空間的オミクス技術による非淡明細胞型腎細胞癌の腫瘍エコシステムの包括的解明

腎細胞癌のおよそ2割を占める非淡明細胞型腎細胞癌(nccRCC)は、その進行例に対して確立した治療法は存在せず、発がん分子機構に基づいた新規治療法の開発が急務である。ゲノム解析やオミクス解析データの蓄積から、nccRCCにおける遺伝子変異やゲノム再構成が明らかにされてきた。一方で腫瘍組織はがん細胞だけではなく、線維芽細胞や間質、血管内皮細胞、腫瘍関連マクロファージやリンパ球をはじめとする免疫担当細胞等と共に極めて複雑な相互作用からなる腫瘍生態系（エコシステム）を形成しており、がん細胞単独のゲノム解析で発がんやがんの進展を理解するという従来の研究手法には限界がある。本研究では、組織内の位置情報を保持したオミクス解析（空間的オミクス解析）を行う事で、nccRCC腫瘍組織の複雑な細胞間相互作用ネットワークを紐解く。この目的のためにnccRCCのマウス発がんモデル、ヒトnccRCC臨床検体に対して空間的オミクス解析を行い、腫瘍組織エコシステムを包括的に解析する。これまでに、空間的トランスクリプトーム解析に十分な量の各種細胞がヒトnccRCC検体中に存在するかを、腫瘍細胞、血管内皮細胞、免疫担当細胞のマーカーに対する免疫染色で評価した。その結果、対象nccRCC検体においては腫瘍細胞に次いで血管内皮細胞が多く、免疫担当細胞の浸潤は少ないことが明らかとなった。そこで、血管内皮細胞と非血管内皮細胞に分けて空間的トランスクリプトーム解析を実施した。現在、次世代シーケンスデータの解析を行っている。

腎細胞癌のおよそ2割を占める非淡明細胞型腎細胞癌(nccRCC)は、その進行例に対して確立した治療法は存在せず、発がん分子機構に基づいた新規治療法の開発が急務である。ゲノム解析やオミクス解析データの蓄積から、nccRCCにおける遺伝子変異やゲノム再構成が明らかにされてきた。一方で腫瘍組織はがん細胞だけではなく、線維芽細胞や間質、血管内皮細胞、腫瘍関連マクロファージやリンパ球をはじめとする免疫担当細胞等と共に極めて複雑な相互作用からなる腫瘍生態系（エコシステム）を形成しており、がん細胞単独のゲノム解析で発がんやがんの進展を理解するという従来の研究手法には限界がある。本研究では、組織内の位置情報を保持したオミクス解析（空間的オミクス解析）を行う事で、nccRCC腫瘍組織の複雑な細胞間相互作用ネットワークを紐解く。この目的のためにnccRCCのマウス発がんモデル、ヒトnccRCC臨床検体に対して空間的オミクス解析を行い、腫瘍組織エコシステムを包括的に解析する。これまでに、空間的トランスクリプトーム解析に十分な量の各種細胞がヒトnccRCC検体中に存在するかを、腫瘍細胞、血管内皮細胞、免疫担当細胞のマーカーに対する免疫染色で評価した。その結果、対象nccRCC検体においては腫瘍細胞に次いで血管内皮細胞が多く、免疫担当細胞の浸潤は少ないことが明らかとなった。そこで、血管内皮細胞と非血管内皮細胞に分けて空間的トランスクリプトーム解析を実施した。現在、次世代シーケンスデータの解析を行っている。