cRNAを使ってゲノムインプリンティング遺伝子の発生ステージ特異的発現を解明する

使用 cRNA 阐明基因组印记基因的发育阶段特异性表达

• 批准号: 18658109
• 负责人: 西堀 正英
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: Hiroshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18658109/
• 关键词: DNAメチル化遺伝子; リアルタイムPCR; 遺伝子発現; 脳; 精巣; cRNA; 近交系マウス; Dnmt

近交系マウス(C57BL/6J♂)およびコマーシャル産卵鶏(White Leghorn♂)を用い、脳・肝臓・腎臓・精巣の5つの発生ステージ(胚14日、胚17日、生後1日齢、1週齢、8週齢)ごとに5つのDnmt(Dnmt1/Dnmt2/Dnmt3a/Dnmt3b/Dnmt3L)遺伝子の発現量の変化をマウスおよびニワトリ間で比較しながら調べDNAメチル化酵素関連遺伝子の発現時期、発現場所および発現動態を解析した。解析は、各発生ステージにおける各遺伝子の発現量を、リアルタイムPCRを行い調べた。また、マウスにおけるCGRP遺伝子およびCT遺伝子についても同様に実施し、さらにin situ hybridizationにより発現部位の同定を試みた。(1)Dnmt3L遺伝子がニワトリにはないとの報告があり、このためニワトリDnmt3Lの解析は実施できなかった。(2)Dnmt遺伝子の発現パターンは、肝臓と腎臓では発生および成長に伴って減少する傾向にあったが、脳と精巣ではそのパターンは異なっていた。ニワトリの精巣での発現は肝臓と腎臓のパターンに似て、発生および成長に伴って減少する傾向にあった。(3)ニワトリにはインプリンティング機能が備わっていないとする論文があるが、本研究でニワトリDnmt遺伝子発現が確認でき、その発現量はマウスとほぼ同程度であった。以上から、マウスおよびニワトリにおけるDnmt遺伝子の使われ方が種、臓器間で異なっているものと考えられた。一方、マウスおけるCGRPおよびCT遺伝子の発現は脳で高い傾向にあり、肝臓および心臓では低かった。この結果はこれまでの報告と一致した。これらのcRNAをプローブとしたin situ hybridizationの結果、甲状腺での発現が高く、Sense・Antisense鎖ともに強い発現が観察された。以上より、遺伝子発現の定量および発現の局在をcRNAプローブを用いることで、これまで明確ではなかったAnti-sense鎖RNAの発現様式を正確に解析できる可能性が広がった。

The inbred line ウス ウス(C57BL/6J♂)およびコ ウス シャ シャ 鶏 鶏(White. Leghorn ♂) を い, 脳, a routine liver, kidney, viscera essence, 巣 の 5 つ の 発 raw ス テ ー ジ (14 and 17, embryo, embryo, postnatal 1 齢 齢 齢, 1 weeks, 8 weeks) ご と に 5 つ の Dnmt (Dnmt1 / Dnmt2 / Dnmt3a/Dnmt3b/Dnmt3L) heritage 伝 son の 発 amount is の variations change を マ ウ ス お よ び ニ ワ ト リ で comparison between し な が ら adjustable べ DNA メ チ ル phenoloxidase masato even heritage 伝 son の 発 period, 発 site お よ び 発 now dynamic を し た. Parsing は, each 発 ス テ ー ジ に お け る each legacy 伝 son の 発 now を, リ ア ル タ イ ム PCR line を い adjustable べ た. ま た, マ ウ ス に お け る CGRP posthumous son 伝 お よ び CT posthumous son 伝 に つ い て も with others に be し, さ ら に the in situ hybridization に よ り の 発 now parts with fixed を try み た. (1) Dnmt3L posthumous son 伝 が ニ ワ ト リ に は な い と の report が あ り, こ の た め ニ ワ ト リ Dnmt3L の parsing は be applied で き な か っ た. (2) Dnmt posthumous son 伝 の 発 now パ タ ー ン は is crucial, crucial liver と kidney で は 発 raw お よ び growth に with っ て reduce す る tendency に あ っ た が, 脳 と fine 巣 で は そ の パ タ ー ン は different な っ て い た. ニ ワ ト リ の fine 巣 で の 発 now crucial は perforatien と liver kidney の パ タ ー ン に て, born 発 お よ び growth に with っ て reduce す る tendency に あ っ た. (3) ニ ワ ト リ に は イ ン プ リ ン テ ィ ン が グ function for わ っ て い な い と す る paper が あ る が, this study で ニ ワ ト リ Dnmt posthumous son 伝 発 が now confirmed で き, そ の 発 now quantity は マ ウ ス と ほ ぼ with degree で あ っ た. Above か ら, マ ウ ス お よ び ニ ワ ト リ に お け る Dnmt heritage 伝 の made わ れ が kind, viscera で between different な っ て い る も の と exam え ら れ た. One party, the 伝 offspring of ウスおける ウスおけるCGRPおよびCT have a <s:1> 脳で high <s:1> tendency にあ った, and the liver および heart で で are low および った. The <s:1> result れまで れまで れまで report と is consistent with た た. こ れ ら の cRNA を プ ロ ー ブ と し た the in situ hybridization の results, thyroid で の 発 が high く, Sense, Antisense lock と も に strong い 発 now が 観 examine さ れ た. Above よ り, but 伝 発 is の quantitative お よ び 発 is の bureau in を cRNA プ ロ ー ブ を with い る こ と で, こ れ ま で clear で は な か っ た lock Anti - sense RNA の 発 others type を に right now parse で き る possibility が hiroo が っ た.

