グアノシン積層構造における全体振動の解析

鸟苷叠层结构整体振动分析

• 批准号: 04671338
• 负责人: 菅原 洋子
• 金额: $ 1.28万
• 依托单位: The Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
• 财政年份: 1992
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1992 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-04671338/
• 关键词: グアノシン積層構造; 全体振動; 格子振動

核酸塩基の中、グアニル基(G)は四量体積層構造(G4積層構造)を形成することが知られている。この様な構造に特徴的な全体振動(Sモード)の帰属およびその動的性格の解明を目的とし、グアニル基が積層した構造を有し、Sモードと対応した格子振動が観測されるグアノシン結晶について、低波数領域ラマンスペクトル測定をおこなった。グアノシン結晶は、温度条件、湿度条件に依存し、グアニル基の積層構造を保持した状態で結晶構造転移を起こすが(Y.Sugawara et al.、投稿中)、20-30cm^<-1>付近に存在するSモードは、構造転移の全ての相で保持されていることが明らかになった。一方、結晶構造転移と共に40-100cm^<-1>領域に観測される他の格子振動の振動数および強度には顕著な変化が生ずる。また、Sモードの振動数は、二水和物で27cm^<-1>、無水物で18cm^<-1>、1.2水和物相当の相で32cm^<-1>とシフトを示した。これは、結晶構造転移に伴なう積層構造の微少な変化や積層構造体間の相互作用力の変化がSモードの振動数に反映されていると考えられ、G4積層構造の低周波ラマンスペクトルで観測されたイオン種や水和度に依在したSモードの振動数変化との相関に興味がもたれる。現在グアノシン二水和物結晶およびグアノシン四量体積層構造モデルについて、非結合原子間に(exp-6)ポテンシャル、水素結合項に(10-12)ポテンシャルを用いた基準振動計算を行ない、40cm^<-1>以下の振動数の振動モードに注目し、分子間ポテンシャルの妥当性についての評価と共にSモードの振動形についての検討を進めている。

In the nucleic acid base <s:1>, the グアニ base (G) グアニ four-volume layer structure (G4 accumulation structure)を forms する とが とが and られて る る る. こ の others な tectonic に 徴 な all vibration (S モ ー ド) の 帰 genus お よ び そ の dynamic character の interpret を purpose と し, グ ア ニ ル base が horizon し た a し を construction, S モ ー ド と 応 seaborne し た lattice vibration が 観 measuring さ れ る グ ア ノ シ ン crystallization に つ い て, low wave number domain ラ マ ン ス ペ ク ト ル determination を お こ な っ た. グ ア ノ シ ン crystallization は, temperature conditions, humidity conditions に dependent し, グ ア ニ ル base の laminated structure を keep し た state で crystal structure planning move since を こ す が (Y.S ugawara et Al., submission), 20 -- 30 cm ^ < 1 > pay nearly に exist す る S モ ー ド は, construction planning move の て の phase で keep さ れ て い る こ と が Ming ら か に な っ た. Side, crystallization structure planning move と に 40-100 cm ^ < 1 > field に 観 measuring さ れ る he の number of lattice vibration の お よ び strength に は 顕 the な variations change が raw ず る. ま た, S モ ー ド の vibration number は, two water and で 27 cm ^ < 1 >, anhydrous で 18 cm ^ < - > 1, 1.2, and water content quite の phase で 32 cm ^ < 1 > と シ フ ト を shown し た. こ れ は and crystallization structure planning move に な う laminated structure の slightly less な variations change や horizon の mutual acting force between constructs の variations change が S モ ー ド の number of vibration に reflect さ れ て い る と exam え ら の れ, G4 product layer structure of low-frequency ラ マ ン ス ペ ク ト ル で 観 measuring さ れ た イ オ に ン や water and degrees in し た S モ ー ド の vibration number variations change と の phase masato に tumblers が も た Youdaoplaceholder0. Now グ ア ノ シ ン 2 water and crystallization お よ び グ ア ノ シ ン amount of four layer structure volume モ デ ル に つ い て, the combination between atoms に (exp - 6) ポ テ ン シ ャ ル, water element combination に (10-12) ポ テ ン シ ャ ル を with い た datum line vibration calculation を な い, 40 cm ^ < 1 > the following の vibration number の モ ー ド に し, between molecules ポ テ ン シ ャ ル の justice に つ い て の review 価 と に S total モ ー ド の vibration shape に つ い て の beg を 検 into め て い る.