ポリオーマウイルス感染症におけるウイルスcircRNAの同定および機能解明

多瘤病毒感染中病毒circRNA的鉴定和功能阐明

基本信息

  • 批准号:
    21K20786
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2021-08-30 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

ヘルペスウイルスやポリオーマウイルスなどのDNAウイルスは,感染細胞内において様々な種類のnon-coding RNAを発現する.これらのnon-coding RNAは,ウイルスや宿主の遺伝子発現を制御することにより,ウイルス感染症の病態形成に関与すると考えられている.これまでに,ヘルペスウイルスやポリオーマウイルスがmicroRNAやlong non-coding RNAといったnon-coding RNAを発現することが明らかにされてきたが,近年では環状1本鎖RNAであるcircular RNA (circRNA) を発現することが報告されている.本研究では,JCポリオーマウイルスをはじめとしたポリオーマウイルスが発現するcircRNAを同定し,ウイルス関連疾患の病理検体におけるcircRNAの発現量や局在の解明,培養細胞を用いたcircRNAの機能解析を目指している.前年度は培養細胞内で効率良くJCポリオーマウイルスを複製させる実験系を確立した後,次世代シーケンシングおよびRT-PCR法による解析を実施した.その結果,JCポリオーマウイルスが感染細胞内において少なくとも1種類のcircRNAを発現する可能性が示唆されたことから,今年度はウイルスcircRNAの検出系の確立や機能解析を試みた.この過程において,当初circRNAと考えられたRNAは既知のトランススプライシング産物 (Saribas et al., J Cell Physiol, 2018) である可能性が高いと考えられた.また,この他にも多様なトランスクリプトが検出され,JCポリオーマウイルスの遺伝子発現機構が予想以上に複雑である可能性が示唆された.
The DNA of the infected cells is expressed in different kinds of non-coding RNA. This non-coding RNA is responsible for controlling the development of host genes and for the pathogenesis of infectious diseases. In recent years, circular RNA (circRNA) has been reported to have been discovered in circular RNA. This study identifies the expression of circRNA in pathologies associated with JC-related diseases and indicates the functional analysis of circRNA in cultured cells. In the previous year, the cell culture rate was good. After the cell culture system was established, the cell culture rate and RT-PCR method were analyzed. The results showed that the expression of circadian RNA in infected cells was more likely than that in normal cells. This process was initiated by the discovery of circular RNA, which is a known product of RNA (Saribas et al., J Cell Physiol, 2018). For example, if the number of entries in the list is too high, the JC may not be able to identify the entries in the list.

项目成果

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