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レンサ球菌の系統と新しい分類同定体系の作成に関する研究

链球菌系统发育研究及新分类鉴定体系的建立

基本信息

批准号：
06670287
负责人：
江崎孝行
金额：
$ 1.28万
依托单位：
Gifu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
财政年份：
1994
资助国家：
日本
起止时间：
1994 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

レンサ球菌の中で分類に混乱がおきているビリダンス-グループーレンサ球菌の基準種のリボゾームRNAの配列を決定し,全レンサ球菌の系統樹を作成した(文献1)。その結果これまでビリダンス-グループーレンサ球菌と一括されてきた菌群が5つの系統に分かれることが明らかになった。そのうちStreptococcus mitisとStreptococcus oralisが系統的に近く,16SリボゾームRNAの配列でも99.4%の相同性があることがわかった。両者は定量的DNA・DNAハイブリッド形成実験でも44-55%の類似度があり、近接した種であることが証明された。臨床的にも両者の鑑別は正確には行われておらず両者の鑑別に有効な表現形質を記載する事が今後の課題となった。一方、Streptococcus sanguisはリボゾームRNAの配列では他のビリダンス-グループーレンサ球菌の他の菌種とは類似度が低くリボゾームRNAの配列から鑑別することは容易であった。しかし臨床分離株の中には基準株との相同性が低い株が多数存在することから基準株の遺伝子配列を使いこの種の正確な同定方法を作成し、これらの未分類の菌株を記載する必要がある。今回の研究のなかですべてのビリダンス-グループーレンサ球菌のリボゾームRNAの配列が出そろったため、菌種に特異的な配列の記載が可能になったので、この成果は今後の研究の貴重な情報になる。本研究を通して決定したS.delectivaおよびS.adjacensの2菌種は連鎖球菌とは系統的に異なり、まったく新しい属として分類する必要があることが証明された(投稿中)。

The phylogenetic tree of panococcus was constructed by determining the RNA alignment of the reference species of panococcus (Ref. 1). As a result, the bacteria in the five systems were isolated from each other. Streptococcus mitis Streptococcus oralis is a system of nearly 16S RNA sequences with 99.4% identity. The similarity between DNA and DNA is 44-55%. The identification of clinical patients should be carried out correctly, and the quality of clinical patients should be recorded. One side, Streptococcus sanguis, was found to have a low similarity to other species of Streptococcus sanguis and to be easy to identify. In addition, it is necessary to record the identity of the reference strain, the low identity of the reference strain, the existence of the majority of the reference strain, the correct identification method of the reference strain, and the unclassified strain. The results of this study will provide valuable information for future research. This study has been conducted to determine the need for the classification of S. selectiva and S.adjacens in two species of linked cocci (submission).