ラン藻の環境ストレス応答性遺伝子の発現制御領域の網羅的解析

蓝藻环境胁迫响应基因表达控制区的综合分析

• 批准号: 14654169
• 负责人: 鈴木 石根
• 金额: $ 2.24万
• 依托单位: Okazaki National Research Institutes
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2002 至 2003
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14654169/
• 关键词: リン酸欠乏; 二成分情報伝達系; DNAマイクロアレイ; 高塩濃度ストレス; ヒスチジンキナーゼ; レスポンスレギュレーター; 転写開始点; ラン藻; 環境ストレス; 遺伝子発現; レスポンス・レギュレーター; シス配列; シグナル伝達

本研究の目的は、ラン藻のストレス応答性遺伝子の転写開始点を決定し、その上流配列の比較から発現様式に対応したプロモーター構造および転写調節領域を推定することであった。1.本年度、リン酸欠乏に応答して発現量が顕著に増加する遺伝子群について、それら遺伝子の上流の配列から共通配列を見いだした。また、我々はリン酸欠乏時にそれら遺伝子群の発現を制御する二成分情報伝達系(SphS-SphR)を同定し、転写調節因子であるSphRが、リン酸欠乏応答性遺伝子に保存された上流配列に試験管内で特異的に結合することを示した。2.我々はこれまでにラン藻Synechocystis sp. PCC 6803のゲノムに存在する43種のヒスチジンキナーゼの変異株ライブラリーを作製している。これらのヒスチジンキナーゼ変異株での、高塩濃度条件における遺伝子発現をDNAマイクロアレイを用いてスクリーニングし、高塩濃度条件で機能する4種のヒスチジンキナーゼを同定した。このうち2つのヒスチジンキナーゼについては、下流で働くレスポンスレギュレーターも見いだしている。これらの情報を基に高塩濃度に応答するヒスチジンキナーゼにより制御を受ける遺伝子群の転写開始点を決定し、それぞれの遺伝子群に共通な配列を見つけ出し、転写因子との相互作用を解析する候補を確立したと考えている。今後はさらに多数の遺伝子の転写開始点を同定し、解析の範囲を広げていくことが、生物の環境適応の機構を理解する上で重要であると思われる。

The purpose of this study is to determine the starting point of the study, and to determine the upper-class ranking ratio. Compared with から発様style に対応したプロモーターstructure および転write the adjustment field をESTIMATE することであった. 1. This year, the lack of リン acid deficiency and the remaining amount are the same Group に つ い て, そ れ ら 伝子 の 上流 の ordinate arrangement か ら common arrangement を 见 い だ し た.また、我々はリン无码的时にそれら伝子群の発appearをcontrolするtwo-component information伝达组(SphS-SphR)を同定し、転WRits Regulatory factors such as SphR and リン acid lack of responsiveness are preserved in the upstream arrangement and the specific binding in the test tube is shown in the test. 2. Synechocystis sp. PCC 6803 のゲノムに 43 kinds of のヒスチジンキナーゼの変different strains of していを.これらのヒスチジンキナーゼ変different strains of での, high chlorine concentration conditions における伝子発 appear をDNA マイクロアThere are 4 kinds of のヒスチジンキナーゼを same set of いてスクニングし and high chlorine concentration condition and functional する. obsceneで卍くレスポンスレギュレーターも见いだしている.これらのInformationをbaseに高塩 densityに応answerするヒスチジンキナーゼによりcontrolをReceivedける伝子群の転write starting pointをdetermineし, The それぞれの缝subgroup has a common arrangement and a set of factors, and the factor has interacted and analyzed and the candidate has been established.はさらにMost of the remaining 伝子の転starting point of writing を同定し、ANALYSISの法囲を広げていIt is important to understand the environment and the organization of the biological environment and adapt it to the environment.

项目成果

Ferjani A, Mustardy L, Sulpice R, Marin K, Suzuki I, Hagemann M, Murata N.: "Glucosylglycerol, a compatible solute, sustains cell division under salt stress."Plant Physiol.. 131(4). 1628-1637 (2003)

Ferjani A、Mustardy L、Sulpice R、Marin K、Suzuki I、Hagemann M、Murata N.：“葡萄糖基甘油是一种相容性溶质，在盐胁迫下维持细胞分裂。”植物生理学.. 131(4)。

Simon WJ, Hall JJ, Suzuki I, Murata N, Slabas AR: "Proteomic study of the soluble proteins from the unicellular cyanobacterium Synechocystis sp. PCC6803 using automated matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight peptide mass fingerprinting

Simon WJ、Hall JJ、Suzuki I、Murata N、Slabas AR：“使用自动基质辅助激光解吸/电离飞行时间肽质量指纹分析对单细胞蓝藻集胞藻属 PCC6803 可溶性蛋白质进行蛋白质组学研究

Marin K, Suzuki I, Yamaguchi K, Ribbeck K, Yamamoto H, Kanesaki Y, Hagemann M, Murata N.: "Identification of histidine kinases that act as sensors in the perception of salt stress in Synechocystis sp. PCC 6803."Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.. 100(15). 9061-906

Marin K、Suzuki I、Yamaguchi K、Ribbeck K、Yamamoto H、Kanesaki Y、Hagemann M、Murata N.：“鉴定集胞藻 PCC 6803 中作为盐胁迫感知传感器的组氨酸激酶。”Proc。

Kanesaki Y, Suzuki I, Allakhverdiev SI, Mikami K, Murata N: "Salt stress and hyperosmotic stress regulate the expression of different sets of genes in Synechocystis sp. PCC 6803"Biochem. Biophys. Res. Commun.. 290(1). 339-348 (2002)

Kanesaki Y、Suzuki I、Allakhverdiev SI、Mikami K、Murata N：“盐胁迫和高渗胁迫调节集胞藻 PCC 6803 中不同基因组的表达”Biochem。

Mikami K, Kanesaki Y, Suzuki I, Murata N: "The histidine kinase Hik33 perceives osmotic stress and cold stress in Synechocystis sp PCC 6803"Mol. Microbiol.. 46(4). 905-915 (2002)

Mikami K、Kanesaki Y、Suzuki I、Murata N：“组氨酸激酶 Hik33 感知集胞藻 PCC 6803 中的渗透应激和冷应激”Mol。