Mechanisms of human LINE-1 retrotransposition
Mechanisms of human LINE-1 retrotransposition
批准号:
22H02600
负责人:
三好 知一郎
金额:
$11.07万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2026-03-31
中文摘要
生命の設計図であるゲノムの変化は、長期的にみれば集団の多様性を生み出し進化の原動力となりうるが、短期的には疾患につながる遺伝子破壊も引き起こす諸刃の剣である。Long INterspersed Element-1(LINE-1またはL1)は、転写された自身のRNAをDNAに逆転写することでゲノム上を移動(=転移)するレトロトランスポゾンである。L1の転移は遺伝子破壊、染色体欠失や転座などゲノム不安定化を誘導し、様々な疾患原因ともなる。しかし、L1の転移プロセスとその制御因子はまだよくわかっていないため、L1が引き起こすゲノム変化の機序もまだ解明されていない。そこで本研究は、プロテオミクス解析と遺伝学的スクリーニングの手法を組み合わせてL1の制御因子を単離し、それらの機能解析を積み重ねることで、未解明のL1転移過程を明らかにする。本研究では、主に下記3つの研究課題に取り組んでいる。1.核内におけるL1のゲノム挿入機構の解明2.細胞質におけるL1複合体制御機構の解明3.遺伝学的スクリーニングによる転移制御因子の探索本年度は、特に2に着目してL1転移を制御する自然免疫応答因子の機能解析を中心に行い、下記で記載するように、その中の1であるHELZ2について詳細なL1抑制機構を明らかにした。これらの研究を積み重ねることで、将来的には転移を人為的に制御する手法の開発や、L1が関与する疾患・ゲノム不安定化の抑制にむけた応用研究にもつながることが期待される。
英文摘要
生命の設計図であるゲノムの変化は、長期的にみれば集団の多様性を生み出し進化の原動力となりうるが、短期的には疾患につながる遺伝子破壊も引き起こす諸刃の剣である。Long INterspersed Element-1(LINE-1またはL1)は、転写された自身のRNAをDNAに逆転写することでゲノム上を移動(=転移)するレトロトランスポゾンである。L1の転移は遺伝子破壊、染色体欠失や転座などゲノム不安定化を誘導し、様々な疾患原因ともなる。しかし、L1の転移プロセスとその制御因子はまだよくわかっていないため、L1が引き起こすゲノム変化の機序もまだ解明されていない。そこで本研究は、プロテオミクス解析と遺伝学的スクリーニングの手法を組み合わせてL1の制御因子を単離し、それらの機能解析を積み重ねることで、未解明のL1転移過程を明らかにする。本研究では、主に下記3つの研究課題に取り組んでいる。1.核内におけるL1のゲノム挿入機構の解明2.細胞質におけるL1複合体制御機構の解明3.遺伝学的スクリーニングによる転移制御因子の探索本年度は、特に2に着目してL1転移を制御する自然免疫応答因子の機能解析を中心に行い、下記で記載するように、その中の1であるHELZ2について詳細なL1抑制機構を明らかにした。これらの研究を積み重ねることで、将来的には転移を人為的に制御する手法の開発や、L1が関与する疾患・ゲノム不安定化の抑制にむけた応用研究にもつながることが期待される。
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DOI:
10.1038/s41467-022-35757-6
发表时间:
2023-01-13
期刊:
NATURE COMMUNICATIONS
影响因子:
16.6
作者:
[Luqman-Fatah, Ahmad, Watanabe, Yuzo, Uno, Kazuko, Ishikawa, Fuyuki, Moran, John V., Miyoshi, Tomoichiro]
通讯作者:
Miyoshi, Tomoichiro
The interferon stimulated gene product HERC5 inhibits human LINE-1 retrotransposition
干扰素刺激的基因产物HERC5抑制人LINE-1逆转座
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Nishimori K., Abdul Fatah A.L., Watanabe Y., Ishikawa F., and Miyoshi T.]
通讯作者:
and Miyoshi T.
Nucleotide excision repair factors, XPC and Rad23b, regulate human LINE-1 retrotransposition
核苷酸切除修复因子 XPC 和 Rad23b 调节人 LINE-1 逆转录转座
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Sato M., Watanabe Y., Ishikawa F. and Miyoshi T.]
通讯作者:
Ishikawa F. and Miyoshi T.
The mechanism of human LINE-1 retrotransposition facilitated by the mitochondrial protein SSBP1
线粒体蛋白SSBP1促进人LINE-1逆转录转座的机制
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Sugino K., Tang C-W., Watanabe Y., Abdul Fatah A.L., Makino T., Ishikawa F., Moran J.V. and Miyoshi T.]
通讯作者:
Moran J.V. and Miyoshi T.
ゲノム破壊と創生サイクルを生み出すヒトLINE-1の制御機構の解明
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批准号:23K23863
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$5.24万
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财政年份:2024
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负责人:三好 知一郎
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依托单位:
Identification of host factors that regulate Alu retrotransposition
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批准号:21K19219
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$4.08万
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财政年份:2021
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负责人:三好 知一郎
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依托单位:
減数分裂期の相同組換え開始機構の解明
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批准号:09J02475
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.79万
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财政年份:2009
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负责人:三好 知一郎
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依托单位:
海外基金