HU蛋白質・DNA複合体の構造とそのKinetics

HU蛋白/DNA复合物的结构及其动力学

• 批准号: 04254203
• 负责人: 新村 信雄
• 金额: $ 1.22万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1992
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1992 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-04254203/
• 关键词: HU蛋白質; DNA結合蛋白質; DNA・蛋白質複合体; DNA; 中性子小角散乱; X線小角散乱

原核細胞のDNAはHU蛋白質と結合し何らかに規則的な高次構造をとっていると考えられ、HU蛋白質とDNAの複合体の立体構造決定は、原核細胞のDNA複製,転写等の機能の理解に重要な意味を有している。本研究の目的はHU蛋白質・DNA複合体の構造をX線小角散乱及びコントラスト変調法を利用した中性子小角散乱法で決めることである。1.好熱性細菌の大覧培養(約1kg)とHU試料の抽出・精製(60mg)を行った。2.DNA20塩基対の合成・精製。二本鎖DNAの安定性及び蛋白質の結合性を考慮して中央にATsich,両端CGの二重螺旋(10mg)を合成した。3.HU蛋白質単独のX線及び中性子溶液乱による回転半径は19Aと得られた。HU蛋白質の結晶構造解析により得られた分子構造を使って回転半径を計算すると、水溶液で二量体を形成していると仮定すると良い一致が得られた。HU蛋白質が結合するDNA単独のX線及び中性子溶液散乱による回転半径は21Aと得られた。これはB型構造DNA(20塩基対)で期待される回転半径である。Molar Ratio(-[HU蛋白質2量体]/[DNA20塩基対])をそれぞれ、0.66,0.71,1.0,1.18,2.08の試料によるX線及び中性子溶液散乱による回転半径が23Aから34Aにおよぶ結果が得られた。これは、DNA20塩基対螺旋にHU蛋白質2量体を2個結合した複合体及びその複合体が2個30度折れ曲がって結合した高次構造の平均構造モデルで説明できる。HU.DNA複合体の構造は、Nacl塩濃度で変化する。Nacl塩濃度が10mg/ml以下になると、複合体粒子間の相互作用が強くなり、明確な回転半径は得られなくなる。

The combination of prokaryotic DNA-specific HU protein and how-to rules can help us to understand that important things mean important things, such as stereoscopic decision making, prokaryotic DNA replication and writing of HU protein-DNA complex. Objective in this study, HU protein DNA complex was used to make X-ray small-angle scatter and small-angle X-ray scattering. 1. Good sexual bacteria (about 1kg), HU materials, extract essence (60mg), make sure. 2.DNA20 was used to synthesize the essence. The stability and protein binding properties of DNA in ordinary universities were examined. The synthesis of central ATsich, terminal CG double helix (10mg) was studied. 3.HU protein was detected by X-ray and neutral solution. The radius of regression was 19A. The results of HU protein analysis show that the molecular structure makes it possible to calculate the radius of temperature, the formation of two-dimensional body in aqueous solution, and the consistency of molecular weight. HU protein assay combined with DNA X-ray test and neutral solution dispersion test showed that the regression radius was 21A. The B-type DNA (20% base) is expected to return to the radius. Molar Ratio (- [HU protein]

项目成果

U.Sangawa,& N.Niimura: "Small Angle Thermal Neution Seattering of Hen-Egg whste bysozyme in Agueous Solution" Physica. B180&181. 756-758 (1992)

U·桑加瓦,

K.Mikami,N.Niimura,K.Hayashi: "Stwcture Study of Phosphatidylinositel Diphosphate and Bovine Serum Albumin Complex" Phyoica. B180&181. 753-755 (1992)

K.Mikami、N.Niimura、K.Hayashi：“磷脂酰肌醇二磷酸和牛血清白蛋白复合物的结构研究”Phyoica。

新村 信雄: "実験化学講座10「回折」第9章 中性子回折" 丸善, 68 (1992)

新村伸夫：《实验化学课程10“衍射”第9章中子衍射》丸善，68（1992）

N.Niimura,K.Mikami,K.Hayashi,S.Yabuka,T.Takizawa: "Characteristio Strueture of phosphatidylinositol Diphosphte(PIP2)Conplex with BSA and Water in PIP2 lilazy" Proceeding of BSR92. (1993)

N.Niimura、K.Mikami、K.Hayashi、S.Yabuka、T.Takizawa：“PIP2 lizy 中磷脂酰肌醇二磷酸 (PIP2) 与 BSA 和水的复合物的特征结构”BSR92 论文集。

新村 信雄,林 浩平: "イノシトール2リン酸(PIP2)の構造と機能" 生物物理学会誌. 32. 233-238 (1992)

Nobuo Niimura、Kohei Hayashi：“二磷酸肌醇 (PIP2) 的结构和功能”《生物物理学会杂志》32. 233-238 (1992)。