生体内におけるプトロン:電子相互作用系のダイナミクス解析
生体内におけるプトロン:電子相互作用系のダイナミクス解析
批准号:
10146228
负责人:
神取 秀樹
金额:
$1.28万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份:
1998
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1998 至 --
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英文摘要
レチナール蛋白質においては、「特異な非局在電子系」が「特異な水素結合系」のダイナミクスを制御し(逆も然り)、高度な機能を発現している。本研究においては、レチナールの非局在電子系の制御のもと、4ナノメータの生体膜間でプロトンを輸送するバクテリオロドプシン、蛋白質蛋白質問相互作用によって情報伝達を行うロドプシンの赤外分光法による研究を行い、以下の成果を得た。バクテリオロドプシンの異性化に伴う蛋白質の側の構造情報を得るため、偏光赤外分光法を初期異性化過程に対して適用した測定系を構築した。その結果、異性化反応に伴う発色団の構造変化によって、水分子を含む水素結合ネットワークに大きな歪みが生じていることがわかった。一方、バクテリオロドプシンがプロトン輸送の方向性を発現するためには、蛋白質内部に方向性を規定するスイッチのようなものが過渡的に生じることが必要であろう。我々は最も大きく構造変化をした中間体であるN中間体における水分子の構造変化を測定することに成功し、後期プロトン移動に関与していると考えられる水分子の水素結合変化を解析した。さらにN中間体に対する偏光赤外分光から、スイッチに伴う蛋白質骨格の構造変化に現れる新しい振動バンドを見出した。さらにシステインのS-H伸縮振動が他の振動から離れた領域に存在することに着目し、水素結合ネットワークの動的な構造変化のプローブとして、システインの導入を提案した。視覚の光センサーであるロドプシンは、超高速異性化を行う結果高い光感度を得ていることが知られている。我々はフェムト秒アップコンバージョン法を用いて、ロドプシンからの蛍光をはじめて実時間で捉えることに成功した。また赤外分光法を用いて活性中心や細胞質側領域に水分子が存在することを明らかにした。視物質であるロドプシンの機能は、光によってG蛋白質を活性化することである。我々は複合体の形成に伴う赤外スペクトルの変化を捉えることに成功し、さらにトランスデューシンにおける相互作用部位であるC末端のペプチドを用いて同様の測定を行うことにより、ロドプシンとトランスデューシンに由来する信号を帰属した。
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茂木立志: "バクテリオロドプシンの結晶構造とプロトン輸送機構" 蛋白質核酸酵素. 44. 51-57 (1998)
茂木达志:“细菌视紫红质的晶体结构和质子传输机制”蛋白质核酸酶。44. 51-57 (1998)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Kandori, H.: "Protein Structural Changes in Bacteriorhodopsin upon Photoisomerization as Revealed by Polarized FTIR Spectroscopy" J.Phys.Chem.B. 102. 7899-7905 (1998)
Kandori, H.:“偏振 FTIR 光谱揭示细菌视紫红质在光异构化过程中的蛋白质结构变化”J.Phys.Chem.B。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Yamazaki, Y.: "Interaction of the Protonated Schiff Base with the Peptide Backbone of Valine 49 and the Intervening Water Molecule in the N Photointermediate of Bacteriorhodopsin" Biochemistry. 37. 1559-1564 (1998)
Yamazaki, Y.:“质子化席夫碱与缬氨酸 49 的肽主链以及细菌视紫红质 N 光中间体中的介入水分子的相互作用”生物化学。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Nagata, T.: "The Hydrogen Bonding Network of Water Molecules and the Peptide Backbone in the Region Connecting Asp83, Gly120 and Glu113 in Bovine Rhodopsin" Biochemistry. 37. 17216-17222 (1998)
Nagata, T.:“牛视紫红质中连接 Asp83、Gly120 和 Glu113 区域的水分子和肽主链的氢键网络”生物化学。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Kandori, H.: "Cysteine S-H as a Hydrogen Bonding Probe in Proteins" J.Am.Chem.Soc.120. 5828-5829 (1998)
Kandori, H.:“半胱氨酸 S-H 作为蛋白质中的氢键探针”J.Am.Chem.Soc.120。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 8 条
ヘリオロドプシンの作動メカニズムの解明
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批准号:21H04768
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$27.46万
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财政年份:2021
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
Elucidation of the mechanism of rhodopsin functions for optogenetics
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批准号:21H04969
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项目类别:Grant-in-Aid for Specially Promoted Research
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资助金额:$395.12万
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财政年份:2021
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
ロドプシンの膜トポロジーを反転させる
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批准号:20K21251
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2020
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
ロドプシンの波長制御機構
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批准号:11F01080
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.51万
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财政年份:2011
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
サイクル反応ではなくフォトクロミズムを示すロドプシンの反応機構解明
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批准号:20044012
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2008
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
時間分解赤外分光法で捉えるバクテリオロドプシン内部の水分子の動態
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批准号:20657030
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.11万
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财政年份:2008
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
低温および時間分解赤外分光によるロドプシンの構造変化の研究
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批准号:20050015
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2008
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
粘土でロドプシンをつくる
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批准号:17657050
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.18万
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财政年份:2005
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
時間分解赤外分光法によるロドプシンの内部結合水の構造解析
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批准号:04F04452
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2004
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
プロトンポンプの方向性を決定する内部結合水の構造解析
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批准号:15076202
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$53.44万
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财政年份:2003
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
レチナール光受容からプロトンポンプまでの動的過程
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批准号:13024242
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2002
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
一方向のプロトン輸送をもたらすバクテリオロドプシン内の疎水結合と水素結合
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批准号:14045238
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2002
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
フラビンを発色団とする光センサー蛋白質の反応機構解明
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批准号:14658215
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.18万
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财政年份:2002
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
一方向のプロトン輸送をもたらすバクテリオロドプシン内の疎水結合と水素結合
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批准号:13031049
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:2001
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
FTIR分光法による生体金属分子反応中心の微細構造の動態追跡
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批准号:10129215
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1998
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
FTIR分光法による生体金属分子反応中心の微細構造の動態追跡
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批准号:09235213
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1997
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
蛋白質内における光誘起プロトン移動のダイナミクス
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批准号:08218231
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1996
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
蛋白質内における光誘起プロトン移動のダイナミクス
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批准号:07228231
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1995
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
ロドプシン発色団の異なった環境における異性化反応:超高速分光による研究
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批准号:06780545
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1994
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
ピコ秒レーザー閃光法による生体光受容過程にみられる超高速現象の解析
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批准号:63790474
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1988
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负责人:神取 秀樹
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依托单位:
海外基金