ラン藻の環境ストレス応答のトランスクリプトーム・プロテオーム解析

蓝藻环境胁迫反应的转录组和蛋白质组分析

• 批准号: 14014257
• 负责人: 鈴木 石根
• 金额: $ 3.84万
• 依托单位: Okazaki National Research Institutes
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2002 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14014257/
• 关键词: Synechocystis; DNAマイクロアレイ; 環境ストレスセンサー; ヒスチジンキナーゼ; レスポンスレギュレーター; マルチ・チャンネル・センサー; 低温センサー; 塩ストレスセンサー

本研究は、ラン藻Synechocystis sp. PCC 6803を用いて低温などのストレスへの適応過程を、野生株と環境ストレスセンサーの変異株で比較し、センサー分子の機能を解明することを目的としている。本年度においては以下のような進展がみられた。1.塩ストレスセンサーの同定ヒスチジンキナーゼのノックアウト・ライブラリーのDNAマイクロアレイによるスクリーニングにより、4種のヒスチジンキナーゼ(Hik33,Hik34,Hik16)が塩ストレスによる遺伝子発現の誘導に関わっていることを明らかにした。2.マルチ・チャンネル・センサーの機能発現機構の解析これまでの遺伝子破壊株とDNAマイクロアレイを用いた解析により、Hik33は低温、浸透圧、塩、酸化ストレス、強光など異なるストレスに応答し、異なった種々の遺伝子群の発現を制御するマルチ・チャンネル・センサーであることが示された。センサータンパク質と相互作用する因子の破壊株、過剰発現株を作製し、その影響を解析している。3.レスポンス・レギュレーターのノックアウト・ライブラリーの作製の40個のレスポンスレギュレーターの破壊株を作製した。既知の低温センサー、塩ストレスセンサーの下位で機能するレスポンス・レギュレーターを同定した。4.低温誘導性タンパク質群の網羅的解析プロテオーム解析によりSynechocystisのタンパク質の2-Dゲル・マップを作製した。低温誘導性タンパク質群の解析をICAT法により行っている。

The aim of this study was to investigate the role of Synechocystis sp. PCC 6803 in the regulation of temperature, temperature, and molecular functions of the plant by comparing wild and environmental strains. This year, the following progress has been made. 1. The same fixed number of different types of DNA in different types of media (Hik33,Hik34,Hik16) is related to the induction of gene expression. 2. The analysis of the functional development mechanism of Hik33 is based on the analysis of the low temperature, saturation pressure, acidity and strong light. The analysis of the influence of the factors of the interaction between the two substances on the growth and development of the plant 3. The production of 40 kinds of products It is known that the low temperature service and the low temperature service are the same. 4. The analysis of the low temperature induced protein cluster and the control of the 2-D protein cluster of Synechocystis Analysis of low temperature-induced plasmas by ICAT method

项目成果

Simon WJ, Hall JJ, Suzuki I, Murata N, Slabas AR: "Proteomic study of the soluble proteins from the unicellular cyanobacerium Synechocystis sp. PCC6803 using automated matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight peptide mass fingerprinting"

Simon WJ、Hall JJ、Suzuki I、Murata N、Slabas AR：“使用自动基质辅助激光解吸/电离飞行时间肽质量指纹分析对单细胞蓝细菌集胞藻 PCC6803 可溶性蛋白质进行蛋白质组学研究”

Kanesaki Y, Suzuki I, Allakhverdiev SI, Mikami K, Murata N: "Salt stress and hyperosmotic stress regulate the expression of different sets of genes in Synechocystis sp. PCC 6803"Biochem. Biophys. Res. Commun.. 290(1). 339-348 (2002)

Kanesaki Y、Suzuki I、Allakhverdiev SI、Mikami K、Murata N：“盐胁迫和高渗胁迫调节集胞藻 PCC 6803 中不同基因组的表达”Biochem。

Mikami K, Kanesaki Y, Suzuki I, Murata N: "The histidine kinase Hik33 perceives osmotic stress and cold stress in Synechocystis sp PCC 6803"Mol. Microbiol.. 46(4). 905-915 (2002)

Mikami K、Kanesaki Y、Suzuki I、Murata N：“组氨酸激酶 Hik33 感知集胞藻 PCC 6803 中的渗透应激和冷应激”Mol。

Yamaguchi K, Suzuki I, Yamamoto H, Lyukevich A, Bodrova I, Los DA, Piven I, Zinchenko V, Kanehisa M, Murata N: "A two-component Mn2+-sensing system negatively regulates expression of the mntCAB operon in Synechocystis"Plant Cell. 14(11). 2901-2913 (2002)

Yamaguchi K、Suzuki I、Yamamoto H、Lyukevich A、Bodrova I、Los DA、Piven I、Zinchenko V、Kanehisa M、Murata N：“双组分 Mn2 传感系统负调节集胞藻中 mntCAB 操纵子的表达”植物