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病害制御のための樹体表面及び組織内部の病原性・非病原性微生物相の一括診断法の開発

开发树木表面和内部组织的致病性和非致病性微生物群的综合诊断方法，用于疾病控制

基本信息

批准号：
18658016
负责人：
佐野輝男
金额：
$ 2.11万
依托单位：
Hirosaki University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2008
项目状态：
已结题

项目摘要

(1) リンゴ樹に表生・内生する微生物群の収集、同定、遺伝子分離と保存新たに、慣行農薬防除園2箇所、無農薬・減農薬栽培園2箇所から、葉圏に生息する微生物を分離し、真菌17属、細菌10属を同定した。防除方法の違いが葉圏微生物相の違いに及ぼす影響を分析し、農薬散布により特に細菌の生息数が減少する傾向を見出した。(2) リンゴ樹の表生・内生微生物群の一括診断のためのマクロアレイの改良昨年度試作した真菌(病原菌10属・非病原菌14属)と細菌(病原菌2属・非病原菌12属)のcDNAマクロアレイを評価した結果、cDNAアレイ(100-300bp)では配列が長すぎて個々の微生物の完全な特異的識別が困難であった。そこで、分離された微生物と病原菌の遺伝子配列を再分析して各微生物に特異的な配列を抽出し、真菌と細菌それぞれ20種からなるオリゴヌクレオチドアレイを試作した。その結果、同属の近縁種の1-2の例外を除いて、非特異的反応なしにそれぞれの微生物を識別することに成功した。このマクロアレイを用いて、実際の圃場から採集したリンゴ葉面微生物の一括診断を行った結果、少なくとも優占する5-6種程度の微生物の定量的な同定が可能であった。即ち、本研究で目的として、リンゴ葉圏微生物の一括診断マクロアレイの開発に成功した。(3) 様々な環境条件下のリンゴ微生物相の資料収集平成18年度・ニュージーランド・オタゴ地区、平成19年度・米国・オレゴン州に引き続き、平成20年度は、北イタリア(トリノ市郊外)の果樹栽培地帯を訪問して、リンゴ、ナシ、アプリコット等の栽培と病害防除に関する情報を収集した。また、中国・北京市の無農薬栽培リンゴ園の病害発生状況を調査し、葉圏微生物のDNA試料を収集した。一部をマクロアレイ診断に供した結果、栽培環境の違いで微生物相が大きく異なる可能性が示唆された。

(1)Collection, identification, isolation and preservation of microorganisms from tree surface and endogenous plants, isolation of microorganisms from leaf rings, 17 genera of fungi and 10 genera of bacteria were identified. The analysis of the influence of the control method on the microbial phase in the leaf circle shows that the number of bacteria living in the agricultural dispersion tends to decrease. (2)The results of cDNA library evaluation of fungi (pathogenic bacteria 10 genera, nonpathogenic bacteria 14 genera) and bacteria (pathogenic bacteria 2 genera, nonpathogenic bacteria 12 genera), cDNA library (cDNA library 100-300bp), and the complete and specific identification of these microorganisms were difficult. The gene sequences of the isolated microorganisms and pathogenic bacteria were analyzed again. The specific gene sequences of each microorganism were extracted. There were 20 species of fungi and bacteria. The results showed that 1-2 of the generic species were successfully eliminated, and the non-specific anti-microbial species were successfully identified. The quantitative determination of 5-6 kinds of microorganisms in the field, including diagnostic results, is possible. Therefore, the aim of this study is to develop a diagnostic method for microbiome in the leaf system. (3)Data collection of microbial phase under various environmental conditions Information collection on cultivation disease control, such as visits, pollution, pollution, etc. to fruit tree cultivation areas in Heisei 18, Heisei 19, Heisei 19, and Heisei 20. To investigate the disease development status of agro-chemical-free gardens in China and Beijing City, and to collect DNA samples of leaf-ring microorganisms. A part of the diagnosis results, culture environment and microbial differences between the possibility of

项目成果

期刊论文数量（13）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

等温遺伝子増幅法(ICAN法)を用いたウイロイドの診断

使用等温基因扩增法（ICAN法）诊断类病毒

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
0
作者：
Sano;T.;Matsuki;K.;Isono;S.;Tsuji;M.;Tanaka;K.;磯野清香・佐野輝男・上森隆司
通讯作者：
磯野清香・佐野輝男・上森隆司

異なる病害虫管理条件下で栽培されたリンゴ樹'の葉圏微生物相の多様性の比較解析

不同病虫害防治条件下苹果树叶际微生物多样性比较分析

DOI：
发表时间：
2009
期刊：
影响因子：
0
作者：
Yaegashi;H.;Isogai;M.;Tajima;H.;Sano;T. and Yoshikawa;N.;佐野輝男・田中和明・藤田隆・宇野忠義・川合信司;浅利正義・佐野輝男;赫英紅・田中和明・伊藤大雄・佐野輝男
通讯作者：
赫英紅・田中和明・伊藤大雄・佐野輝男

The diversity and identity of Apple fruit crinkle viroid isolates in apple and hop

苹果和啤酒花中苹果果皱类病毒分离株的多样性和同一性

DOI：
发表时间：
2008
期刊：
影响因子：
0
作者：
Sano;T.;Matsuki;K.;Isono;S.;Tsuji;M.;Tanaka;K
通讯作者：
K

リンゴ樹の表面及び内部に生息する微生物群のマクロアレイ解析

苹果树上和树内微生物的宏阵列分析

DOI：
发表时间：
2008
期刊：
影响因子：
0
作者：
Yaegashi;H.;Isogai;M.;Tajima;H.;Sano;T. and Yoshikawa;N.;佐野輝男・田中和明・藤田隆・宇野忠義・川合信司;浅利正義・佐野輝男;赫英紅・田中和明・伊藤大雄・佐野輝男;赫英紅・田中和明・伊藤大雄・佐野輝男;磯野清香・渋谷允・田中和明・佐野輝男
通讯作者：
磯野清香・渋谷允・田中和明・佐野輝男

Cycleave Isothermal chimeric amplification of nucleic acids (Cycleave-ICAN) for the sensitive, rapid and simple diagnosis of viroids

Cycleave 核酸等温嵌合扩增 (Cycleave-ICAN) 用于灵敏、快速且简单地诊断类病毒