膜タンパク質二次元結晶の電気的特性とその成長過程の長時間追跡法の開発
二维膜蛋白晶体电学特性及其生长过程长期跟踪方法的研究进展
基本信息
- 批准号:15657033
- 负责人:
- 金额:$ 2.11万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
- 财政年份:2003
- 资助国家:日本
- 起止时间:2003 至 2004
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
膜タンパク質KcsAチャネルの基板への配向固定を目指し、システイン残基導入変異体を多数(20数種類)作成した。KcsAチャネルは立体構造が既知だがそれは膜寛通部位に限られており、大きな細胞内ドメインの構造は明らかではない。そこで導入したシステイン残基が表面に露出し、しかも基板固定に寄与できるかということを明らかにするために新しい方法を開発した。システィン残基の金との反応性を利用し、SPR(表面プラズモン共鳴)法により結合の有無や結合様式を検討した結果、表面露出残基のパターンが明らかになり、立体構造に関する情報が得られた。金表面への反応性のもっとも高い変異体を使い、ガラス基板の上への配向性結合を行った。数時間以上の反応時間で反応が進行することが明らかになった。これを原子間力顕微鏡で観察すると、配向蛋白が均一な高さ分布を示し島状となった。ただし全表面を均一に被うことはできなかった。さらに結合したタンパクの他方から金結晶で標識し、X線による回折点からその運動性を捉えることができた。KcsAチャネル分子の全長での結晶化を目指し、2次元結晶の作成を行った。様々な結晶化条件をさぐる試行錯誤ののち、電子顕微鏡で結晶化を確認することができた。さらなる結晶成長を起こすための条件を検討する必要がある。この標品を気液界面に展開し、脂質平面膜法の一種であるtip-dip法で電流記録を試みたが、高密度であるため測定が極めて困難であった。一方、KcsAチャネルを脂質平面膜に大量再構成するために、電気的記録を行いつつ再構成を行った。この方法ではすべての再構成チャネルが同一のオリエンテーションで挿入されることが明らかになった。高密度再構成に向けて様々な条件での実験を進行中である。
The alignment fixation of the film's gelatinous KcsA substrate is directly indicated, and the introduction of sistenin residues is performed in a large number (more than 20 types). KcsA has a three-dimensional structure. It is known that the structure of KcsA cells is different from that of KcsA cells. A new method of introducing the residues into the substrate is developed. The results of the SPR(Surface Resonance) method, the analysis of the binding and non-binding formulas, the analysis of the surface exposed residues, and the information on the stereo structure were obtained. The surface of the gold surface is characterized by the high degree of anisotropy, and the high degree of alignment of the substrate is characterized by the high degree of anisotropy. A few minutes later, the camera was opened. The alignment protein was observed by atomic force microscopy and showed a uniform distribution in islands. The whole surface is uniform. In addition, the combination of gold crystals, X-ray reflection points, and movement points are also included. Crystallization of KcsA molecules in the whole length of the eye, the formation of two-dimensional crystals Crystallization conditions were determined by electron microscopy. It is necessary to discuss the conditions for crystal growth. The standard liquid interface development, lipid plane membrane method, current recording, high density, measurement, extremely difficult A party, KcsA This method is to reconstruct the structure of the system and to create the same system. The conditions for high density recombination are in progress.
项目成果
期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Anionic contribution for fibrous maturation of proto-fibrillar assemblies of human tau repeat domain in a fluoroalcohol solution
氟醇溶液中阴离子对人 tau 重复结构域原纤维组件纤维成熟的贡献
- DOI:
- 发表时间:2004
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Konno;T.;S.Oiki;K.Hasegawa;H.Naiki
- 通讯作者:H.Naiki
Paradoxical inhibition of protein aggregation and precipitation by transglutaminase-catalyzed intermolecular cross-linking
转谷氨酰胺酶催化的分子间交联对蛋白质聚集和沉淀的反常抑制
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Konno;T.;T.Morii;H.Shimizu;S.Oiki;K.Ikura
- 通讯作者:K.Ikura
Futaki, S., Zhang, Y., Kiwada, T., Yagami, T., Oiki, S., Sugiura, Y.: "Gramicidin-based Channel Systems for the Detection of Protein-ligand Interaction."Bioorg.Med.Chem.. 12. 1343-1350 (2004)
Futaki, S.、Zhang, Y.、Kiwada, T.、Yagami, T.、Oiki, S.、Sugiura, Y.:“用于检测蛋白质-配体相互作用的短杆菌肽通道系统。”Bioorg.Med。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Berthomieu, P., Nublat, A., Brackenbury, W.J., Lambert, C., Savio, C., Uozumi, N., Oiki, S.: "Functional analysis of AtHKT1 in Arabidopsis shows that Na^+ recirculation by the phloem is crucial for salt tolerance."EMBO J. 22. 2004-2014 (2003)
Berthomieu, P.、Nublat, A.、Brackenbury, W.J.、Lambert, C.、Savio, C.、Uozumi, N.、Oiki, S.:“拟南芥中 AtHKT1 的功能分析表明韧皮部的 Na^ 再循环是
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老木 成稔其他文献
原子間力顕微鏡による生体膜研究へのアプローチ
使用原子力显微镜研究生物膜的方法
- DOI:
- 发表时间:
2014 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
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- DOI:
- 发表时间:
2013 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
角野歩;炭竈 享司;岩本 真幸;出羽 毅久;老木 成稔 - 通讯作者:
老木 成稔
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- 发表时间:
2014 - 期刊:
- 影响因子:0
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角野 歩;山本 大輔;岩本 真幸;出羽 毅久;老木 成稔 - 通讯作者:
老木 成稔
Entrance of Channel Determines Ion Permeation Rate through the Kv1.2 Channel
通道入口决定通过 Kv1.2 通道的离子渗透率
- DOI:
10.2142/biophys.58.012 - 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
炭竈 享司;老木 成稔 - 通讯作者:
老木 成稔
膜タンパク質を配向制御してマイカ基板上の固定化平面膜に再構成する簡便な手法
一种控制膜蛋白方向并将其重构为云母基底上固定化平面膜的简单方法
- DOI:
- 发表时间:
2017 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
角野 歩;内橋 貴之;老木 成稔 - 通讯作者:
老木 成稔
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Channel regulating mechanisms of lipid bilayers via chemical-physical transduction
通过化学-物理转导的脂质双层的通道调节机制
- 批准号:
20H00497 - 财政年份:2020
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$ 2.11万 - 项目类别:
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寻找研究蛋白质结构变化动力学的单分子科学基础
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イオンチャネル透過路の立体構造:チャネルと非荷電分子の相互作用による解析
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ラット脳ナトリウムチャネルの人工膜への再構成と高精度単一チャネル記録
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- 资助金额:
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