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1mm角生検組織片からの網羅的遺伝子発現解析による口腔前癌病変癌化マーカー抽出

通过 1 mm 方形活检组织片的综合基因表达分析从口腔癌前病变中提取癌标记物

基本信息

批准号：
17659629
负责人：
小村健
金额：
$ 2.11万
依托单位：
Tokyo Medical and Dental University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至 2006
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17659629/
关键词：
前癌病変マイクロアレイ mRNA 遺伝子プロファイリング白板症

项目摘要

口腔前癌病変の中でも最も高頻度に遭遇する白板症を対象に、発現遺伝子の網羅的解析を通して癌化マーカーとして利用可能な分子の同定に向けての、遺伝子プロファイリングデータの蓄積を目的として研究を開始した。本研究に関する申請書類は本学歯学部附属病院の倫理審査委員会の承認をうけた。平成17年11月より当科にて生検を行う白板症患者に通常の病理組織学的診断を行った結果、白板症などの前癌病変と診断された場合に、同意が得られた場合のみ病理組織学的診断を行った残りの検体から病変組織1mm角大を採取した。平成18年度までに68例がストックされた。部位別の内訳は、舌縁23例、歯肉21例、頬粘膜14例、硬口蓋5例、舌下部2例、軟口蓋2例、舌背1例であった。病理組織学的診断では、異型性を伴わない白板症25例、軽度異型性を伴う白板症26例、中等度異型性を伴う白板症10例、高度異型性を伴う白板症6例であった。一方、Takara社製DNAチップIntelliGeneを使用した口腔癌のマイクロアレイ解析の結果を論文として発表した、しかし検討の結果、IntelliGeneに比べて約2倍の遺伝子数を網羅的に解析可能となる、DNAチップ研究所製AceGene Human oligochip 30K 1chip versionを使用することとした。チップ上の遺伝子数が増えたために、専用の画像解析ソフトを使用し、スキャンされた画像の認識・解析が可能であることが確認された。高度または中等度異型性を伴う白板症を中心にマイクロアレイ解析を継続中で、ケラチンなど数種の遺伝子発現に差があることが示唆されている。

The most frequent occurrence of oral precancerous diseases is the analysis of the target gene and the expression of the gene network, and the study of the accumulation of the gene has begun using the possible molecular identity. The application for this study was accepted by the Ethics Review Committee of the Affiliated Hospital of the Faculty of Dentistry. In November 2017, the Department of Health conducted a general histopathological diagnosis of patients with white board disease. In the case of white board disease, the Department of Health agreed to conduct a pathological diagnosis of patients with white board disease. In 2018, there were 68 cases. There were 23 cases of internal flap, 21 cases of oral flap, 14 cases of buccal mucosa, 5 cases of hard flap, 2 cases of lower part of tongue, 2 cases of soft flap and 1 case of dorsal flap. Pathological diagnosis: 25 cases of heteromorphic white plate syndrome, 26 cases of moderate heteromorphic white plate syndrome, 10 cases of moderate heteromorphic white plate syndrome, 6 cases of high heteromorphic white plate syndrome One party, Takara Corporation DNA chip IntelliGene used to analyze the results of oral cancer analysis, the results of the discussion, IntelliGene about 2 times the number of genes collected analysis possibility, DNA chip Institute AceGene Human oligochip 30K 1chip version used. The number of characters on the screen increases, and the image analysis software is used to recognize and analyze the image. High degree of heteromorphism associated with white plate disease, central analysis, genetic diversity, genetic diversity