Identification of host factors that regulate Alu retrotransposition
调节 Alu 逆转录转座的宿主因子的鉴定
基本信息
- 批准号:21K19219
- 负责人:
- 金额:$ 4.08万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
- 财政年份:2021
- 资助国家:日本
- 起止时间:2021-07-09 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
現在、Aluの転移をモニターするレポーターコンストラクトは、G418耐性遺伝子ただ1種類しか存在しない。このためコロニー形成能の低い細胞株や既に遺伝子改変によりG418耐性となっている細胞株についてはAluの転移を観察することができない。そこでAluの転移アッセイをより多くの細胞株に適用し、かつその制御因子を広範に探索するための遺伝学スクリーニングへと発展させるために、これを蛍光蛋白質によって可視化する手法の開発に取り組んだ。初年度は、転移を可視化するための候補コンストラクトを複数作成した。本年度は、これらを改変して多くの細胞株に用いることができる汎用ベクターと組み合わせることで実用化を目指した。そのためにL1のORF2pとAluの転移可視化コンストラクトを共発現するベクターを新たに作成し細胞に導入したところ、これまでに報告されているG418耐性遺伝子で得られたAluの転移頻度と、蛍光蛋白質で可視化した場合で、ほぼ同等の転移頻度が観察された。またこれはL1の逆転写酵素活性を失活させると蛍光蛋白質を発現する細胞がほとんど観察されなかったことから、Aluの転移を蛍光蛋白質で可視化し、定量化することが可能であることを示唆している。しかし、今後ゲノム解析をすすめ、本当にAluがゲノム内に挿入されたのかを確認する必要がある。
Now, Alu's migration is not easy to find, and G418 resistance is not easy to find. The cell lines with low cell formation ability and gene mutation were observed in cell lines with G418 tolerance. Alu's cell line is suitable for use in cell culture, and its regulatory factors are explored in the development of cell culture. In the beginning of the year, the number of candidates was increased. This year, the number of cell lines in use has increased. G418 Tolerance gene was obtained by Alu's migration frequency, fluorescence protein visualization, and detection of the same migration frequency. Inactivation of the reverse transcription enzyme activity of L1 makes it possible to visualize and quantify the expression of photoproteins in cells that are detected and transferred by Alu. In the future, it is necessary to analyze and confirm the contents of the report.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
The interferon stimulated gene-encoded protein HELZ2 inhibits human LINE-1 retrotransposition and LINE-1 RNA-mediated type I interferon induction
干扰素刺激的基因编码蛋白 HELZ2 抑制人 LINE-1 逆转录转座和 LINE-1 RNA 介导的 I 型干扰素诱导
- DOI:10.1101/2022.03.26.485892
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Luqman-Fatah Ahmad;Watanabe Yuzo;Ishikawa Fuyuki;Moran John V.;Miyoshi Tomoichiro
- 通讯作者:Miyoshi Tomoichiro
Molecular interplay between mitochondrial and nuclear single-stranded DNA-binding proteins facilitate human LINE-1 retrotransposition
线粒体和核单链DNA结合蛋白之间的分子相互作用促进人类LINE-1逆转座
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Sugino K.;Makino T.;Watanabe Y.;Ishikawa F.;Moran J.V. and Miyoshi T.
- 通讯作者:Moran J.V. and Miyoshi T.
Multilayered host mechanisms that control human LINE-1 retroransposition
控制人类 LINE-1 逆转录的多层宿主机制
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Nishimori K.;Abdul Fatah A.L.;Watanabe Y.;Ishikawa F.;and Miyoshi T.;三好 知一郎;三好 知一郎;三好 知一郎
- 通讯作者:三好 知一郎
The interferon-stimulated gene protein HELZ2 inhibits human LINE-1 retrotransposition
干扰素刺激的基因蛋白HELZ2抑制人LINE-1逆转录转座
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Abdul Fatah A.L.;Watanabe Y.;Ishikawa F.;Moran J.V. and Miyoshi T.
- 通讯作者:Moran J.V. and Miyoshi T.
宿主因子によるヒトLINE-1の制御メカニズム
宿主因素对人LINE-1的调节机制
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Nishimori K.;Abdul Fatah A.L.;Watanabe Y.;Ishikawa F.;and Miyoshi T.;三好 知一郎
- 通讯作者:三好 知一郎
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- 影响因子:0
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- 发表时间:
2013 - 期刊:
- 影响因子:0
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竹俣 直道;廣田 耕志;山田 貴富;三好 知一郎;太田 邦史 - 通讯作者:
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- DOI:
- 发表时间:
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Tomoichiro Miyoshi;Motoki Saito;Junko Kanoh;Fuyuki Ishikawa;三好 知一郎;石川冬木;石川 冬木;浦野 健;石川 冬木;Fuyuki Ishikawa;石川 冬木;石川 冬木;Fuyuki Ishikawa;石川 冬木;石川冬木;石川 冬木;石川冬木;石川冬木;Fuyuki Ishikawa;石川冬木;石川冬木;石川冬木;石川冬木;Fuyuki Ishikawa;Fuyuki Ishikawa;Fuyuki Ishikawa;Fuyuki Ishikawa;Fuyuki Ishikawa;Fuyuki Ishikawa - 通讯作者:
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