微細藻類の変動光に対する光化学系と代謝のシステム解析
微細藻類の変動光に対する光化学系と代謝のシステム解析
批准号:
21K19825
负责人:
清水 浩
金额:
$4.16万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-07-09 至 2024-03-31
中文摘要
シアノバクテリアSynechocystis PCC 6803は光エネルギーを利用してCO2から直接有用物質を生産できるため理想的な細胞工場として、その工学利用が期待されている。しかし、変動光下では、連続光下と異なり成育の大きさが変化することが知られている。光合成生物では変動光下において高速に変化する光エネルギー供給と低速で変化するエネルギー利用のシステムが連結して安定に動作するシステムとしての仕組みが備わっていると考えられる。本研究では、異なる応答の速さが連結した光合成微生物の仕組みを明らかにすることで、様々な時間オーダーで動作するサブシステムを包含するシステムの動作原理を明らかにすることを目的とした。本研究においては、Synechocystis PCC 6803を用いて、変動光下で培養を行うコンピューター制御システムを開発している。LEDの光強度を様々な時間間隔で変動させるコンピューター制御光培養装置を開発っている。変動光や一定強度の定常光で培養し、基本的な増殖特性を得ている。また、定常状態や非定常状態を表現する数理モデルを開発することで、様々な光強度において複雑な光化学系の電子伝達経路がどのように電子を流し、NADPHやATPを生成するのか、代謝状態がどのように変化するのかについてシミュレーションを行う準備を行っている。さらに、定常光と振動光でどのような代謝状態を取るかを実験的に確認するため、光混合栄養条件において代謝状態を決定する13C代謝フラックス解析を行うプラットフォームを開発している。
英文摘要
シアノバクテリアSynechocystis PCC 6803は光エネルギーを利用してCO2から直接有用物質を生産できるため理想的な細胞工場として、その工学利用が期待されている。しかし、変動光下では、連続光下と異なり成育の大きさが変化することが知られている。光合成生物では変動光下において高速に変化する光エネルギー供給と低速で変化するエネルギー利用のシステムが連結して安定に動作するシステムとしての仕組みが備わっていると考えられる。本研究では、異なる応答の速さが連結した光合成微生物の仕組みを明らかにすることで、様々な時間オーダーで動作するサブシステムを包含するシステムの動作原理を明らかにすることを目的とした。本研究においては、Synechocystis PCC 6803を用いて、変動光下で培養を行うコンピューター制御システムを開発している。LEDの光強度を様々な時間間隔で変動させるコンピューター制御光培養装置を開発っている。変動光や一定強度の定常光で培養し、基本的な増殖特性を得ている。また、定常状態や非定常状態を表現する数理モデルを開発することで、様々な光強度において複雑な光化学系の電子伝達経路がどのように電子を流し、NADPHやATPを生成するのか、代謝状態がどのように変化するのかについてシミュレーションを行う準備を行っている。さらに、定常光と振動光でどのような代謝状態を取るかを実験的に確認するため、光混合栄養条件において代謝状態を決定する13C代謝フラックス解析を行うプラットフォームを開発している。
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In silico and Experimental Metabolic Flux Analyses and their Applications to Fermentation Processes
计算机模拟和实验代谢通量分析及其在发酵过程中的应用
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Ozaki Masashi, Shimazaki Ai, Jung Mina, Nakaike Yumi, Maruyama Naoki, Yakumaru Shinya, Rafieh Alwani Imanah, Sasamori Takahiro, Tokitoh Norihiro, Ekanayake Piyasiri, Murata Yasujiro, Murdey Richard, Wakamiya Atsushi, Hiroshi Shimizu]
通讯作者:
Hiroshi Shimizu
光合成 第Ⅳ部、3. 光合成のカギとなる段階を探せ
光合作用第四部分,3.找出光合作用的关键步骤
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[清水浩, 豊島正和]
通讯作者:
豊島正和
Effect of light fluctuations on photosynthesis and metabolic flux in Synechocystis sp. PCC 6803
光波动对集胞藻光合作用和代谢通量的影响。
DOI:
10.1002/btpr.3326
发表时间:
2023
期刊:
Biotechnology Progress
影响因子:
2.9
作者:
[Imada Tatsumi, Yamamoto Chiaki, Toyoshima Masakazu, Toya Yoshihiro, Shimizu Hiroshi]
通讯作者:
Shimizu Hiroshi
動的代謝モデルを用いたシアノバクテリアのカルビン回路における制御機構の解析
利用动态代谢模型分析蓝藻卡尔文循环的控制机制
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[今田辰海, 戸谷吉博, 清水浩, 今田辰海,戸谷吉博,清水浩, 田島 遼太郎,池原 万由, 戸谷 吉博, 清水 浩]
通讯作者:
田島 遼太郎,池原 万由, 戸谷 吉博, 清水 浩
Effect of fluctuating light condition on photosynthesis and central carbon metabolism in Synechosystis sp. PCC 6803
波动光照条件对集胞藻光合作用和中心碳代谢的影响。
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Tatsumi Imada, Chiaki Yamamoto, Yoshihiro Toya, and Hiroshi Shimizu]
通讯作者:
and Hiroshi Shimizu
共 10 条
赤色青色交互照射による植物の成長促進効果のメカニズム解明と栽培技術の体系化
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批准号:20K21351
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$4.08万
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财政年份:2020
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负责人:清水 浩
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依托单位:
High performance microbial cell factories development by model based metabolic design and adaptive laboratory evolution
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批准号:19H05626
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
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资助金额:$119.97万
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财政年份:2019
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负责人:清水 浩
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依托单位:
Identification of rate limiting step in metabolic pathway for bioproductions based on genome scale model
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批准号:19H00839
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$26.29万
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财政年份:2019
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负责人:清水 浩
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依托单位:
植物のストレス防御反応を利用した高栄養価野菜の周年栽培技術に関する研究
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批准号:17K19310
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$3.99万
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财政年份:2017
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负责人:清水 浩
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依托单位:
高指向性超音波放射圧を利用した非接触ピンポイント全自動受粉システムの開発研究
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批准号:17H03894
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.4万
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财政年份:2017
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负责人:清水 浩
