グロビン遺伝子群を含む広範囲遺伝子欠失によるサラセミア症の解明

阐明由于包括珠蛋白基因组在内的广泛基因缺失而导致的地中海贫血

• 批准号: 16659144
• 负责人: 山城 安啓
• 金额: $ 1.6万
• 依托单位: Yamaguchi University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2005
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16659144/
• 关键词: Junction PCR; Real-Time PCR; 広範囲遺伝子欠失; サラセミア; 欠失断端; サラセミ

昨年度に引き続き、未知の広範囲遺伝子欠失領域を決定する遺伝子技術の開発を行ってきた。この新たな方法は、Real-Time PCRと新たに開発・命名したJunction PCRを用い、mega base単位の遺伝子欠失でさえも正確に欠失断端を決定することが可能である。Genome projectによりヒトgenome data公開されている現在、この手法でかなり容易に決定することが可能になった。最も早い場合では、Real-Time PCRにより大まかな一方の欠失領域が決定できれば1週間で正確な欠失断端を決定することができる。しかし、Real-Time PCRによる遺伝子定量が難しい場合(α-globing gene等)や、欠失断端付近に高度な繰り返し配列がある場合には決定できないこともあるというこの方法の問題点もみつかった。この問題を解決するべく検討中をおこなった。その対策の1つとしてprobeを用いたReal-Time PCRによる定量を試みた。その結果、一般的な定量PCRでうまくいかない場合、probeを用いたReal-Time PCRによる定量はうまくいかないことが判明した。また、多種類のPCR primerを設計しReal-Time PCRの厳密な条件決めを行った。これにより、かなりの精度で定量PCRが可能になったが、完全に解決はできなかった。また昨年同様、この方法の有用性を示す広範囲遺伝子欠失型非αサラセミアの解析を続けてきた。我々の研究室に全国および海外から多数の血色素異常症の遺伝子分析依頼がある検体はの中で、約20家系の広範囲遺伝子欠失型非αサラセミアの診断を、この技術を用いて解析を行った。δβサラセミア1種類・6家系(27kb欠失)、βサラセミア1家系(116kb欠失)、βグロビン遺伝子は存在するがLCR(Locus control region)を含む上流の欠失による、εγδβサラセミア3家系(39kb,46kb,118kb欠失)、βグロビン遺伝子群が完全に欠失しているεγδβサラセミア2家系(1.41Mb,1.4Mb欠失)、欠失と逆方向挿入によるδβサラセミア1家系を診断することが出来た。最後の症例を除けば、全て新規の欠失であることがわかった。また、いずれの症例も相同組み換えによる欠失ではなく、その欠失断端付近にはおもしろい配列が存在する症例もあった。今後の課題となる。

In the past year, the development of technology has been carried out in the field of unknown transmission and transmission. This new method, Real-Time PCR, new development, naming, Junction PCR, mega base unit, missing subsequence, correct missing terminal determination, is possible. Genome project is open to the public and easy to determine. In the earliest case, Real-Time PCR determines the missing area of a large area and determines the correct missing area within one week. Real-Time PCR is difficult to quantify in cases (α-globing gene, etc.), and the missing end is close to the height of the error. The problem is solved in the middle of the discussion. Real-Time PCR is a quantitative method for detecting the presence of a probe. Results, general quantitative PCR, probe, Real-Time PCR, quantitative PCR, and identification Design and Implementation of Real-Time PCR with Multiple PCR Primers Quantitative PCR is possible and completely resolved. The usefulness of this method was demonstrated by the analysis of the missing non-alpha-delta data. The genetic analysis of most hemochromatosis in China and abroad is based on the diagnosis of non-alpha hemochromatosis in about 20 families.δβ 1 species·6 families (27kb missing), β 1 family (116kb missing), β (Locus control region) includes 3 families (39kb,46kb,118kb) with upstream loss, εγδβThe last case is to eliminate the problem, and the whole new regulation is missing. The symptoms of the same group are absent, and the symptoms of the same group are absent. Future issues.

项目成果

未知の広範囲欠失の欠失断端の新しい同定法-Junction PCR-

一种识别未知大规模缺失缺失残端的新方法-Junction PCR-

• 发表时间: 2004
• 期刊: 臨床血液 45(8)
• 作者: 日野未奈子;藤本弘子;清水慶久;山城安啓;服部幸夫
• 通讯作者: 服部幸夫

A novel ^Gγ^Aγ(δβ)^O-thalassemia with a 27 kb deletion

一种新型 ^Gγ^Aγ(δβ)^O-地中海贫血，具有 27 kb 缺失

• 发表时间: 2005
• 期刊: Hemoglobin. 29(3)
• 作者: Shuto H;Yamauchi A;Ikeda M;Sohda Y;Koga A;Tominaga K;Egawa T;Kataoka Y;Mamiko Kai et al.;日野未奈子;Yasuhiro Yamashiro
• 通讯作者: Yasuhiro Yamashiro

1.4Mbの広範囲欠失による新しいεγδβサラセミアの1例

由于 1.4 Mb 的广泛缺失而导致新的 εγδβ 地中海贫血病例。

• 发表时间: 2005
• 期刊: 臨床血液 47(8)
• 作者: Shuto H;Yamauchi A;Ikeda M;Sohda Y;Koga A;Tominaga K;Egawa T;Kataoka Y;Mamiko Kai et al.;日野未奈子;Yasuhiro Yamashiro;古谷知江美
• 通讯作者: 古谷知江美

未知の広範囲遺伝子欠失の欠失断端決定法Junction PCR

连接 PCR，一种确定未知大范围基因缺失的缺失残端的方法

• 发表时间: 2006
• 期刊: 臨床血液 (accepted)
• 作者: Shuto H;Yamauchi A;Ikeda M;Sohda Y;Koga A;Tominaga K;Egawa T;Kataoka Y;Mamiko Kai et al.;日野未奈子
• 通讯作者: 日野未奈子

新生児に見つかった1.4Mbの広範囲遺伝子欠失による新規のεγδβサラセミア症例

新生儿因 1.4 Mb 广泛基因缺失而导致 εγδβ 地中海贫血的新病例

• 发表时间: 2005
• 期刊: 日本遺伝子診療学
• 作者: Shuto H;Yamauchi A;Ikeda M;Sohda Y;Koga A;Tominaga K;Egawa T;Kataoka Y;Mamiko Kai et al.;日野未奈子;Yasuhiro Yamashiro;古谷知江美;日野未奈子
• 通讯作者: 日野未奈子