Frontier of genome biology toward understanding molecular systems supporting cellular life

理解支持细胞生命的分子系统的基因组生物学前沿

基本信息

  • 批准号:
    12205001
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 413.06万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2000
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2000 至 2005
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

生命現象の統合的理解には、生命のプログラムであるゲノムの全構造の解明と、そこに存在する遺伝子のネットワークの解明とが必要である。特定領域研究「ゲノム生物学」は、(1)新たな方法論の開発を含めた、細胞レベルでのゲノム機能の体系的な解析、(2)枯草菌・大腸菌という生物研究のモデル微生物についての、一つの細胞をシステムとして理解することを目指したシステマチックな研究、(3)高等生物を含めた多様な生物についての、様々な細胞機能を司る遺伝子システムやゲノム構造に関する実験的及び情報学的な研究を進めることを目的として、平成12年度に発足し、多くの成果を挙げてきた。そして、前半3年間の研究の到達点と問題点を踏まえ、遺伝子と蛋白質のネットワークの解明にもとづく細胞という階層のシステムとしての理解という目標に焦点をあて、後半2年間の研究を実験的・情報学的研究グループの共同研究として推進するために、平成15年度より研究組織の再編成を行い、研究項目を、「C01細胞システム解明に向けた微生物ゲノム機能の包括的研究と比較ゲノム研究」と「C02細胞システムの情報学的構築に向けた研究」に再編成した。研究項目C01では、モデル細菌のゲノム全遺伝子の機能の比較研究、病原細菌の比較ゲノム研究による病原性の分子基盤の解明、細胞性粘菌を含むモデル微生物の分化システムのゲノム生物学、そして、様々な種特異的遺伝子システムのゲノム科学の立場からの解明を進めた。研究項目C02では、C01からの成果も加え、統合ゲノムデータベースの構築、DNA配列情報からの蛋白質立体構造と機能の予測、DNAアレー解析情報等を利用した遺伝子ネットワークの解析、細胞機能のシミュレーション技術などの情報学的研究を進めた。本研究においては、この5年間の「ゲノム生物学」領域の研究成果報告書をとりまとめた。
Life is like a unified understanding, life is in the process of making a complete understanding, and the existence of a complete understanding is necessary. Research in specific fields, (1) discussion of new methods and methods for the analysis of the system of molecular biology, (2) biological research of Bacillus subtilis and bacteria, biological research of microorganisms, and the understanding of the biological characteristics of microorganisms. (3) the advanced biological engineering includes the multi-purpose biological research, the multi-purpose biological research, the multi-purpose research, the multi-purpose research, and the results of the research. In the first half of the three years, the research reached the point of contact, the study reached the point of contact, the protein and protein in the first half of the year, the research in the first half of the year, in the first half of the year, in the first In the 15th year of Pingcheng, the research organization was reorganized into a research program, a research project, a C01 cell cycle, and a review of the studies that were included in the study of microbial biology. The research project C01, the whole body of bacteria, pathogens, molecular basis of pathogenicity, molecular basis of pathogeny, cellular myxomycetes, myxobacteria, myxomycetes, myxomycetes, myxobacteria, myxomycetes, myxomycetes The research projects C02, C01, and DNA have improved the research progress in the field of technology and information analysis, such as the application of computer science, and so on. In this study, the results of research in the field of medical biology in the past five years have been reviewed.

项目成果

期刊论文数量(209)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Discovery of novel transcription control relationships with gene regulatory networks generated from multiple-disruption full genome expression libraries.
发现与多重破坏全基因组表达文库生成的基因调控网络的新型转录控制关系。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2003
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Aburatani;S.
  • 通讯作者:
    S.
Aburatani, S.: "Discovery of novel transcription control relationships with gene regulatory networks generated from multiple-disruption full genome expression libraries"DNA Res. (印刷中). (2003)
Aburatani, S.:“发现与多重破坏全基因组表达库生成的基因调控网络的新型转录控制关系”DNA Res(2003 年出版)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Kuwana, R.: "Proteomics characterization of novel spore proteins of Bacillus subtilis"Microbiology. 148. 3971-3982 (2002)
Kuwana, R.:“枯草芽孢杆菌新型孢子蛋白的蛋白质组学表征”微生物学。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Maeda, M.: "Changing patterns of gene expression in prestalk cell subtypes of Dictyostelium recognized by in situ hybridization with genes from microarray analyses"Eukaryotic Cell. (印刷中). (2003)
Maeda, M.:“通过微阵列分析基因进行原位杂交识别盘基网柄菌前茎细胞亚型中基因表达的变化”(出版中)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Ishigo-oka,D.: "DnaD protein of Bacillus subtilis interacts with DnaA, the initiator protein of replication"J.Bacteriol.. 183(印刷中). (2001)
Ishigo-oka, D.:“枯草芽孢杆菌的 DnaD 蛋白与复制起始蛋白 DnaA 相互作用”J. Bacteriol.. 183(出版中)(2001 年)。
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  • 资助金额:
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    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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  • 项目类别:
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Identify the Transcriptome and Proteome Associated with miRNAs dring Myogenesis
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    9038986
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    $ 413.06万
  • 项目类别:
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