权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

ヌクレオチド結晶における相転移の分岐およびサイクル現象の時間展開・空間展開の解析

核苷酸晶体中相变分岔和循环现象的时空演化分析

基本信息

批准号：
17034057
负责人：
菅原洋子
金额：
$ 2.94万
依托单位：
Kitasato University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至 2006
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17034057/
关键词：
相転移ヌクレオチド水和物分子動力学計算

项目摘要

核酸の構成単位であるヌクレオチド水和物結晶に誘起される温度および水蒸気圧に依存した相転移現象について、相転移の時間展開、空間展開の解析をめざし、X線回折法、分光法等を用いその解析を進めてきた。平成19年度においては、1.湿度制御ガス気流下でX線回折強度測定が可能なシステムを構築し、サイクル様の現象現象(往路と復路で異なる中間体を経由する相転移)がおこるグアノシン結晶において、無水物から2水和物への吸湿過程でのみ観測される中間状態の構造解析に成功した。中間状態は1.25水和物相当であり、中間状態から2水和物への転移に伴い、分子のグリコシド結合周りのコンフォメーションがsynからantiへと大きく変わることが明らかになった。昨年度解析に成功したデオキシグアノシン5'-リン酸ニナトリウムの系と同様、相転移の進行は分子の顕著なコンフォメーション変化を伴っており、これに由来し、相転移点におけるエネルギー障壁が高いことが準安定状態の出現を誘起し、サイクル様相転移の原因になっているとみられる。2.湿度連続可変条件下で単結晶試料の偏光顕微鏡観察が可能なシステムを構築し、イノシン5'-リン酸ニナトリウム(Na_2IMP)およびキシロースイソメラーゼ単結晶について、相対湿度条件に依存した相転移を追跡した。両結晶とも相転移の進行に伴い、一過的に結晶の光透過性の局所的な変化がおこり、相転移の空間および時間進行をモニターすることに成功した。本方法を用い、時間分解能としてはmsecオーダー、空間分解能はμmオーダーでの相転移の追跡が可能である。

The structure of nucleic acid is determined by the temperature and vapor pressure dependence of the induced crystallization of water and substance, the analysis of phase shift phenomenon, the time expansion of phase shift, the analysis of spatial expansion, X-ray backfolding method, spectroscopy, etc. 1. Determination of X-ray reflection intensity under humidity control; construction of possible conditions; phenomenon of separation (phase shift of intermediate between forward and backward paths); structure analysis of intermediate conditions during crystallization and moisture absorption of anhydrous substances; 2. Determination of moisture absorption of water and substances. The intermediate state is 1.25 water and matter equivalent, the intermediate state is 2 water and matter are transferred, the molecule is separated, the cycle is separated, and the cycle is separated. Last year, the analysis was successful in analyzing the causes of the occurrence of high temperature and quasi-stable state, and the causes of phase shift. 2. Polarized microscopical observation of single crystalline samples under variable humidity conditions is possible to construct a system of crystallization, phase shift and phase shift dependent on humidity conditions. The phase shift of the crystal is carried out in the same way as the phase shift of the crystal. This method can be used in time decomposition and space decomposition.