大腸菌ゲノムの一次構造の解析

本重点領域研究の計画研究をより円滑に進めるために、昨年度作成した「大腸菌デ-タベ-ス」の利用プログラムを大幅に改良するとともに、新しい塩基配列デ-タ(GenBank65.0)と新しい遺伝子地図デ-タ(Bachmann,1990)を取り入れ、Version2.0として完成させ班員に配付した。また、塩基配列決定法の改良については、昨年度来進めているトランスポゾンを利用しての塩基配列決定の高速化を、ほぼ実用化できる段階まで進めることができた。それとともに、いかに塩基対の個数を正確に読み取るかという方法の確立を目指し、必要なコンピュ-タ-ソフトの改良を行なった。これらの結果、従来の方法の3〜5倍程度の速度で塩基配列決定を進めることができる見通しがついた。一方、大腸菌ゲノムの各種の構造的ならびに機能的特色についても解析を進めた。昨年度に引き続き大腸菌ゲノム中にある湾曲DNAの同定と構造解析を行なうとともに、湾曲DNAに結合する蛋白質を見出した。これによって湾曲DNAの持つ生理的意義の解析への糸口が見出された。また、大腸菌ゲノム中の転写開始シグナル・プロモ-タ-の分布と強度について解析をすすめるとともに、これまであまり解析の進んでいない塩基性蛋白質についても、改良2次元電気泳動による包括的解析を進めることができた。

本重点領域研究の計画研究をより円滑に進めるために、昨年度作成した「大腸菌デ-タベ-ス」の利用プログラムを大幅に改良するとともに、新しい塩基配列デ-タ(GenBank65.0)と新しい遺伝子地図デ-タ(Bachmann,1990)を取り入れ、Version2.0として完成させ班員に配付した。また、塩基配列決定法の改良については、昨年度来進めているトランスポゾンを利用しての塩基配列決定の高速化を、ほぼ実用化できる段階まで進めることができた。それとともに、いかに塩基対の個数を正確に読み取るかという方法の確立を目指し、必要なコンピュ-タ-ソフトの改良を行なった。これらの結果、従来の方法の3〜5倍程度の速度で塩基配列決定を進めることができる見通しがついた。一方、大腸菌ゲノムの各種の構造的ならびに機能的特色についても解析を進めた。昨年度に引き続き大腸菌ゲノム中にある湾曲DNAの同定と構造解析を行なうとともに、湾曲DNAに結合する蛋白質を見出した。これによって湾曲DNAの持つ生理的意義の解析への糸口が見出された。また、大腸菌ゲノム中の転写開始シグナル・プロモ-タ-の分布と強度について解析をすすめるとともに、これまであまり解析の進んでいない塩基性蛋白質についても、改良2次元電気泳動による包括的解析を進めることができた。