Automatisierung der Quantifizierung von Protein-Phosphorylierung ohne Verwendung schwerer Isotope für die Proteomforschung mit Massenspektrometrie

使用质谱自动定量蛋白质磷酸化，无需使用重同位素进行蛋白质组学

• 批准号: 48534466
• 负责人: Professor Dr. Fred A. Hamprecht
• 金额: --
• 依托单位: Heidelberg Collaboratory for Image Processing HCI
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2006-12-31 至 2009-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/48534466?language=en
• 关键词: Automatisierung; der; Quantifizierung; von; Protein

Die Proteomik ist die Lehre von der Gesamtheit aller Proteine, die sich zu einem gegeben Entwicklungs- oder Aktivitätsstadium in einer Zelle oder einem Organismus befinden. Die Proteomik trägt zu einem besseren Verständnis der Funktion von Zellen oder Organismen bei und verspricht damit, auch der Schlüssel zu neuen diagnostischen Verfahren zu sein, und Ansatzpunkte für neue therapeutische Verfahren zu liefern, insbesondere für die Behandlung von Krebs. Die Massenspektrometrie hat sich zum wichtigsten Werkzeug der Proteomik entwickelt; es handelt sich dabei um ein analytisches Verfahren, welches die Sequenzierung oder Identifizierung von Protein (-fragmenten) mit bisher unbekannter Sensitivität erlaubt. Leider ist die Massenspektrometrie bisher keine quantitative Technik, d.h. wenn die Menge eines Stoffes ermittelt werden soll, sind „nasschemische Experimente mit schweren Isotopen erforderlich. Von besonderem Interesse ist die Quantifizierung beim Studium sogenannter „post-translationaler Modifikationen . Diese häufig einfachen chemischen Modifikationen eines Proteins können seine Aktivität komplett verändern, und sie können Ereignisse wie Zellteilung oder -tod signalisieren oder auslösen.Die hier vorgeschlagene Innovation ist die Entwicklung einer zuverlässigen Prozedur, welche automatisch die modifizierten und unmodifizierten Versionen eines Proteinfragmentes im Massenspektrum identifiziert; welche deren scheinbare Häufigkeit in einer Zeitreihe von Experimenten misst; welche dann mittels einer rechnerischen Normalisierung für zufällige Variationen zwischen den Experimenten korrigiert; und welche so schließlich die Bestimmung des Ausmaßes von Modifikationen erlaubt, ohne auf schwere Isotope zurückzugreifen. Zu diesem Zweck werden wir vorhandenes (bio-) chemisches Wissen mit Methoden aus der Signalverarbeitung und Mustererkennung kombinieren.

蛋白质组学是蛋白质的遗传学，它在一个Zelle或一个Organismus中被发现。Die Proteomik trägt zu einem besseren Verständnis der Funktion von Zellen oder Organismen bei und verspricht damit，auch der Schlüssel zu neuen diagnosischen Verfahren zu sein，und Ansatzpunkte für neue therapeutische Verfahren zu liefern，insbesondere für die Behandlung von Krebs.质谱法是蛋白质组学研究的重要工具;它可以进行一种分析方法，利用更高的灵敏度对蛋白质（-片段）进行测序或鉴定。这是一种更好的质谱定量技术。当一个人的韦尔登完全消失时，他将进行一次有同位素的化学实验。Von besonderem Interesse ist die Quantifizierung beim Studium sogenannter“post-prepartionaler Modifikationen .这种化学修饰使蛋白质的活性变得非常复杂，而且这种修饰可以通过Zellteilung或tod signalisieren或der auslösen来实现。这种化学修饰的创新是一种开发过程，也可以通过质谱识别来自动修改和未修改的版本;这种方法在一种实验的时代中会出现错误;因此，我们需要对实验中的变异进行重新归一化，并在修正同位素的基础上对修正后的Ausmaßes进行估计。这韦尔登是我们用信号传递和信号收集的方法来处理（生物）化学知识。