溶連菌毒素による宿主翻訳ハイジャック機構の解明

链球菌毒素宿主翻译劫持机制的阐明

• 批准号: 22K20765
• 负责人: 藤 博貴
• 金额: $ 1.83万
• 依托单位: Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-08-31 至 2023-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K20765/
• 关键词: A群レンサ球菌; 宿主翻訳; リボソームプロファイリング; 細菌毒素; NAD-glycohydrolase; NAD-Cap

本研究では病原細菌感染時における宿主翻訳系の生物学的意義に着目している。具体的には、病原細菌が宿主細胞に侵入した際に、宿主翻訳をハイジャックするウイルスのように病原細菌も宿主翻訳を攪乱するのか?、また宿主翻訳と病原細菌の細胞内生存との関係性は何か、という生物学的意義を見出すことを目的とした。細胞内侵入性細菌の一種であるA群レンサ球菌を培養細胞に感染させた際に、A群レンサ球菌の保有する毒素NAD-glycohydrolase（Nga)が宿主翻訳を抑制することを見出しており、Ngaのよる宿主翻訳の抑制機構を解明することで、最初に挙げた生物学的意義を見出すことができる。今年度では、毒素分子によるメカニズムの解明を目指して、まず実験に必要となる菌株の作製に取り組んだ。Nga毒素遺伝子の欠損株や変異株、そして遺伝子相補株を作製した。またNgaの結合するRNA分子を同定するirCLIP-seq に必要な免疫沈降のために、FLAGタグ付きの融合タンパク質としてNgaを発現する株を作製した。実験に必要な変異株の作製が完了し、次にNgaによる翻訳動態の変動を捉える目的に適当な感染時間の検討やRNA結合分子の同定のためのCLIP-seq の予備検討を行った。本来の計画では、来年度にシーケンスやプロファイリングを行う予定であるが、日本学術振興会特別研究員PDへの身分の変更に伴い、今年度が最終年度になるため、結果についてはJSPSPDにおいて報告する予定である。

In this study, the significance of における host 訳 lineage in the case of で で pathogenic bacteria infection is based on the biological significance of に objective に て る る る る る. Specific に は に が host, pathogen bacteria invasion し た interstate に and host 訳 を ハ イ ジ ャ ッ ク す る ウ イ ル ス の よ う に pathogenic bacteria も host turn 訳 を disrupt す る の か? , ま た host turn 訳 の と pathogenic bacteria cell survival と の masato is sexual は か, と い う biology を shows the significance of す こ と を purpose と し た. Intracellular invasive bacteria の A で あ る group A レ ン サ aureus を culture cell に infection さ せ た interstate に, A group of レ ン サ aureus の retain す る poison NAD - glycohydrolase (Nga) が host turn 訳 を inhibit す る こ と を shows し て お り, Nga の よ る host turn 訳 の inhibit institutions を interpret す る こ と で, initially に 挙 The significance of げた biology を can be found in す とがで る る る. Our で は, toxin molecules に よ る メ カ ニ ズ ム の interpret を refers し て, ま ず be 験 に necessary と な る に take the strain の cropping り group ん だ. The Nga toxin remains 伝 subdamaged strains や variant strains and そ て て remains 伝 subcomplementary strains を are used for processing た. ま た Nga の combining す る を RNA molecules with fixed す る irCLIP - seq に necessary な immune sink の た め に, FLAG タ グ pay き の fusion タ ン パ ク qualitative と し て Nga を 発 now す る strains を cropping し た. Be 験 に な necessary - finished が し, the different strains の cropping time に Nga に よ る turn 訳 dynamic の - move を catch え る purpose に な infection time appropriate の 検 for combined with や RNA molecules の with fixed の た め の CLIP - seq の reserve line beg を 検 っ た. Originally の project で は, to annual に シ ー ケ ン ス や プ ロ フ ァ イ リ ン グ を line う designated で あ る が, Japan external academic organization special researcher PD へ の identity の - more に い, our annual に が eventually な る た め, results に つ い て は JSPSPD に お い て report す る designated で あ る.

项目成果

Anatomy of footprint extension in ribosome profiling reveals translational landscape mediated by S1 protein in bacteria

• DOI: 10.21203/rs.3.rs-41219/v1
• 发表时间: 2020-07
• 作者: Tomoya Fujita;T. Yokoyama;M. Shirouzu;H. Taguchi;Takuhiro Ito;Shintaro Iwasaki

Human-rabbit Hybrid Translation System to Explore the Function of Modified Ribosomes.

人类兔混合翻译系统，以探索改良的核糖体的功能。

• DOI: 10.21769/bioprotoc.4714
• 发表时间: 2023-07-05
• 期刊: Bio-protocol
• 影响因子: 0.8