遠位エンハンサーの標的遺伝子探索原理に関する研究

远端增强子靶基因搜索原理研究

• 批准号: 26890030
• 负责人: 河岡 慎平
• 金额: $ 0.92万
• 依托单位: Advanced Telecommunications Research Institute International
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2014
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2014-08-29 至 2015-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-26890030/
• 关键词: エンハンサー; エピゲノム; ゲノム科学

エンハンサーは、標的とする遺伝子の時空間発現パターンを決定づける重要なゲノム領域である。エンハンサーは時には数 Mb 離れたところ に存在する標的遺伝子の発現を制御する。遠位にあるエンハンサーがどのように標的遺伝子を見つけるかという問題は未解決であり、 エンハンサーの標的を正確に予測することは困難である。本研究では、エンハンサーがどのように遠位に存在する標的遺伝子を見つけるのか、という問題を解決するために、細胞死に関わるエンハンサーをモデルとした新規の実験系構築を行った。まず、公共のデータベースを利用して、細胞死に関与しうるエンハンサーの同定を行った。その結果、いくつかの細胞系譜において、細胞死に関与しうるエンハンサーを発見した。そのうち、血球細胞の細胞死に関与しうるエンハンサーを対象とした解析に注力した。次に、当該血球細胞におけるエンハンサーのゲノム編集実験、あるいは転写活性化因子のテザリング実験を実現するために、当該細胞に対するトランスフェクション効率の検討を行った。リポフェクション、エレクトロポレーションなどのいくつかの実験系を検討した結果、エレクトロポレーションによる実験系の効率がもっとも良いことが分かった。以上確立した実験系を利用して、同定したエンハンサーに対するゲノム編集実験を行った。その結果、エンハンサーの配列あるいは活性の改変を行うためのいくつかのプロトコルを確立することに成功した。今後は、当該年度に確立した実験系を活用して、エンハンサーに関する解析を進めていく予定である。

In terms of time and space, it is necessary to make decisions on important issues and areas of concern. Do not change the number of hours in Mb. There is a cluster of computers in the computer that can control the system. Please tell me that the problem has not been solved. Please do not know if the problem is not solved. In this study, there are some problems in this study, such as the problem solving, cell death, cell death, and so on. in this study, there are some problems in this study. The use of "cell death", "cell death" and "cell death" and "cell death" are the same as those in the same line. The results show that there is no difference in the number of cells, the number of dead cells and the number of dead cells. The blood cell, the cell, the cell. Next time, when the number of blood cells is changed, the activation factor is written, the activation factor is activated, and the activation factor is activated. This is due to the results of the results, the results of the tests, the results of the results, the results of the The above confirmation is that you can make use of the following information to make sure that you can use the same information to make sure that the editing set is not available. The results show that you can make sure that you are successful. You will not be able to do so. In the future, in the current year, we will make sure that there is an active use of the information system, and that we will make a decision on the future.