项目成果

Porcine CRSP1, 2, and 3 genome structures, expressions in tissues, and functions

猪 CRSP1、2 和 3 基因组结构、组织中的表达和功能

• 发表时间: 2008
• 期刊: Cytogenetics and Genome Research (印刷中)
• 作者: Tsukamura;H.;Tadashi Yamasaki;束村博子;M.Tohno;Yuko Miyake;上野山賀久;Kohtaro Miyazawa;上野山賀久;Kohtaro Miyazawa;束村博子;Nagai Y.;大蔵聡;田中沙智;Vutha Pheng;島津朋之;束村博子;遠野雅徳;Vutha Pheng;前多敬一郎;Kanaya T.;上野山賀久;田中沙智;岡村裕昭;遠野雅徳;植田 渉;稲本瑠子;井谷 航;高倉郁朗;清水基道;Y. UENOYAMA;Masanori Tohno;Y. INAMOTO;Takashi Kanaya;Abdol Hossein Rezaeian
• 通讯作者: Abdol Hossein Rezaeian

Genomic structure of swine taste receptor family 1 member 3, TAS1R3, and its expression in tissues

• DOI: 10.1159/000094801
• 发表时间: 2006-01-01
• 期刊: CYTOGENETIC AND GENOME RESEARCH
• 影响因子: 1.7
• 作者: Kiuchi, S.;Yamada, T.;Yasue, H.
• 通讯作者: Yasue, H.

胚発生・成長に伴うマウスおよびニワトリにおけるDNAメチル化酵素遺伝子の発現動態

小鼠和鸡胚胎发育和生长过程中DNA甲基转移酶基因的表达动态

• 发表时间: 2007
• 作者: 内藤一郎;中野和代;他;Yasuhisa Yamashita;Kiuchi Sachiko;礒兼 妙子
• 通讯作者: 礒兼 妙子

in situハイブリダイゼーション用遺伝子プローブ配列を基軸としたウシのオリゴアレイの検出

基于原位杂交基因探针序列的牛寡核苷酸阵列检测

• 发表时间: 2007
• 作者: 内藤一郎;中野和代;他;Yasuhisa Yamashita;Kiuchi Sachiko;礒兼 妙子;庄條 昌之
• 通讯作者: 庄條 昌之

Changes in the expression of gallinacins, antimicrobial peptides, in ovarian follicles during follicular growth and in response to lipopolysaccharide in laying hens (Gallus domesticus)

• DOI: 10.1530/rep-06-0083
• 发表时间: 2007-01-01
• 期刊: REPRODUCTION
• 影响因子: 3.8
• 作者: Subedi, Kalpana;Isobe, Naoki;Yoshimura, Yukinori
• 通讯作者: Yoshimura, Yukinori