樹冠・樹幹型情報を取り入れた材質形質のゲノミック予測モデルの確立

建立结合树冠和树干类型信息的材料性状基因组预测模型

• 批准号: 22H02411
• 负责人: 武津 英太郎
• 金额: $ 11.15万
• 依托单位: Forest Research and Management Organization
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2026-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22H02411/
• 关键词: ジェノミック予測; 樹冠情報; 樹幹型形質; スギ; ゲノミック予測; 材質; 樹冠; 樹幹形質

本研究は、スギをモデルとし、ゲノミック予測による材質形質の予測精度向上を目的とし、材質形質とゲノム情報を直接的に結びつける従来のモデルを発展させ、樹冠・樹幹型形質と材質形質との関係性をモデルへ組み込み、予測・検証・理解を通し、予測精度の向上を図ることを目標としている。材質形質の予測モデル構築のためのトレーニングデータ取得の材料として、スギさし木クローンが植栽された20年生の林分において遺伝子型の決定と形質評価を進めた。対象クローンの一部である176クローンについて、高濃度ランダムプライマーによるアンプリコンライブラリを作成し、次世代シークエンサーにより塩基配列を決定し（GRAS-Di、トヨタ自動車）、1塩基多型の探索を行った。形質評価対象個体の一部、509個体について、材質形質の一つであるヤング係数の簡易推定値である応力波伝播速度について計測を行った。また、513個体の胸高部より材質形質の測定のために12mmの成長錐を用いてコアサンプルを採取した。UAV-LiDARを用いて、樹冠形状の形質取得に必要な3次元点群データの取得を行った。予測モデルの検証を行う試験地である交配実生試験林において、UAV-LiDARによる樹冠部の3次元点群データの取得を行うとともに、地上LiDARにより樹幹部の3次元点群データを取得した。樹冠・樹幹型形質における材質形質の制御機構の理解に向け、複数の樹冠率になるように枝量を調整したスギクローンの10年生60個体より、胸高部位形成層付近および胸高部と生枝下の中間地点より植物ホルモン量測定用のサンプルを採取した。98クローンについて応力波伝播速度のゲノミックセレクションを試行したこところ、予測値と実測値の相関係数は0.53となり、ゲノムの予測モデルの構築のために必要な表現型・遺伝子型データの収集を進められていることが確認できた。

This study predicts the accuracy of material shape and quality of スギをモデルとし and ゲノミック. Upward purpose, material shape, information, direct knot, direct knotを発开させ、Tree crown・trunk type shape and material shape and quality とのrelational をモデルへ组み込み, Prediction, proof, understanding, prediction accuracy, upward goal, and prediction accuracy. Material shape prediction, material construction, material construction, and material acquisition. Wooden クローンが Planting された 20-year-old forest stand において 缝子 type のdetermination と form quality evaluation 価 を advance めた.対肖クローンの一一である176クローンについて, Takano Made by ランダムプライマーによるアンプリコンライブラリをし, next-generation シークエンサーにより塩based arrangement をdetermination し (GRAS-Di, トヨタautomatic car), 1塩based multi-type Exploration を行った. The shape and quality evaluation is divided into one part of the image, 509 individuals, and material shape and quality.また, 513 individual chest height より material shape measurement のために12mm growth cone を using いてコアサンプルを taken した. UAV-LiDAR uses a three-dimensional point group and a three-dimensional point group to obtain the shape and quality of the tree crown. Predictive test of モデルの検证を行う樓地であるMATING 実生 trial験林において, UAV-LiDAR によるCrown part 3 Dimensional point group is obtained by the line, and LiDAR on the ground is obtained by the trunk of the tree. The 3-dimensional point group is obtained by the line. Crown and trunk shape quality control mechanism control mechanism understanding control mechanism, crown rate adjustment control mechanism 10 Annual growth of 60 individuals, the chest height part of the cambium is close to the breast height part, and the middle part of the branch is under the branch. The amount of the plant is measured using the のサンプルを. 98クローンについて応力波伝 Broadcast Speed のゲノミックセレクシしたこところしたこところョンをTrial and predicted value と実夤のcorrelation coefficientは0.5 3となり, ゲノムのpredicted モデルのconstructed のためにnecessary phenotype・The collection of the remaining pieces of the collection has been confirmed.

项目成果

40年生スギにおける成長・樹型と遺伝的効果による応力波伝播速度の予測モデルの検討

基于 40 年树龄日本柳杉的生​​长、树型和遗传效应的应力波传播速度预测模型的检验

• 发表时间: 2023
• 作者: 武津英太郎;倉原雄二;栗田学;久保田正裕
• 通讯作者: 久保田正裕

九州育種基本区のスギ人工交配実生集団における樹冠形状の遺伝性

九州繁育基地人工杂交日本柳杉苗木群体冠形遗传力

• 发表时间: 2023
• 作者: 武津英太郎;倉原雄二;松永孝治;平岡裕一郎
• 通讯作者: 平岡裕一郎