piRNAの機能解析に基づくカイコ性決定・胚休眠機構の解明
piRNAの機能解析に基づくカイコ性決定・胚休眠機構の解明
批准号:
09J05370
负责人:
河岡 慎平
金额:
$1.79万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2009
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2009 至 2011
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英文摘要
カイコの性は、雌特具的な性染色体であるW染色体によって強力にコントロールされており、W染色体が1コピーあれば雌性が決定される。このことから、W染色体には強力な雌決定因子がコードされていると考えられてきた。しかしながらごく最近まで、W染色体に由来するタンパク質コード遺伝子はおろか、転写物さえ同定されていなかった。その理由として、W染色体が高密度のトランスポゾン配列群によって占拠されている、ということが挙げられる。このことにより、W染色体の高解像度一次配列を得ることは不可能であると考えられている。これまでに行った研究では、W染色体に含まれるトランスポゾンの組成をpiRNAの発現解析データをベースにして予測する、という手法を考案し、各種W染色体変異体の解析を併用することにより、性決定領域に近い領域に座乗するトランスポゾン群ならびに、それらに由来するpiRNAを同定することに成功した。本年度はまず、これまでに得られた知見を論文発表することをめざし、"The silkworm W chromosome is a source of female-enriched piRNAs"をRNA誌に発表することができた。本年度は、W染色体に由来するpiRNAと性との関係を調べるべく、カイコ新規変異体KGの解析を行った。KG系統は2010年に藤井らによって単離された系統である。KG系統の雌は部分的に雄化することが知られており、KG系統の変異はW染色体にマップされている。私は、このKG系統が、W染色体とpiRNA、そして性との関係を調べるための格好の材料であると考え、その性状を調査した。Doublesex(dsx)遺伝子は進化的に保存された性分化に関与する転写因子であり、dsxmRNAは性特異的なスプライシングを受ける。興味深いことに、KG雌の卵巣においては、雄型と雌型両方のdsxmRNAが発現していることが判明した。また、KG雌の卵巣においては、精巣特異的であることが知られている複数の遺伝子が異常に発現していることが分かった。すなわち、KG-W染色体変異によって、dsxのスプライシングパターンに異常が生じ、卵巣において部分的な精巣特異的トランスクリプトームが観察されると考えられた。私のこれまでの研究により、w染色体がpiRNAの源であることが分かっている。つぎに、KG-W染色体変異がpiRNAの性状に与える影響を調査した。次世代シーケンサとインフォマティクスを駆使した解析の結果、性決定領域付近に由来するpiRNAの一部の発現がKG系統の卵巣で有意に減少していることが判明した。したがって、KG-W染色体変異は、piRNAの組成に影響するものと考えられた。最後に、KG雌卵巣におけるトランスポゾンの発現を調査した。すると、KG雌卵巣では、多くのトランスポゾンが過剰発現していることが明らかとなった。本研究は、"Altered expression of testis specific genes, piRNAs, and transposons in the silkworm ovary masculinized by a W chromosome mutation'"として、BMCGenomics誌に発表した。
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DOI:
10.1261/rna.2709411
发表时间:
2011-07-01
期刊:
RNA
影响因子:
4.5
作者:
[Kawaoka, Shinpei, Arai, Yuji, Katsuma, Susumu]
通讯作者:
Katsuma, Susumu
Sex chromosome-dependent amplification of piRNAs in Bombyx mori
家蚕中 piRNA 的性染色体依赖性扩增
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Shinpei Kawaoka, Nobumitsu Hayashi, Yutaka Suzuki, Hiroaki Abe, Sumio Sugano, Toru Shimada, Susumu Katsuma]
通讯作者:
Susumu Katsuma
In vitro recapitulation of PIWI-interacting RNAs in vitro
体外 PIWI 相互作用 RNA 的体外重现
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kawaoka S, Katsuma S, Tomari Y.]
通讯作者:
Tomari Y.
DOI:
10.1261/rna.029777.111
发表时间:
2012-02-01
期刊:
RNA
影响因子:
4.5
作者:
[Kawaoka, Shinpei, Mitsutake, Hiroshi, Katsuma, Susumu]
通讯作者:
Katsuma, Susumu
DOI:
10.1261/rna.027565.111
发表时间:
2011-12-01
期刊:
RNA
影响因子:
4.5
作者:
[Kawaoka, Shinpei, Kadota, Koji, Katsuma, Susumu]
通讯作者:
Katsuma, Susumu
共 6 条
がんによる全身的な宿主免疫抑制の理解に基づくがん免疫療法の発展
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批准号:24K02236
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.9万
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财政年份:2024
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负责人:河岡 慎平
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依托单位:
がんに起因する多臓器の代謝異常を制御する新しい宿主因子の病態機能解析
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批准号:20H03451
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.23万
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财政年份:2020
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负责人:河岡 慎平
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依托单位:
遠位エンハンサーの標的遺伝子探索原理に関する研究
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批准号:26890030
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项目类别:Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
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资助金额:$0.92万
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财政年份:2014
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负责人:河岡 慎平
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依托单位:
国内基金
海外基金
杨梅W染色体决定雌性的关键功能基因的研究
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批准号:31901985
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:25.0万元
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批准年份:2019
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负责人:贾慧敏
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依托单位:
基于W染色体多态性的鸡起源进化与种质鉴定研究
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批准号:31672382
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项目类别:面上项目
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资助金额:62.0万元
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批准年份:2016
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负责人:高玉时
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依托单位: