自己創生するProtocellでのゲノムDNAの高次構造と機能

自生Protocell中基因组DNA的高阶结构和功能

• 批准号: 22K20640
• 负责人: 西尾 天志
• 金额: $ 1.83万
• 依托单位: Doshisha University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-08-31 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K20640/
• 关键词: 遺伝子発現活性; DNA高次構造; 長鎖DNA; 遺伝子発現; 水/水相分離液滴; 細胞モデル

ポリエチレングリコール(PEG)とデキストラン(DEX)の混合系液滴を用いた細胞モデルの構築を進めた。同時に、細胞モデル構築後に細胞モデル内外の場の条件を変化させるファクターとして用いる候補について、in vitro実験系での予備的な実験を進めた結果、予想外に興味深い以下の結果が得られたため、これらに注力した研究を行った。種々の1価陽イオン(Li+、Na+、K+、Rb+、Cs+、(CH3)4N+)の、転写・翻訳(TX-TL)および、翻訳(TL)のみに対する影響を無細胞系遺伝子発現により比較した。その結果、TX-TL、TLいずれにおいても、Rb+ > K+ > Cs+ > Na+, Li+ > (CH3)4N+の順に遺伝子発現を強く促進し、Rb+が最も強く遺伝子発現を促進することを明らかにした。また、アルコールが転写-翻訳（TX-TL）および翻訳（TL）に及ぼす影響について無細胞遺伝子発現系を用いて検討した。その結果、TX-TL反応において、エタノールおよび2-プロパノールは遺伝子発現の促進・阻害の二相性効果を示す一方で、1-プロパノールは抑制効果のみを示すことが明らかとなった 。また、アルコールがDNA分子の動的性質に及ぼす影響について、揺動散逸定理に基づく長鎖DNA一分子の鎖内揺らぎについて定量的解析を行った結果、1-プロパノールは他のアルコール類よりもDNA分子のバネ定数と減衰定数を著しく増加させることが分かった。本研究では遺伝子発現に対するアルコール異性体の促進・抑制作用が、DNA分子の粘弾性特性の変化と相関していることを明らかにした。

ポ リ エ チ レ ン グ リ コ ー ル (PEG) と デ キ ス ト ラ ン (DEX) の mixed droplet を with い た cells モ デ ル の build を into め た. に at the same time, cell モ デ ル に cells after constructing モ デ ル を の の field inside and outside conditions - the さ せ る フ ァ ク タ ー と し て in い る alternate に つ い て, the in vitro be 験 department で の reserve of な be 験 を into め た results, to think outside interests under deep い に の results ら が れ た た め, こ れ ら に note force し た を line っ た. Kind of 々 の 1 価 Yang イ オ ン (Li +, Na +, K +, Rb +, Cs +, (CH3) 4 n +) の, planning to write turn 訳 (TX - TL) お よ び, double 訳 (TL) の み に す seaborne る influence を no traces of cell line 伝 son 発 now に よ り compare し た. そ の results, TX - TL and TL い ず れ に お い て も, Rb + + > > K > Cs + Na +, Li + > (CH3) 4 n + の shun に heritage 伝 発 を strong く promote し now, traces of Rb + が most strong も く 伝 son 発 を now promote す る こ と を Ming ら か に し た. ま た, ア ル コ ー ル が planning write - turn 訳 (TX - TL) お よ び turn 訳 に (TL) and ぼ す influence に つ い て cell free heritage 伝 発 son is now を with い て beg し 検 た. そ の results, TX - TL 応 に お い て, エ タ ノ ー ル お よ び 2 - プ ロ パ ノ ー ル は posthumous son 伝 発 の now, promote resistance to harm, の two-phase sex services fruit を で す in party, 1 - プ ロ パ ノ ー ル は inhibition of unseen fruit の み を shown す こ と が Ming ら か と な っ た. ま た, ア ル コ ー ル が dynamic に and the properties of DNA molecule の ぼ す influence に つ い て, dynamic dissipation theorem に 揺 づ く long locks within a DNA molecule の lock 揺 ら ぎ に つ い analytical line を っ て quantitative た results, 1 - プ ロ パ ノ ー ル は he の ア ル コ ー ル class よ り も DNA molecule の バ ネ destiny と damping constant を the し く raised plus さ せ る こ と が points か っ Youdaoplaceholder0. This study で は heritage 伝 son 発 now に す seaborne る ア ル コ ー ル の straight body, promoting inhibition, が, DNA molecules stick の 弾 sexual characteristics の phase - change と masato し て い る こ と を Ming ら か に し た.

项目成果

TU Dresden(ドイツ)

德累斯顿工业大学（德国）

Markedly Different Effects of Monovalent Cations on the Efficiency of Gene Expression

单价阳离子对基因表达效率的显着不同影响

• DOI: 10.1002/adbi.202200164
• 发表时间: 2022
• 期刊: Advanced Biology
• 影响因子: 3.7
• 作者: Nishio Takashi;Masaoka Tomoya;Yoshikawa Yuko;Sadakane Koichiro;Kenmotsu Takahiro;Schiessel Helmut;Yoshikawa Kenichi
• 通讯作者: Yoshikawa Kenichi

DNA二本鎖切断のその場観察による定量的計測：クロロゲン酸などの抗酸化物質による保護効果の研究

原位观察定量测量DNA双链断裂：绿原酸等抗氧化剂的保护作用研究

• 发表时间: 2022
• 作者: 小川遥士;西尾天志;吉川祐子;剣持貴弘;貞包浩一朗;吉川研一
• 通讯作者: 吉川研一