異質倍数性とミトコンドリアDNAヘテロプラズミー

异源多倍体和线粒体DNA异质性

• 批准号: 13876001
• 负责人: 中村 千春
• 金额: $ 1.41万
• 依托单位: Kobe University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 2002
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-13876001/
• 关键词: ミトコンドリアゲノム; ヘテロプラズミー; 父性伝達; nad3-orf156領域; エディティング; 転写後切断; NC座種; コムギ属; 異質倍数性; 核細胞質雑種; 父性遺伝; パンコムギ

1.ミトコンドリア(mt)ゲノムnad3-orf156領域のヘテロプラズミー解析:D, D2型プラズモンを持つ各種の核細胞質雑種(NC雑種)とその両親を用いてnad3-orf156領域をPCR増幅し、クローンニングした産物の塩基配列を決定し、父親配列を含むヘテロな配列群の存在を明らかにした。ランダムクローンを種類分けし、NC雑種と両親における各配列の相対頻度を測定した。この領域では、複数の母親および父親配列NC雑種に存在し、両親にもヘテロな分子種が存在した。さらに、Dゲノム種を父親として成立したパンコムギにDプラズモンと同一配列が存在することを明らかにした(Genetics 160,2002;Genes Genet. Systems 77,2002)。2.各種NC雑種および合成パンコムギにおけるnad3-orf156領域のヘテロプラズミー解析:種々のプラズモンを持つNC雑種を対象にnad3-orf156領域を解析し、ヘテロプラズミー現象の一般性を明らかにした。合成パンコムギを用いて、父親型Dプラズモンと同一配列が共通に存在すること、Dプラズモン配列と母親Bプラズモン配列の組換え配列が存在することを明らかにした(Curr. Genet.、投稿予定)。3.nad3-orf156領域の転写産物と転写後修飾の解析:15mt遺伝子の発現をNC雑種とその両親で解析し、nad3-orf156領域にのみ転写産物のサイズの違いを認めた。orf156(atp8)遺伝子について、種々の組織における転写産物を解析し、ヘテロプラズミックな配列が存在するにも関わらず母親由来配列のみが転写されること、エディティングが核ゲノム支配であることを明らかにし、さらにprimer extension分析で転写産物の転写後切断が核支配であること、およびNC雑種に特異的な切断が見られることを明らかにした(Plant Mol. Biol.,in press)。4.nad3-orf156領域における組換え型配列の検出:NC雑種と両親で、nad3-orf156領域内のcoxII偽遺伝子と、これと異なる部位に存在するCoxII領域との間の組換えで生じたと考えられる配列の存在を明らかにした(Genes Genet. Systems投稿予定)。

1. Youdaoplaceholder0 トコ ドリア(mt)ゲノムnad3-orf156 field ヘテロプラズ ヘテロプラズ トコ トコ explanation :D D2 type プ ラ ズ モ ン を with various の つ nuclear cytoplasm 雑 (NC 雑) と そ の struck を affinity with い て nad3 を PCR - orf156 field raised し, ク ロ ー ン ニ ン グ し た product の salt base with column を decided し, father match column を containing む ヘ テ ロ な match column group of の exist を bright ら か に し た. ラ ン ダ ム ク ロ ー ン を kinds points け し, NC 雑 と struck close に お け る each match column の phase frequency を seaborne し た. The <s:1> <s:1> domain で た, the plural <s:1> mother および father collocation NC雑 species に exist <s:1>, and the two relatives に ヘテロな ヘテロな molecular species が exist た た. さ ら に, D ゲ ノ ム kind を father と し て established し た パ ン コ ム ギ に D プ ラ ズ モ ン と exist the same match column が す る こ と を Ming ら か に し た (Genetics 2; 160200 Genes Genet. Systems, 77200 (2). 2. All kinds of NC 雑 kind お よ び synthetic パ ン コ ム ギ に お け る nad3 - orf156 field の ヘ テ ロ プ ラ ズ ミ ー analytic: kind of 々 の プ ラ ズ モ ン を with つ NC 雑 を like に seaborne nad3 - を orf156 field analytical し, ヘ テ ロ プ ラ ズ ミ ー phenomenon の general を Ming ら か に し た. Synthetic パ ン コ ム ギ を with い て, father type D プ ラ ズ モ ン と same with common column が に exist す る こ と, D プ ラ ズ モ ン と mother with column B プ ラ ズ モ ン match column の groups exist in え match column が す る こ と を Ming ら か に し た (Curr. Genet., contribute to decide). 3. の nad3 - orf156 field product planning write と planning modification after writing の analytic: 15 mt heritage 伝 son の 発 now を NC 雑 kind と そ の struck close で parsing し, nad3 - orf156 に の み product planning write の サ イ ズ の violations い を recognize め た. Orf156 (atp8) posthumous son 伝 に つ い て, kind of 々 の organization に お け る analytical し, product planning to write を ヘ テ ロ プ ラ ズ ミ ッ ク な match column が exist す る に も masato わ ら ず mother origin with column の み が planning write さ れ る こ と, エ デ ィ テ ィ ン グ が nuclear ゲ ノ ム dominate で あ る こ と を Ming ら か に し, さ ら に primer The extension analysis で product planning write の planning to write after cut off が nuclear dominate で あ る こ と, お よ び 雑 に specific kinds of NC な cut が see ら れ る こ と を Ming ら か に し た (Plant Mol. Biol., in press). 4. Nad3 - orf156 field に お け る group in え type match column の 検 : NC 雑 kind と struck close で, nad3 orf156 field の coxII pseudo heritage 伝 と, こ れ と different な に る parts exist す る coxII field と の の between groups in え で raw じ た と exam え ら れ る match column の exist を Ming ら か に し た (Genes Genet. Systems submitted for approval.

项目成果

Kitagawa K et al.: "Selective transcription and post-transcriptional processing of the heteroplasmic mitochondrial orf156 copies in the nucleus-cytoplasm hybrids of wheat"Plant Molecular Biology. (in press). (2003)

Kitakawa K等人：“小麦核-细胞质杂种中异质线粒体orf156拷贝的选择性转录和转录后加工”植物分子生物学。

Hattori N et al.: "Mitochondrial DNA heteroplasmy in wheat, Aegilops and their nucleus-cytoplasm hybrids"Genetics. 160. 1619-1630 (2002)

Hattori N 等人：“小麦、山羊草及其核-细胞质杂种中的线粒体 DNA 异质性”遗传学。

Hattori N. et al.: "Mitochondrial DNA heteroplasmy in wheat, Aegilops and their nucleus-cytoplasm hybrids"Genetics. (in press). (2002)

Hattori N. 等人：“小麦、山羊草及其核-细胞质杂种中的线粒体 DNA 异质性”遗传学。