ChIP-chip analysis of diversity of binding sites of transcriptional factors in thres E.coli strains

三种大肠杆菌菌株转录因子结合位点多样性的 ChIP 芯片分析

基本信息

  • 批准号:
    20241045
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 32.28万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
  • 财政年份:
    2008
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2008 至 2010
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

We performed ChIP-chip and ChAP-seq analysis to determine the diversity of binding profiles of transcriptional regulators and transcriptional networks among different E.coli strains. Our analysis revealed that the binding profiles are highly conserved in different E.coli strains, suggesting strongly that the binding profile of atranscriptional regulator is kept even in different E.coli strains which have highly diverse genome structures.
我们进行了ChIP-chip和ChAP-seq分析,以确定不同大肠杆菌菌株之间转录调控因子和转录网络的结合谱的多样性。我们的分析显示,结合模式在不同的大肠杆菌菌株中是高度保守的,这强烈地表明,即使在具有高度多样的基因组结构的不同大肠杆菌菌株中,转录调节因子的结合模式也是保持不变的。

项目成果

期刊论文数量(17)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
大島拓核様体タンパク質H-NS結合位置の大腸菌株間比較解析
大肠杆菌菌株 Taku Oshima 之间核蛋白中 H-NS 结合位置的比较分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    東光一;戸邉亨;鈴木穣;菅野純夫;石川周;小笠原直毅;黒川顕
  • 通讯作者:
    黒川顕
ChIP(ChAP) method revealed many aspects of DNA binding proteins in Bacteria
ChIP(ChAP) 方法揭示了细菌中 DNA 结合蛋白的许多方面
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Tashiro Y.;Sato Y.;Kamada M;大島拓
  • 通讯作者:
    大島拓
ChIP- and ChAP-chip analysis : Methods of the analysis of a DNA-protein interaction in vivo.
ChIP 和 ChAP 芯片分析:体内 DNA-蛋白质相互作用的分析方法。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Sawaki;K.;Y.Ishii H.Murata;Taku Oshima
  • 通讯作者:
    Taku Oshima
Comparative analysis of Fur binding sitesacross Escherichia coli strains.
大肠杆菌菌株之间毛皮结合位点的比较分析。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yoko Kagayama;Taku Oshima;Toru Tobe;Naotake Ogasawar
  • 通讯作者:
    Naotake Ogasawar
ChIP-chip解析による異なる大腸菌種におけるFurの結合領域の比較解析
通过 ChIP 芯片分析对不同大肠杆菌物种中的毛皮结合区域进行比较分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Hayashi;M.;大島拓;上田剛士;草合千嘉子;村山智彦;加賀山陽子
  • 通讯作者:
    加賀山陽子
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  • 财政年份:
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  • 资助金额:
    $ 32.28万
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