in silico analysis of molecular interactions between commercially available drugs in Japan and proteins

日本市售药物与蛋白质之间分子相互作用的计算机分析

• 批准号: 19200024
• 负责人: HIRAYAMA Noriaki
• 金额: $ 16.89万
• 依托单位: Tokai University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19200024/
• 关键词: 医薬分子; タンパク質; 分子認識; ドッキング; 分子力学

Understanding of modes of interactions between drugs and proteins is important to promote drug discovery and studies on side-effects of drugs. Although it is not practically possible to measure all the interactions experimentally, in silico methods are expected to become viable alternatives. In this project, we have studied novel methodologies essential for this purpose, and applied them to evaluate the interactions between commercially available drugs and proteins which are closely related to carbohydrate metabolism.

了解药物与蛋白质之间的相互作用模式对于促进药物发现和药物副作用的研究具有重要意义。虽然实际上不可能通过实验测量所有的相互作用，但预计计算机模拟方法将成为可行的替代方法。在本项目中，我们研究了为此目的所必需的新方法，并将其应用于评估市售药物与与碳水化合物代谢密切相关的蛋白质之间的相互作用。

项目成果

Identification of the druggable concavity in homology models using the PLB index

使用 PLB 索引识别同源模型中的可成药凹度

• 发表时间: 2007
• 期刊: J.Chem.Inf.Model. 47
• 作者: S.Soga;H.Shirai;M.Kobori and N.Hirayama
• 通讯作者: M.Kobori and N.Hirayama

AutoGPA モデルによる受容体ポケットの特徴抽出

使用 AutoGPA 模型提取受体袋特征

• 发表时间: 2009
• 作者: 朝川直行;小林誠一;後藤純一;平山令明
• 通讯作者: 平山令明

擬似分子プローブと標的分子構造に基づくde novo医薬分子設計法の開発

基于伪分子探针和目标分子结构的从头药物分子设计方法的发展

• 发表时间: 2009
• 期刊: SAR News 16
• 作者: 東田欣也;後藤純一;平山令明
• 通讯作者: 平山令明

In silico screening: from nice-to-use to must-use technology for drug discovery

计算机筛选：从好用到必须使用的药物发现技术

• 发表时间: 2007
• 作者: Lopatina O;Liu HX;Amina S;Hashii M;Higashida H.;平山 令明
• 通讯作者: 平山 令明

in silico創薬科学は稀少疾患治療薬の研究開発を可能にするか?

计算机模拟药物发现科学能否促进罕见病药物的研发？

• 发表时间: 2010
• 作者: 中村圭吾;戸田智基;猿渡洋;鹿野清宏;平山令明
• 通讯作者: 平山令明