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ChIP-chip analysis of diversity of binding sites of transcriptional factors in thres E.coli strains

ChIP-chip analysis of diversity of binding sites of transcriptional factors in thres E.coli strains
三种大肠杆菌菌株转录因子结合位点多样性的 ChIP 芯片分析
批准号：
20241045
负责人：
OGASAWARA Naotake
金额：
$32.28万
依托单位：
Nara Institute of Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
财政年份：
2008
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2008 至 2010
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20241045/
关键词：
ゲノム進化・再編ChIP-chip転写制御ネットワークChAP-chipFurH-NSZur転写ネットワーク大腸菌病原性大腸菌転写制御システムChIP-chip解析ChIP-seq解析

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We performed ChIP-chip and ChAP-seq analysis to determine the diversity of binding profiles of transcriptional regulators and transcriptional networks among different E.coli strains. Our analysis revealed that the binding profiles are highly conserved in different E.coli strains, suggesting strongly that the binding profile of atranscriptional regulator is kept even in different E.coli strains which have highly diverse genome structures.
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会议论文
大島拓核様体タンパク質H-NS結合位置の大腸菌株間比較解析
大肠杆菌菌株 Taku Oshima 之间核蛋白中 H-NS 结合位置的比较分析
DOI： --
发表时间： 2011
期刊：
影响因子： --
作者： [東光一, 戸邉亨, 鈴木穣, 菅野純夫, 石川周, 小笠原直毅, 黒川顕]
通讯作者： 黒川顕
ChIP(ChAP) method revealed many aspects of DNA binding proteins in Bacteria
ChIP(ChAP) 方法揭示了细菌中 DNA 结合蛋白的许多方面
DOI： --
发表时间： 2010
期刊：
影响因子： --
作者： [Tashiro Y., Sato Y., Kamada M, 大島拓]
通讯作者： 大島拓
ChIP- and ChAP-chip analysis : Methods of the analysis of a DNA-protein interaction in vivo.
ChIP 和 ChAP 芯片分析：体内 DNA-蛋白质相互作用的分析方法。
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [Sawaki, K., Y.Ishii H.Murata, Taku Oshima]
通讯作者： Taku Oshima
Comparative analysis of Fur binding sitesacross Escherichia coli strains.
大肠杆菌菌株之间毛皮结合位点的比较分析。
DOI： --
发表时间： 2009
期刊：
影响因子： --
作者： [Yoko Kagayama, Taku Oshima, Toru Tobe, Naotake Ogasawar]
通讯作者： Naotake Ogasawar
共 16 条
    Characterization and comparison of nucleoid proteins in different bacterial species
    • 批准号：
      23241062
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
    • 资助金额：
      $30.28万
    • 财政年份：
      2011
    • 负责人：
      OGASAWARA Naotake
    • 依托单位：
      Nara Institute of Science and Technology
    Fundamental Network of Genes and Proteins for Bacterial Cell Growth
    • 批准号：
      17017026
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $128.26万
    • 财政年份：
      2005
    • 负责人：
      OGASAWARA Naotake
    • 依托单位：
      Nara Institute of Science and Technology
    Functional analysis of the Bacillus subtilis GTP-binding protein family
    • 批准号：
      17201040
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
    • 资助金额：
      $30.78万
    • 财政年份：
      2005
    • 负责人：
      OGASAWARA Naotake
    • 依托单位：
      Nara Institute of Science and Technology
    Frontier of genome biology toward understanding molecular systems supporting cellular life
    • 批准号：
      12205001
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $413.06万
    • 财政年份：
      2000
    • 负责人：
      OGASAWARA Naotake
    • 依托单位：
      Nara Institute of Science and Technology
    国内基金
    海外基金
    联合应用CHIP-chip和表达谱芯片研究骨肉瘤启动细胞去分化的表观遗传调控
    • 批准号：
      81001194
    • 项目类别：
      青年科学基金项目
    • 资助金额：
      20.0万元
    • 批准年份：
      2010
    • 负责人：
      邹昌业
    • 依托单位：
      中山大学
    ChIP-chip检筛PPARγ及其激动剂抗肝癌作用的下游基因
    • 批准号：
      30900665
    • 项目类别：
      青年科学基金项目
    • 资助金额：
      19.0万元
    • 批准年份：
      2009
    • 负责人：
      沈波
    • 依托单位：
      广州医科大学
    ChIP-chip技术及鼠疫耶尔森氏菌毒力调控子CRP的研究