Study on the hydration structural changes in coupling with the internal motions of proteins using time-resolved fluorscence measurement

利用时间分辨荧光测量研究与蛋白质内部运动耦合的水合结构变化

• 批准号: 22244054
• 负责人: NAKASAKO Masayoshi
• 金额: $ 30.78万
• 依托单位: Keio University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22244054/
• 关键词: タンパク質水和; 水和構造; 分子動力学シミュレーション; 蛍光分光; 和周波測定; 非線形光学; Ｘ線結晶構造解析; 主成分分析; 蛋白質水和構造; 水和構造解析; ドメイン運動; 溶媒応答; トリプトファン蛍光; 分子動力学計算; 水素結合; 時間分解蛍光測定; 和周波; Ｘ線小角度散乱; タンパク質; 和周波分光; X線小角散乱; 溶媒応答関数; 低温X線結晶構造解析; 蛍光発光; 蛋白質水和; 悲線形光学現象; 結晶構造解析; 遺伝子組み換え

Proteins are engaged in the elementary processes of life in cells and fold and function only in aqueous environment. To understand why water is indispensable for proteins it is necessary to visualize the hydration structures of proteins at spatial resolution of atomic level and ps temporal resolution. In this research project, through developing time-resolved fluorescence measurement system dedicated for proteins, we analyzed the dynamics of protein hydration from the experimental point of view using the fluorescence measurement and structure analyses as well as molecular dynamics simulation.

蛋白质参与细胞生命的基本过程，仅在水环境中折叠和发挥功能。为了理解为什么水对蛋白质是不可缺少的，有必要在原子水平的空间分辨率和ps时间分辨率下可视化蛋白质的水合结构。本研究通过开发蛋白质时间分辨荧光测量系统，利用荧光测量、结构分析和分子动力学模拟，从实验的角度分析了蛋白质水合的动力学过程。

项目成果

XFEL用クライオ試料照射装置を用いたX線回折実験

XFEL低温样品照射装置的X射线衍射实验

• 发表时间: 2011
• 作者: 中追雅由;山本雅貴;西野吉則;高山裕貴;坂本啓太;児玉渉;鈴木茂之;松井夕花;米倉功治;眞木さおり;引間孝明;高橋幸生;久保英人;堤良輔;榊茂之
• 通讯作者: 榊茂之

経験的水和水分布関数を用いた蛋白質水和構造予測

使用经验水合水分布函数预测蛋白质水合结构

• 发表时间: 2010
• 作者: 松岳大輔;中迫雅由
• 通讯作者: 中迫雅由

Ｘ線波の干渉で分子の姿・かたちを調べる

使用 X 射线波干涉检查分子的外观和形状

• 发表时间: 2012
• 作者: Y. Takayama;M. Nakasako;T. Oroguchi;Y. Sekiguchi;et al.;中迫雅由;中迫雅由;中迫雅由;中迫雅由;中迫雅由
• 通讯作者: 中迫雅由

Coherent X-ray diffraction imaging of non-crystalline particles with sub-micrometer dimensions

亚微米尺寸非晶颗粒的相干 X 射线衍射成像

• 发表时间: 2013
• 作者: 中迫雅由;高山裕貴;苙口友隆;白濱圭也;関口優希;山本雅貴;米倉功治;引間孝明;眞木さおり;高橋幸生;鈴木明大;松永幸大;加藤翔一;星貴彦;関口優希他3名;橋本早紀他4名;小林周他4名;高山裕貴,他4名;高橋幸生他8名;中迫雅由他16名;T. Yoshidome他3名;中迫雅由;中迫雅由;M. Nakasako他21名;M. Nakasako他21名
• 通讯作者: M. Nakasako他21名

New monoclinic form of bovine pancreatic ribonuclease A from a salt solution and comparison of intermolecular interactions in ribonucleases A

盐溶液中牛胰腺核糖核酸酶 A 的新单斜形式以及核糖核酸酶 A 分子间相互作用的比较

• 发表时间: 2011
• 期刊: Journal of Crystal Growth
• 影响因子: 1.8
• 作者: H.Takusagawa;S.Yamamura;S.Endo;Sugawara;T.Inagaki;M.Nakasako
• 通讯作者: M.Nakasako