Studies on the correlation between the internal dynamics and hydration of proteins by X-ray crystallography for humidity-controlled protein crystals

利用 X 射线晶体学研究湿度控制蛋白质晶体的内部动力学与水化之间的相关性

• 批准号: 19204042
• 负责人: NAKASAKO Masayoshi
• 金额: $ 23.05万
• 依托单位: Keio University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19204042/
• 关键词: 生物物理; ナノマシン; 表面・界面物性; 放射線・X線・粒子線; 生体分子; 蛋白質水和; 蛋白質結晶学; 湿度制御; 光受容蛋白質; 脱炭酸酵素; 分子動力学計算; 脱水素酵素; 受容体蛋白質

蛋白質結晶周辺の湿度を変化させ、結晶内のバルク水量を非破壊・可逆的に制御可能な装置の開発を進め、湿潤空気流量300~450ml/minで相対湿度20~96%rhの範囲で実験を行うことが可能な装置とその実験手順を確立し各種蛋白質結晶に適用した。サブゼロ温度領域で蛋白質のダイナミクスを探る実験、種々の蛋白質結晶についての構造解析、分子動力学計算を通じた蛋白質の運動と水和構造変化の相関解析も実施した。

The humidity around the protein crystal is changed, the amount of water in the crystal is non-destructible and reversible, the control device is open and the flow rate of the humid air is 300~45 0ml/min, the relative humidity is 20~96%rh, the standard is suitable for all kinds of protein crystallization. The structure of the protein crystal in the temperature range We use structural analysis and molecular dynamics calculations to analyze the movement of proteins and related analyzes of water and structural changes.

项目成果

Crystal structures of LOV1 domains of phototropin 1 and 2 from Arabidopsis thaliana

拟南芥向光素 1 和 2 LOV1 结构域的晶体结构

• 发表时间: 2008
• 作者: Masayoshi Nakasako;Daisuke;Matsuoka;Kazunori Zikihara;Hitomi Katsura and Satoru Tokutomi
• 通讯作者: Hitomi Katsura and Satoru Tokutomi

データベース解析から予測される膜蛋白質の膜貫通領域における水和構造

通过数据库分析预测膜蛋白跨膜区的水合结构

• 发表时间: 2008
• 作者: 松岳大輔;中迫雅由
• 通讯作者: 中迫雅由

How blue light regulateskinase activity of phototropin

蓝光如何调节促光素的激酶活性

• 发表时间: 2008
• 作者: Tokutomi;S
• 通讯作者: S

タンパク質の水和構造を探る

探索蛋白质的水合结构

• 发表时间: 2008
• 期刊: Molecular Science Journal(責任著者) 2, A0022
• 作者: K. Tsutsui;A. Toyama;T. Tohyama;and S. Maekawa;T. Sasaki;中迫雅由
• 通讯作者: 中迫雅由

Crystallization and preliminary X-ray diffraction experiments of LOV1 domains of phototropin 1 and 2 from Arabidopsis thaliana

拟南芥向光素 1 和 2 的 LOV1 结构域的结晶和初步 X 射线衍射实验

• 发表时间: 2008
• 期刊: Ada Crystallographica F64
• 作者: M. Nakasako;et al.
• 通讯作者: et al.