权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

溶連菌毒素による宿主翻訳ハイジャック機構の解明

链球菌毒素宿主翻译劫持机制的阐明

基本信息

批准号：
22K20765
负责人：
藤博貴
金额：
$ 1.83万
依托单位：
Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-08-31 至 2023-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では病原細菌感染時における宿主翻訳系の生物学的意義に着目している。具体的には、病原細菌が宿主細胞に侵入した際に、宿主翻訳をハイジャックするウイルスのように病原細菌も宿主翻訳を攪乱するのか?、また宿主翻訳と病原細菌の細胞内生存との関係性は何か、という生物学的意義を見出すことを目的とした。細胞内侵入性細菌の一種であるA群レンサ球菌を培養細胞に感染させた際に、A群レンサ球菌の保有する毒素NAD-glycohydrolase（Nga)が宿主翻訳を抑制することを見出しており、Ngaのよる宿主翻訳の抑制機構を解明することで、最初に挙げた生物学的意義を見出すことができる。今年度では、毒素分子によるメカニズムの解明を目指して、まず実験に必要となる菌株の作製に取り組んだ。Nga毒素遺伝子の欠損株や変異株、そして遺伝子相補株を作製した。またNgaの結合するRNA分子を同定するirCLIP-seq に必要な免疫沈降のために、FLAGタグ付きの融合タンパク質としてNgaを発現する株を作製した。実験に必要な変異株の作製が完了し、次にNgaによる翻訳動態の変動を捉える目的に適当な感染時間の検討やRNA結合分子の同定のためのCLIP-seq の予備検討を行った。本来の計画では、来年度にシーケンスやプロファイリングを行う予定であるが、日本学術振興会特別研究員PDへの身分の変更に伴い、今年度が最終年度になるため、結果についてはJSPSPDにおいて報告する予定である。

This study focuses on the biological significance of pathogenic bacteria in host culture. Specifically, when pathogenic bacteria invade host cells, host cells are disrupted. The relationship between host and intracellular survival of pathogenic bacteria has biological significance. The biological significance of NAD-glucosidase (Nga), a toxin that inhibits host turnover during infection and retention of group A bacteria in cultured cells, has been revealed. This year, the toxin molecule is identified by the identification and identification of the necessary strain. Nga toxin is a toxin that can cause damage to plants, heterosis, and complement plants. Nga binding RNA molecules are identified by irCLIP-seq, which is necessary for the production of Nga fusion proteins. In order to complete the production of the necessary mutants, the next step is to detect the dynamic changes of the RNA binding molecules, and the preparation of the CLIP-seq for the appropriate infection time. The original plan was to update the identity of PD, a special researcher at the Japan Society for the Promotion of Science, in the coming year, and to report on the results of the JSPSPD in the coming year.

项目成果

期刊论文数量（4）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Anatomy of footprint extension in ribosome profiling reveals translational landscape mediated by S1 protein in bacteria

DOI：
10.21203/rs.3.rs-41219/v1
发表时间：
2020-07
期刊：
影响因子：
0
作者：
Tomoya Fujita;T. Yokoyama;M. Shirouzu;H. Taguchi;Takuhiro Ito;Shintaro Iwasaki
通讯作者：
Tomoya Fujita;T. Yokoyama;M. Shirouzu;H. Taguchi;Takuhiro Ito;Shintaro Iwasaki

Human-rabbit Hybrid Translation System to Explore the Function of Modified Ribosomes.

人类兔混合翻译系统，以探索改良的核糖体的功能。