FTIR分光法による生体金属分子反応中心の微細構造の動態追跡
FTIR分光法による生体金属分子反応中心の微細構造の動態追跡
批准号:
09235213
负责人:
神取 秀樹
金额:
$1.34万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
1997
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1997 至 --
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本研究ではチトクロムc酸化酵素やバクテリオロドプシンなどのプロトンポンプ蛋白質において、活性中心における反応がどのように1方向のポンプを実現するのかを明らかにすることを目的とした。このため、フーリエ変換赤外(FTIR)分光法を用いた微細構造解析を行ったところ、本年度は以下の研究成果が得られた。(1)バクテリオロドプシンの構造解析:膜蛋白質におけるプロトンポンプには水分子が関与することが考えられるが、我々はこれまでに赤外分光法を用いて蛋白質に結合した水分子の水素結合変化を直接、観測することに成功している。このような水分子が蛋白質内部の制限された空間にどのように存在するのか明らかにするために偏光FTIR分光法を用いた実験を行ったところ、3643cm^<-1>に伸縮振動をもつ水分子はその双極子モーメントが膜の法線に対して60°の角度を成すことがわかった。水分子は蛋白質内部で特定の配向をしており、その変化がプロトンポンプをもたらすことが示唆された。一方、新たに導入した時間分解赤外分光法から低温では捕捉できないO中間体を捉え、特有の蛋白質部分の構造変化を明らかにした。さらに発色団レチナ-ルの変化から遅延した蛋白質部分の変化を見出した。4ナノメーター程度離れた膜の間をプロトンを輸送するためには協奏的な蛋白質の構造変化が要求されるが、このような時間的な遅延は構造変化の因果関係を考察する上で重要な知見を与えるものと考えられる。(2)大腸菌末端酸化酵素の構造解析:大腸菌末端酸化酵素に対してFTIR測定を行うための最適な条件を検討した。赤外分光法を適用するときにいちばん問題となるのは、試料に含まれる水の問題であるが、現在のところペレット試料を用いて構造変化が測定可能であることを確認できた。特に電子供与体としてボフラビンを用いた光還元により、酸化型と還元型の間の差スペクトルを得ることに成功した。
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Nishimura,S.: "Transmembrane Signaling Mediated by Water in Bovine Rhodopsin" Photochem.Photobiol. 66. 796-801 (1997)
Nishimura,S.:“牛视紫红质中水介导的跨膜信号传导”Photochem.Photobiol。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Kandori,H.: "Time-Resolved Fourier Transform Infrared Study of Structural Changes in the Last Steps of the Photocycles of Glu-204 and Leu-93 Mutants of Bacteriorhodopsin" Biochemistry. 36. 5134-5141 (1997)
Kandori,H.:“细菌视紫红质 Glu-204 和 Leu-93 突变体光循环最后步骤结构变化的时间分辨傅里叶变换红外研究”生物化学。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
神取 秀樹: "バイオコンピュータ" Computer Today. 82. 24-31 (1997)
Hideki Kandori:“生物计算机”今日计算机。82. 24-31 (1997)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Hatanaka,M.: "Trp86 -> Phe Replacement in Bacteriorhodopsin Affects a Water Molecule near Asp85 and Light Adaptation" Biochemistry. 36. 5493-5498 (1997)
Hatanaka,M.:“细菌视紫红质中的 Trp86 -> Phe 替换影响 Asp85 附近的水分子和光适应”生物化学。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Hatanaka,M.: "Location and Orientation of Functional Water Molecules in Bacteriorhodopsin as Revealed by Polarized FT-IR Spectroscopy" Biophys.J.73. 1001-1006 (1997)
Hatanaka,M.:“偏振 FT-IR 光谱揭示细菌视紫红质中功能性水分子的位置和方向”Biophys.J.73。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 11 条
ヘリオロドプシンの作動メカニズムの解明
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批准号:21H04768
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$27.46万
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财政年份:2021
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
Elucidation of the mechanism of rhodopsin functions for optogenetics
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批准号:21H04969
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项目类别:Grant-in-Aid for Specially Promoted Research
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资助金额:$395.12万
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财政年份:2021
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
ロドプシンの膜トポロジーを反転させる
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批准号:20K21251
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2020
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
ロドプシンの波長制御機構
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批准号:11F01080
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.51万
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财政年份:2011
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
サイクル反応ではなくフォトクロミズムを示すロドプシンの反応機構解明
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批准号:20044012
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2008
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
時間分解赤外分光法で捉えるバクテリオロドプシン内部の水分子の動態
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批准号:20657030
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.11万
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财政年份:2008
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
低温および時間分解赤外分光によるロドプシンの構造変化の研究
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批准号:20050015
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2008
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
粘土でロドプシンをつくる
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批准号:17657050
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.18万
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财政年份:2005
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
時間分解赤外分光法によるロドプシンの内部結合水の構造解析
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批准号:04F04452
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2004
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
プロトンポンプの方向性を決定する内部結合水の構造解析
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批准号:15076202
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$53.44万
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财政年份:2003
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
レチナール光受容からプロトンポンプまでの動的過程
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批准号:13024242
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2002
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
フラビンを発色団とする光センサー蛋白質の反応機構解明
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批准号:14658215
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.18万
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财政年份:2002
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
一方向のプロトン輸送をもたらすバクテリオロドプシン内の疎水結合と水素結合
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批准号:14045238
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2002
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
一方向のプロトン輸送をもたらすバクテリオロドプシン内の疎水結合と水素結合
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批准号:13031049
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:2001
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
生体内におけるプトロン:電子相互作用系のダイナミクス解析
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批准号:10146228
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1998
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
FTIR分光法による生体金属分子反応中心の微細構造の動態追跡
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批准号:10129215
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1998
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
蛋白質内における光誘起プロトン移動のダイナミクス
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批准号:08218231
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1996
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
蛋白質内における光誘起プロトン移動のダイナミクス
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批准号:07228231
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1995
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
ロドプシン発色団の異なった環境における異性化反応:超高速分光による研究
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批准号:06780545
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1994
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
ピコ秒レーザー閃光法による生体光受容過程にみられる超高速現象の解析
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批准号:63790474
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1988
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
海外基金