ポリオーマウイルス感染症におけるウイルスcircRNAの同定および機能解明

ヘルペスウイルスやポリオーマウイルスなどのDNAウイルスは，感染細胞内において様々な種類のnon-coding RNAを発現する．これらのnon-coding RNAは，ウイルスや宿主の遺伝子発現を制御することにより，ウイルス感染症の病態形成に関与すると考えられている．これまでに，ヘルペスウイルスやポリオーマウイルスがmicroRNAやlong non-coding RNAといったnon-coding RNAを発現することが明らかにされてきたが，近年では環状1本鎖RNAであるcircular RNA (circRNA) を発現することが報告されている．本研究では，JCポリオーマウイルスをはじめとしたポリオーマウイルスが発現するcircRNAを同定し，ウイルス関連疾患の病理検体におけるcircRNAの発現量や局在の解明，培養細胞を用いたcircRNAの機能解析を目指している．前年度は培養細胞内で効率良くJCポリオーマウイルスを複製させる実験系を確立した後，次世代シーケンシングおよびRT-PCR法による解析を実施した．その結果，JCポリオーマウイルスが感染細胞内において少なくとも1種類のcircRNAを発現する可能性が示唆されたことから，今年度はウイルスcircRNAの検出系の確立や機能解析を試みた．この過程において，当初circRNAと考えられたRNAは既知のトランススプライシング産物 (Saribas et al., J Cell Physiol, 2018) である可能性が高いと考えられた．また，この他にも多様なトランスクリプトが検出され，JCポリオーマウイルスの遺伝子発現機構が予想以上に複雑である可能性が示唆された．

ヘルペスウイルスやポリオーマウイルスなどのDNAウイルスは，感染細胞内において様々な種類のnon-coding RNAを発現する．これらのnon-coding RNAは，ウイルスや宿主の遺伝子発現を制御することにより，ウイルス感染症の病態形成に関与すると考えられている．これまでに，ヘルペスウイルスやポリオーマウイルスがmicroRNAやlong non-coding RNAといったnon-coding RNAを発現することが明らかにされてきたが，近年では環状1本鎖RNAであるcircular RNA (circRNA) を発現することが報告されている．本研究では，JCポリオーマウイルスをはじめとしたポリオーマウイルスが発現するcircRNAを同定し，ウイルス関連疾患の病理検体におけるcircRNAの発現量や局在の解明，培養細胞を用いたcircRNAの機能解析を目指している．前年度は培養細胞内で効率良くJCポリオーマウイルスを複製させる実験系を確立した後，次世代シーケンシングおよびRT-PCR法による解析を実施した．その結果，JCポリオーマウイルスが感染細胞内において少なくとも1種類のcircRNAを発現する可能性が示唆されたことから，今年度はウイルスcircRNAの検出系の確立や機能解析を試みた．この過程において，当初circRNAと考えられたRNAは既知のトランススプライシング産物 (Saribas et al., J Cell Physiol, 2018) である可能性が高いと考えられた．また，この他にも多様なトランスクリプトが検出され，JCポリオーマウイルスの遺伝子発現機構が予想以上に複雑である可能性が示唆された．