HU蛋白質・DNA複合体の構造とそのPinetics

HU蛋白/DNA复合物的结构及其动力学

• 批准号: 03259203
• 负责人: 新村 信雄
• 金额: $ 1.15万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1991
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1991 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-03259203/
• 关键词: HU蛋白質; DNA結合蛋白質; X線小角散乱; 中性子小角散乱

原核細胞のDNAは自身の細胞の長さの数100倍の長さを持っていることから何らかの規則的な高次構造をとっていると考えられる。 大腸菌核様体にあるHU蛋白質が、その役割を担っていると思われ,HU蛋白質とDNAの複合体の立体構造決定は、原核細胞のDNA複製,転写等の機能の理解に重要な意味を有している。1.HU試料の大量培養と抽出・精製Bacillus Stearothermophilusを大量培養し,約60mgのHU蛋白質を抽出・精製することができた。 但し.大量培養はPHの調整が重要で、今後はそれを調整しながら,培養可能な大量培養槽の確保が必要である。2.HU蛋白質に結合させるDNAの合成HU蛋白質に結合させる20塩基対を有するダブル・ストランドDNAも合成した。 両端をCGとし.中央部はATを豊富なものにした。3.HU蛋白質の水溶液中での構造単独のHU蛋白質を水溶液とし、X線及び中性子小角溶液散乱より、構造決定を行った。 (1),HU蛋白質は,水溶液中で凝集しやすい。 (2),HU蛋白質の回転半径の濃度(2.0mg/ml〜8.0mg/ml)依存性を求めてみると、18.0Å〜19.1Åまでの範囲に入る。 (3),X線及び中性子小角散乱による両方の結果が大変良く一致した。 (4),HU蛋白質の結晶構造解析(HU蛋白質が二量体を形成している。)の結果を仮定し.回転半径を計算すると、18.4Åとなる。また単量体(結晶中で実現している一方の分子を取り除いたモデル)で計算してもほぼ同様な値となる。但し、水溶液中で分子の疎水面が表面に出ることは考えられないので,HU蛋白質は水溶液中で二量体として存在すると結論づけられた。

Prokaryotic cells の は DNA itself の の long さ の number 100 times long の さ を hold っ て い る こ と か ら what ら か の rules な high secondary structure を と っ て い る と exam え ら れ る. Coliform nuclear others body に あ る HU protein が, そ の "を cut bear っ て い る と think わ れ, HU と の DNA protein complex の three-dimensional structure decision は, prokaryotic cells の DNA replication, planning to write の function such as の understand important な に mean を have し て い る. 1. Large-scale culture of HU sample と extraction and refinement Bacillus Stearothermophilusを large-scale culture を, approximately 60mg of <s:1> HU protein を extraction and refinement する とがで とがで た た But し. Mass culture は PH の adjustment important で が, future は そ れ を adjustment し な が ら, cultivation could be な slot の ensure が necessary で あ る. 2. HU protein に combining さ せ る の DNA synthesis HU protein に combining さ せ る 20 salt base を polices have す る ダ ブ ル · ス ト ラ ン ド も DNA synthesis し た. The two ends are をCGと を. The central part is を ATを, toyotomi な を, <s:1> に, た. 3. In the <s:1> aqueous solution of HU protein, the で <s:1> structure of 単 is unique. The を aqueous solution of HU protein と と, X-ray and び medium angular solution are scattered よ, and the structure determines を behavior った. (1) HU protein で, in aqueous solution で agglutination やす やす. (2), HU protein の back planning radius の concentration (2.0 mg/ml ~ 8.0 mg/ml) dependence を o め て み る と, 18.0 A ~ 19.1 A ま で の van 囲 に る. (3) The X-ray and び small Angle dispersion of the two sides による results are が greatly improved く consistent た た. (4) Analysis of the <s:1> crystal structure of HU protein (HU protein が diplosomes を form て て る る.) The <s:1> result を仮 is determined to を仮. Return the 転 radius を to calculate すると, 18.4 A となる. ま た 単 quantity body (crystal で be presently し て い の molecular を る party take り except い た モ デ ル) で computing し て も ほ ぼ with others on な numerical と な る. But し, で molecules in aqueous solution の が 疎 water surface に out る こ と は exam え ら れ な い の で, HU は protein in aqueous solution, で 2 quantity body と し て exist す る と conclusion づ け ら れ た.

项目成果

I.Tanaka: "Solution Scattering Study of Bacterial Histone ‐like Protein HU and DNA Complex." 8th Yokohama Forum for the 21st Century International Symposium on Molecular Structure. 83-83 (1991)

I.Tanaka：“细菌组蛋白样蛋白 HU 和 DNA 复合物的溶液散射研究”，第 8 届横滨论坛 21 世纪国际分子结构研讨会 83-83（1991）。

新村 信雄: "中性子小角散乱によるHU蛋白質・DNA複合体の構造研究" Proceedings of the Workshop on Newtrons in Biology at KENS. 56-59 (1991)

Nobuo Niimura：“通过小角中子散射对 HU 蛋白-DNA 复合物进行结构研究”KENS 生物学牛顿研讨会论文集 56-59 (1991)。

田中 伊知朗: "DNA結合蛋白質HUの水溶液中での構造" 日本生物物理学会誌(第29回年会講演予稿集). 31. S84-S84 (1991)

田中一郎：“水溶液中DNA结合蛋白HU的结构”日本生物物理学会杂志（第29届年会记录）31.S84-S84（1991）。