Saito A, Fujii G, Sato Y, Gotoh M, Toda G, Horohashi S: "Detection of genes expiessed in primary colon cancers by in situ hvbridization : RACK1 is overexpressed in colon cancers."Molecular Pathology (J. Clin. Pathol). 55(1). 34-39 (2002)

Saito A、Fujii G、Sato Y、Gotoh M、Toda G、Horohashi S：“通过原位杂交检测原发性结肠癌中表达的基因：RACK1 在结肠癌中过度表达。”分子病理学 (J. Clin. Pathol)。

Yamamoto Y,Sakamoto M,Fujii G,Kanetaka K,Asaka M,and Hirohashi S: "Cloning and characterization of a novel gene, DRH1, down-regulated in advanced human hepatocellular carcinoma."Clinical Cancer Research. (in press). (2001)

Yamamoto Y、Sakamoto M、Fujii G、Kanetaka K、Asaka M 和 Hirohashi S：“在晚期人类肝细胞癌中下调的新基因 DRH1 的克隆和表征。”临床癌症研究。