大腸菌ゲノムの一次構造の解析

大肠杆菌基因组一级结构分析

• 批准号: 02237105
• 负责人: 磯野 克己
• 金额: $ 21.76万
• 依托单位: Kobe University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1990
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1990 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-02237105/
• 关键词: 大腸菌デ-タベ-ス; 塩基配列決定の高速化; 湾曲DNA; 転写開始シグナル; 塩基性タンパク質

本重点領域研究の計画研究をより円滑に進めるために、昨年度作成した「大腸菌デ-タベ-ス」の利用プログラムを大幅に改良するとともに、新しい塩基配列デ-タ(GenBank65.0)と新しい遺伝子地図デ-タ(Bachmann,1990)を取り入れ、Version2.0として完成させ班員に配付した。また、塩基配列決定法の改良については、昨年度来進めているトランスポゾンを利用しての塩基配列決定の高速化を、ほぼ実用化できる段階まで進めることができた。それとともに、いかに塩基対の個数を正確に読み取るかという方法の確立を目指し、必要なコンピュ-タ-ソフトの改良を行なった。これらの結果、従来の方法の3〜5倍程度の速度で塩基配列決定を進めることができる見通しがついた。一方、大腸菌ゲノムの各種の構造的ならびに機能的特色についても解析を進めた。昨年度に引き続き大腸菌ゲノム中にある湾曲DNAの同定と構造解析を行なうとともに、湾曲DNAに結合する蛋白質を見出した。これによって湾曲DNAの持つ生理的意義の解析への糸口が見出された。また、大腸菌ゲノム中の転写開始シグナル・プロモ-タ-の分布と強度について解析をすすめるとともに、これまであまり解析の進んでいない塩基性蛋白質についても、改良2次元電気泳動による包括的解析を進めることができた。

The research plan for this key area of research has been developed in the past year to greatly improve the utilization of the "Escherichia coli" and the "new base allocation"(GenBank65.0) and the "new base allocation"(Bachmann,1990). The improvement of the base arrangement determination method is based on the improvement of the base arrangement determination method. The correct number of pairs of pairs The result of this method is 3 ~ 5 times faster than that of the previous method. A side, Escherichia coli, a variety of structural features, features, analysis and development. The DNA sequence of E. coli was analyzed and the protein sequence of E. coli was found The analysis of physiological significance of DNA in this field has been found in the end. In addition, the analysis of E. coli, including the analysis of basic proteins and improved two-dimensional electrophoresis, has been carried out.

项目成果

Uemura,Y.: "Cloning,characterization and physical location of the rplY gene which encodes ribosomal protein L25 in Escherichia coli Kー12." Mol.Gen.Genet.(1991)

Uemura, Y.：“大肠杆菌 K-12 中编码核糖体蛋白 L25 的 rplY 基因的克隆、表征和物理位置”（1991 年）。

Igarashi,K.: "Sequence analysis of two temperatureーsensitive mutations in the alpha subunit gene(rpoA)of Escherichia coli RNA polymerase." Nucleic Acids Res.18. 5945-5948 (1990)

Igarashi, K.：“大肠杆菌 RNA 聚合酶 α 亚基基因 (rpoA) 中两个温度敏感突变的序列分析。” 18. 5945-5948 (1990)

Igarashi,K.: "Identification of a subunit assembly domain in the alpha subunit of Escherichia coli RNA polymerase." J.Mol.Biol.(1991)

Igarashi,K.：“大肠杆菌 RNA 聚合酶 α 亚基中亚基组装结构域的鉴定。”

Yohei Natori: "Genetic transfornmation of Lactobacillus casei by electroporation." Biochimie. 72. 265-269 (1990)

Yohei Natori：“通过电穿孔对干酪乳杆菌进行基因转化。”

Yamada,H.: "An <Escherichia coli>___ー protein that preferentially binds tp sharply curved DNA" J.Biochem.(Tokyo). 108. 420-425 (1990)

Yamada, H.：“一种<大肠杆菌>___- 优先结合急剧弯曲 DNA 的蛋白质”J.Biochem.（东京）108. 420-425 (1990)。