遺伝子配列を材料素子とする河川水中有害物質の簡易測定系構築

以基因序列为物质元素的河水中有害物质简易检测系统的构建

基本信息

  • 批准号:
    14655286
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.18万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 财政年份:
    2002
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2002 至 2003
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

遺伝子配列は4つの塩基から構成されているだけであるが、その配列は多様な情報を伝達する事が出来、様々なタンパク質を創り出すことが出来る。しかし近年、この遺伝子配列(DNA配列)そのものの多様性を利用し、遺伝子配列を機能性材料として用いる事が試み始めている。本申請研究はこの"DNA多様性"をセンサー材料として利用し、石油化学物質・環境ホルモンによる水質汚染の評価を総合的に行うことを目的とする。準備として、現在までにベンゼン資化性微生物由来のベンゼン認識遺伝子配列を蛍光発光タンパク質と組み合わせた微生物を構築し、その発色強度より水中のベンゼン系化合物(キシレンやクロロトルエン)の濃度測定を可能にしている。これを足掛かりに、(最終的には微生物を用いずに)ベンゼン系の類似構造を持つ化学物質の分析を可能にする測定系の開発を行う。また"DNA自身"を機能材料として用いた研究は現在までは殆ど行われていない。何故なら、現在までは個々の遺伝子(DNA)配列から翻訳されたタンパク質の機能を解明するものが中心であったからである。"DNA多様性"に関する研究は遺伝子増幅技術polymerase chain reaction (PCR)法の発展に伴い次第に注目を浴びるように変化してきた。現在まで、抗体などのタンパク質をセンサーとして用いたケースは多く知られている、しかしその生産には微生物を用いた煩雑操作が必要であり、結果的に高価格であった。しかしDNAは試験管内にてPCR法にて容易に増幅させることが可能であり、工業的な側面を考えた場合に、DNA素子のセンサー化が可能であれば、そちらの方がセンサーとして経済的であると考えられる。このような背景より(1)大腸菌内でのDNA多様性を用いたベンゼン系化合物検出システム、(2)DNA自身をセンサー素子として利用し、フェノール系化合物を認識するDNAセンサーの開発を推進した。(1)に関しては環境庁指定の排出規制基準程度のベンゼン系化合物の検出が可能になり、更に多サンプルの同時測定が可能な培養系の構築を完了した。今後はこのシステムを用いて河川水の環境汚染評価を行っていく予定である。(2)に関しては、昨年決定した探索条件にてフェノール認識DNAアプタマーの探索を終了することが出来た。そして、水晶振動子を用いた分子間相互作用評価より、高い結合を示すDNAアプタマーを同定することが出来た。今後、この遺伝子配列の分子解析を行っていく予定である。
The information is distributed among the four groups, and the information is distributed among the four groups. In recent years, the diversity of gene sequences (DNA sequences) has been utilized, and gene sequences have been used as functional materials. This application studies the "DNA diversity" of materials, applications, petrochemicals, environmental protection, and water pollution assessment. To prepare and present information on the origin of microbial species, the identification of their molecular structure, the light emission, the composition, the construction of microbial species, the intensity of their light emission, and the possible determination of the concentration of microbial species in water. The development of a system of similar structures and possible analysis of chemical substances "DNA itself" is a functional material, and it is now used for research. Why is it that the DNA sequence of a gene is now aligned and the function of a gene is explained? "DNA diversity" is a research topic related to the development of polymerase chain reaction (PCR) method. Now, antibodies are used in the production of microorganisms, and the results are high. The PCR method is easy to increase in amplitude, and it is possible to increase This background includes: (1) DNA diversity in Escherichia coli,(2) DNA itself,(3) DNA itself,(4) DNA itself,(5) DNA itself,(6) DNA itself,(7) DNA itself,(8) DNA itself,(9) DNA itself,(9) DNA itself,(10) DNA itself,(11) DNA itself,(12)DNA itself,(13) DNA itself,(14) DNA itself,(15) DNA itself,(16) DNA itself,(17) DNA itself,(18) DNA itself,(19) DNA itself,(19) DNA itself,(10) DNA itself,(11) DNA itself,(10) DNA itself,( (1)In this regard, the establishment of a culture system for the detection of possible compounds in the environment and the determination of possible concentrations of compounds in the environment have been completed. In the future, the use of river water pollution assessment will be determined. (2)We decided to explore the conditions for DNA discovery last year. The interaction between molecules in the crystal oscillator is evaluated and the interaction between molecules in the crystal oscillator is determined. In the future, the molecular analysis of the gene sequence will be carried out.

项目成果

期刊论文数量(16)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Ikeno, S., Ito, T., Ogino, C., Shimizu.N.: "Detection of benzene derivatives by recombinant E. coli with Ps promoter and GFP as a reporter protein."Biochem.Engine.J.. 15. 193-197 (2003)
Ikeno, S.、Ito, T.、Ogino, C.、Shimizu.N.:“使用 Ps 启动子和 GFP 作为报告蛋白的重组大肠杆菌检测苯衍生物。”Biochem.Engine.J. 15。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Ikeno, S., Ogino, C., Ito, T., Sugino, Y., Shimizu, N.: "Effect of medium compositions on biosensing of benzene derivatives using recombinant Escherichia coli."Biochem.Engine.J.. 16. 273-278 (2003)
Ikeno, S.、Ogino, C.、Ito, T.、Sugino, Y.、Shimizu, N.:“培养基组合物对使用重组大肠杆菌的苯衍生物生物传感的影响。”Biochem.Engine.J. 16。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Talukder, M.M.R., Taketama, T., Hayashi, Y., Wu, J.C., Kawanishi, T., Shimizu, N., Ogino, C.: "Improvement in enzyme activity and stability by addition of low molecular weight polyethylene glycol to sodium bis(2-ethyl-L-hexyl)sulfosuccinate/isooctane reve
Talukder, M.M.R.、Taketama, T.、Hayashi, Y.、Wu, J.C.、Kawanishi, T.、Shimizu, N.、Ogino, C.:“通过向钠中添加低分子量聚乙二醇来提高酶活性和稳定性
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
S.Ikeno, T.Itou, C.Ogino, N.Shimizu: "Biosensing of benzene derivatives with Ps promoter gene and reporter protein GFP"Biochem. Engine. J.. (Accepted). (2003)
S.Ikeno、T.Itou、C.Ogino、N.Shimizu:“使用 Ps 启动子基因和报告蛋白 GFP 进行苯衍生物的生物传感”Biochem。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Ogino, C., Kanemasu, M., Hayashi, Y., Kuroda, S., Kondo, A., Shimizu, N., Tanizawa, K., Fukuda, H.: "Over-expression system of phospholipase D from actinomycete by Streptomyces lividans."Appl.Microbiol.Biotech.. In press.
Ogino, C.、Kanemasu, M.、Hayashi, Y.、Kuroda, S.、Kondo, A.、Shimizu, N.、Tanizawa, K.、Fukuda, H.:“来自放线菌的磷脂酶 D 的过表达系统
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  • 资助金额:
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  • 批准号:
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  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 2.18万
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    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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