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in silicoアプローチをもとにしたチャンネル活性化極性を決める構造の同定

基于计算机方法识别确定通道激活极性的结构

基本信息

批准号：
11877006
负责人：
老木成稔
金额：
$ 1.09万
依托单位：
福井医科大学
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
1999
资助国家：
日本
起止时间：
1999 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-11877006/
关键词：
過分極活性化チャネル KATI 電位センサーモチーフ検索キネティクス

项目摘要

電位依存性Kチャネルの電位センサーであると考えられている第4膜貫通領域S4は独特のモチーフ構造を持つ。このモチーフをデータベース検索し、過分極活性化チャネルの間での配列を比較検討した。過分極活性化チャネルのうちKATではS4近傍に正電荷残基は最低9個あるがその周期性に乱れがある。このうちどの残基が電位依存性に効果があるか、現在点変異による実験を進めている。最近あらたにクローニングされた過分極活性化チャネルであるHACチャネルに注目すると、S4領域は6種類のHACチャネルにおいて44残基にもわたってほとんど同一であるという驚異的な相同性が認められた。3残基に1個という正電荷残基が10個も並ぶ特異な構造であった。この場合にも、どの残基が電位依存性に効果があるか今後検討したい。S4近傍配列について過分極活性化チャネル(KATとHAC)と脱分極活性化チャネルの多重配列を試みた。過分極活性化チャネルではKATよりもHACの方が脱分極活性化型に相同性が高かった。以上の解析の結果、KATの配列上の特殊性が明快になった。電位依存性は必ずしもS4のみに書かれていない可能性があるので、今後他の領域に対する配列解析も行なっていきたい。従来、KATのチャネルキネティクスに対する研究はほとんどされてこなかったが、最近私達は電気生理学的な実験結果をもとにKATチャネルのキネティクスに対する新しいモデルを得た。活性化過程における状態間遷移がShaker型Kチャネルと質的に異なる。このモデルをもとにS4に対する点変異の実験結果を解析したい。

The fourth membrane penetration region S4 has a unique structure. The digital scene of this mouse is explored and the occasional arrangement of ultra-active mice is compared. The minimum number of positively charged residues near S4 is 9. The potential dependence of the residues in the protein is different from that in the protein. Recently, the HAC was activated in the S4 domain, and the identity of the HAC was recognized in the S4 domain. 3 residues, 1 positively charged residue, 10 residues and a special structure. In this case, the residues are potential dependent. S4 Near-alignment test for KAT and HAC The method of depolarization is highly similar to that of KAT and HAC. The results of the above analysis, the particularity of KAT's arrangement are very clear. Potential dependence is the result of potential analysis in the following fields: The results of recent studies on KAT's biological activity have been reported. The activation process involves the inter-state transfer of Shaker type K particles. The result of this analysis is different.