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空間的オミクス技術による非淡明細胞型腎細胞癌の腫瘍エコシステムの包括的解明

利用空间组学技术全面阐明非透明细胞肾细胞癌的肿瘤生态系统

基本信息

批准号：
22H03215
负责人：
馬場理也
金额：
$ 11.15万
依托单位：
Kumamoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22H03215/
关键词：
非淡明細胞型腎細胞癌空間的オミクス解析

项目摘要

腎細胞癌のおよそ2割を占める非淡明細胞型腎細胞癌(nccRCC)は、その進行例に対して確立した治療法は存在せず、発がん分子機構に基づいた新規治療法の開発が急務である。ゲノム解析やオミクス解析データの蓄積から、nccRCCにおける遺伝子変異やゲノム再構成が明らかにされてきた。一方で腫瘍組織はがん細胞だけではなく、線維芽細胞や間質、血管内皮細胞、腫瘍関連マクロファージやリンパ球をはじめとする免疫担当細胞等と共に極めて複雑な相互作用からなる腫瘍生態系（エコシステム）を形成しており、がん細胞単独のゲノム解析で発がんやがんの進展を理解するという従来の研究手法には限界がある。本研究では、組織内の位置情報を保持したオミクス解析（空間的オミクス解析）を行う事で、nccRCC腫瘍組織の複雑な細胞間相互作用ネットワークを紐解く。この目的のためにnccRCCのマウス発がんモデル、ヒトnccRCC臨床検体に対して空間的オミクス解析を行い、腫瘍組織エコシステムを包括的に解析する。これまでに、空間的トランスクリプトーム解析に十分な量の各種細胞がヒトnccRCC検体中に存在するかを、腫瘍細胞、血管内皮細胞、免疫担当細胞のマーカーに対する免疫染色で評価した。その結果、対象nccRCC検体においては腫瘍細胞に次いで血管内皮細胞が多く、免疫担当細胞の浸潤は少ないことが明らかとなった。そこで、血管内皮細胞と非血管内皮細胞に分けて空間的トランスクリプトーム解析を実施した。現在、次世代シーケンスデータの解析を行っている。

In the treatment of non-light cell cancer (nccRCC), it is necessary to make sure that there is a new method of treatment, and that the new rules and regulations of molecular institutions are required to introduce emergency procedures. This is the first time to analyze how to store the data, and then to reorganize the data into a clear structure. This is the first time that the nccRCC has been reorganized. On the one hand, there is a significant increase in the number of cells, such as cell cycle, cell cycle, vascular endothelial cell, vascular endothelial cell, globular cell, immune cell, and so on. This is the only way to understand the development of research techniques and limits. In this study, intra-organization location information retention analysis (space-time analysis), nccRCC organization replication, intercellular interaction analysis, and so on. The purpose of this paper is to compare the analysis of the data in the space between the nccRCC and the nccRCC machine, and the analysis of the data included in the organization. There are many kinds of nccRCC cells in all kinds of cells, such as cell cycle, cell cycle, vascular endothelial cell, immune carrier, cell cycle, cell cycle, immune response, immunostaining and immunostaining. The results showed that the number of vascular endothelial cells was much higher than that of vascular endothelial cells, and that of immune burden cells was lower than that of nccRCC cells. The analysis of vascular endothelial cells and non-vascular endothelial cells in the space of vascular endothelial cells and vascular endothelial cells was performed. Now, in the next generation, we will analyze the problems of the next generation.

项目成果

期刊论文数量（9）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Seventh BHD international symposium: recent scientific and clinical advancement.

第七届 BHD 国际研讨会：最新科学和临床进展。

DOI：
10.18632/oncotarget.28176
发表时间：
2022
期刊：
Oncotarget
影响因子：
0
作者：
Woodford MR;Andreou A;Baba M;van de Beek I;Di Malta C;Glykofridis I;Grimes H;Henske EP;Iliopoulos O;Kurihara M;Lazor R;Linehan WM;Matsumoto K;Marciniak SJ;Namba Y;Pause A;Rajan N;Ray A;Schmidt LS;Shi W;Steinlein OK;Thierauf J;Zoncu R;Webb A;Mollapour M
通讯作者：
Mollapour M

CRISPR/Cas9 genome wide screening mediated clarification of carcinogenesis by a fusion TFE3

CRISPR/Cas9 全基因组筛选介导融合 TFE3 阐明致癌作用