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大腸菌細胞間相互作用をとおしてみた生命体情報ネットワーク

通过大肠杆菌细胞间相互作用看到的生命体信息网络

基本信息

批准号：
16650063
负责人：
清水浩
金额：
$ 2.24万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2005
项目状态：
已结题

项目摘要

細胞内には遺伝子、タンパク質、代謝といった多階層のネットワークが存在し、それらの階層間の関係が複雑に絡み合っている。さらに環境と細胞間の相互作用を通じて、上位の階層である細胞集団においても細胞間の相互作用ネットワークが形成される。本研究では、生物ネットワークの解析を行うことにより、そこでの情報のやりとりを明らかにしていくことを目的とした。大腸菌としてグルタミン合成酵素遺伝子を欠損させた宿主にグルタミン合成酵素・GFP融合遺伝子をプラスミドで組み込んだ大腸菌を創製し、細胞の内部状態を可視化した。最小培地を使用し、グルタミン酸を単一窒素源とすることで連続培養系において、供給グルタミン酸濃度を変化させ、環境変化を与えた。このグルタミン合成酵素・GFP融合遺伝子は通常自然界の大腸菌が有する窒素源の量に応答して発現が制御されるようなプロモータではなく、構成的に発現するプロモータにより発現させた。つまり、遺伝子の発現と環境における遺伝子発現の必要性を断ち切ったシステムを用いた。連続培養系で、一定のグルタミン酸濃度の培地を供給し、定常状態を保った後、供給するグルタミン酸濃度を、5mM、1mM、0.1mMのように段階的に変化させ、環境中の細胞に対してグルタミン酸や変換されるグルタミンの量が枯渇した条件を設定した。また、逆に、栄養源を過剰供給し、環境変動が遺伝子発現にどのような影響を与えるのか解析した。その際フローサイトメトリーにより、発現量分布の大きさやその変化が環境の変化とどのように対応するかについて検討した。遺伝子の発現と環境における遺伝子発現の必要性を断ち切ったシステムを用いたにもかかわらず、遺伝子の発現量は、環境変動に対応してその必要性に応じて変化することが明らかとなった。環境を通した細胞間の相互作用や遺伝子発現の揺らぎがこのような現象を引き起こす原因として考えられた。

The presence of intra-cell, inter-cell, multi-cell, multi-cell, inter-cell, and so on. The interaction between cells in the environment is common, and that in the upper cell set is different from that in the host cell. In this study, the purpose of this study is to analyze the results of the analysis of the information of the patients in this study. The biosynthetic enzyme of the fungus was not expressed in the host cell. The GFP fusion enzyme was fused in the host cell. The fusion enzyme was used in the host cell. The minimum environmental protection system is used, and the source of energy is used to make sure that the system is used in the system, and that it is supplied to the environment and the environment. In the natural world, asphyxiating bacteria have the source of asphyxiating hormone. In general, the synthetic enzyme GFP fusion has a large amount of asphyxiate. It is necessary to realize that it is necessary to realize the need for environmental protection in the environment. The system is connected to the system, and it is necessary to make sure that the temperature is supplied to the temperature, after the steady state, to the temperature, 5mM, 1mM, and 0.1mM, and to the temperature in the environment. In the environment, the temperature is low and the temperature is low. Pollution, adversity, environmental pollution, environmental impact, environmental protection, environmental protection and environmental protection. We need to know how to improve the quality of the environment, such as environmental protection, environmental protection, and environmental protection. In order to realize the need for the environment, it is necessary to realize the need for the use of environmental protection and environmental protection. Environmental communication, intercellular interaction, environmental protection, environmental communication, intercellular interaction, environmental interaction, environmental interaction,