単子葉植物に特有なアブシシン酸シグナル伝達機構の解明
阐明单子叶植物特有的脱落酸信号转导机制
基本信息
- 批准号:22H02254
- 负责人:
- 金额:$ 11.23万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- 财政年份:2022
- 资助国家:日本
- 起止时间:2022-04-01 至 2025-03-31
- 项目状态:未结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
イネ・コアコレクション109品種を用いて,最も強いABA様活性を示すPYLアンタゴニスト(PANSF5)に対する感受性の違いを比較したところ,第二葉鞘長阻害において品種間で明確な差があることを見出した.そこで,この阻害率を「形質の値」として,約300万のvariantsからなる高密度のSNPマーカーを利用してゲノムワイド関連解析(GWAS)を行った.GWASにおいて,最も強い相関がみられた第3染色体に着目し,アミノ酸配列に変異をもたらすSNPが2つ存在する遺伝子(LOC_Os03g45970)を標的候補として選抜した.LOC_Os03g45970はPDZドメインタンパク質をコードする遺伝子であり,PDZドメインは動物において,タンパク質間相互作用の誘導やシグナル伝達に関わるタンパク質複合体を形成する際の足場タンパク質として機能することが報告されている.そこで,PANSF5由来のシグナル伝達はこのタンパク質の変異によって大きな影響を受けるのではないかと推測し,PDZドメインタンパク質の機能解析を進めた.LOC_Os03g45970がコードするPDZドメインタンパク質のPANSF5結合活性を評価するため,大腸菌発現系により同タンパク質の発現を試みた.しかし,現在までに全長のPDZドメインタンパク質を得ることは出来ていない.この原因の一つとして,発現したタンパク質が大腸菌内で分解・切断されている可能性がある.そこで今後は,宿主を真核生物であるピキア酵母やタバコを用いた植物細胞系に変更して再度発現検討を行う予定である.また,LOC_Os03g45970欠損変異体に対するPANSF5感受性を検証するために,CRISPR-Cas9システムを用いて機能欠損個体の作出に取り組んだ.現在,スクリーニングとT1種子採取を進めている.
109 varieties were tested for ABA activity, showing that PYL activity was the strongest among them (PANSF5). The high density of SNPs in the genome is estimated to be about 3 million. The highest density of SNPs in the genome is estimated by GWAS. The sequence of SNPs is different from the sequence of SNPs.(LOC_Os03g45970) is a candidate for selection. LOC_Os03g45970 is a genetic marker for the PDZ DERMEITIN protein. In animals, PDZ DERMEITIN plays an important role in the formation of protein complexes related to the induction and transduction of protein-protein interactions. This report is based on the following information. In this paper, it is speculated that the origin of PANSF5 is affected by the different characteristics of PDZ. LOC_Os03g45970 is used to evaluate the binding activity of PANSF5 in PDZ. It is also speculated that the development of Escherichia coli is affected by the different characteristics of PDZ. Now the full length of PDZ is available. The reason for this is that it appears that the substance is decomposed in Escherichia coli. In the future, the host eukaryotic organism will be redeveloped into a plant cell line. LOC_Os03g45970 is a functional group of individuals with impaired function. Now, the T1 seed is taken into consideration.
项目成果
期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
日光照射下でも光分解されないABAアゴニストの創出
研制出即使在阳光照射下也不会光降解的 ABA 激动剂
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Wakai Satoshi;Eno Nanami;Mizukami Hirotaka;Sunaba Toshiyuki;Miyanaga Kazuhiko;Miyano Yasuyuki;朝倉 悠,御村紗也,轟 泰司,竹内 純
- 通讯作者:朝倉 悠,御村紗也,轟 泰司,竹内 純
ABA配糖化酵素阻害剤の創出
ABA 糖基转移酶抑制剂的创建
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Nakamichi Norihito;Yamaguchi Junichiro;Sato Ayato;Fujimoto Kazuhiro J.;Ota Eisuke;若井暁;矢野 樹,富倉祐奈,大西利幸,竹内 純,轟 泰司
- 通讯作者:矢野 樹,富倉祐奈,大西利幸,竹内 純,轟 泰司
ABA側鎖カルボキシ基をイソシアニド基に置換したABAアナログABNCの機能研究
ABA 侧链羧基被异氰基取代的 ABA 类似物 ABNC 的功能研究
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Nakamichi Norihito;Yamaguchi Junichiro;Sato Ayato;Fujimoto Kazuhiro J.;Ota Eisuke;若井暁;矢野 樹,富倉祐奈,大西利幸,竹内 純,轟 泰司;宮内彩花,伊藤早輝,巣山友里恵,樫尾葉子,竹内 純,轟 泰司
- 通讯作者:宮内彩花,伊藤早輝,巣山友里恵,樫尾葉子,竹内 純,轟 泰司
ABA代謝不活性化酵素CYP707Aを強力に阻害するイソシアニド化合物の創出
产生强烈抑制 ABA 代谢失活酶 CYP707A 的异氰化物化合物
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Maeda Akari E;Nakamichi Norihito;浮岡希良々,宮内彩花,竹内純,轟泰司
- 通讯作者:浮岡希良々,宮内彩花,竹内純,轟泰司
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