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依托单位:
大腸菌細胞間相互作用をとおしてみた生命体情報ネットワーク
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批准号:16650063
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2004
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负责人:清水 浩
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依托单位:
植物体内温度勾配を利用した転流コントロールによる植物の成長制御に関する研究
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批准号:11660255
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.11万
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财政年份:1999
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负责人:清水 浩
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依托单位:
画像処理装置を用いた放線菌の形態解析と抗生物質最大生産への応用
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批准号:07750883
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1995
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负责人:清水 浩
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依托单位:
ファジィ理論と代謝反応モデルを用いた培養状態認識法の開発
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批准号:06750827
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1994
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负责人:清水 浩
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依托单位:
発酵プロセスにおけるファジイ制御とその評価
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批准号:04750797
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1992
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负责人:清水 浩
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依托单位:
植物表面電位の非浸潤計測法の開発に関する研究
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批准号:04760171
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1992
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负责人:清水 浩
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依托单位:
植物生体電位による生育状態の定量化に関する研究
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批准号:03760166
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1991
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负责人:清水 浩
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依托单位:
画像処理による植物伸長情報の非接触計測に関する研究
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批准号:02760144
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1990
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负责人:清水 浩
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依托单位:
省エネルギー型設計を施した電気自動車の性能とエネルギー節約効果の評価法の開発
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批准号:60045107
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项目类别:Grant-in-Aid for Energy Research
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1985
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负责人:清水 浩
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依托单位:
気体状原子をフィルターとして用いる高分解レーザーレーダーの開発
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批准号:59750031
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1984
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负责人:清水 浩
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依托单位:
籾殻および籾殻燻炭の物性とその燃焼理論の究明
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批准号:X00090----256179
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1977
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负责人:清水 浩
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依托单位:
雲およびエアロゾル中に含まれる水量の遠隔的・3次元的測定法の開発
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批准号:X00210----274123
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.23万
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财政年份:1977
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负责人:清水 浩
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依托单位:
ころがり軸受の振動と騒音に関する研究
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批准号:X46070------8237
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (A)
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资助金额:$5.38万
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财政年份:1971
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负责人:清水 浩
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依托单位:
さく岩機の性能向上に関する研究
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批准号:X45120----450035
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项目类别:Grant-in-Aid for Developmental Scientific Research
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资助金额:$0.38万
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财政年份:1970
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负责人:清水 浩
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依托单位:
曲げ波動の伝播
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批准号:X42440-----52529
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项目类别:Particular Research
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资助金额:$0.19万
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财政年份:1967
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负责人:清水 浩
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依托单位:
海外基金