がんの新規ゲノム異常の探索と多項目遺伝情報によるがんの個性診断法の開発

探索癌症中新的基因组异常并开发利用多项目遗传信息的癌症个体诊断方法

• 批准号: 12217045
• 负责人: 稲澤 譲治
• 金额: $ 39.68万
• 依托单位: Tokyo Medical and Dental University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 2004
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-12217045/
• 关键词: がん; 微細ゲノム構造異常; がん遺伝子; 遺伝子増幅; がん抑制遺伝子; CGHアレイ; 網羅的; メチル化; 癌; 染色体; ゲノム; 遺伝子; 個性診断; マイクロアレイ; CGH; 癌関連遺伝子; アポトーシスインヒビター; 腫瘍; ゲノム異常; 癌関連遺伝; 遺伝子診断; マイクロアイレ

ポストシーケンスの癌研究において、基礎研究で得られた成果を基盤に実地臨床への応用が可能となる新しい診断、治療、予防法の開発に多大な期待が寄せられている.今回の研究では、各種の癌細胞において、網羅的ゲノム一次構造異常解析、エピジェネチック遺伝子制御機構、体系的遺伝子発現などの統合的な癌ゲノム解析を推進し、癌の個別化医療の実現に資する成果を目的に研究を行った.その結果、(1)種々の病型において900例以上の癌のCGH解析を行い、この結果を"CGH databsase"として公開した(http://www.cghtmd.jp/cghdatabase/index.html).(2)総数7099個のBACクローンを配置した5種類の高精度ゲノムDNAアレイを作製した.(3)CGHアレイにより検出した新規の増幅、ホモ欠失領域より新しい癌関連遺伝子候補を見出した.(4)ゲノムDNAアレイをプラットフォームにメチル化DNAの探索法(BAC array-based MAC ; BAMCA法)やクロマチン免疫沈降法(ChIP-on-chip法)の応用法を確立した.(5)小児急性リンパ性白血病のt(1;19)転座より新規の切断点融合遺伝子MEF2D/DAZAP1を同定した.さらに、具体的な固形腫瘍の癌関連遺伝子探索の成果は以下である.食道扁平上皮癌(ESC)細胞株の癌抑制遺伝子LRP1B遺伝子(2q22.1)を同定した(Cancer Res. 2004).肺非小細胞癌(SCLC)の5p13増幅の標的としてSKP2を特定し、その機能亢進が遊走能、浸潤能に関与することを明らかにした(Am J Pathol. 2004).さらに、NSCLCで検出した新規ホモ欠失領域から、肺癌抑制遺伝子DBC1を同定した(Hum Molec Genet. in press).胃癌細胞株32例のCGHアレイ解析を行った.新規増幅をCDK6(7q21.2)に検出した(Cancer Sci. 2005).さらに、新規ホモ欠失領域を検出し標的癌抑制遺伝子候補のMCG22(仮称)を同定した(投稿中).その他に、多発性骨髄腫の1q21増幅の標的PDZK1と薬剤耐性獲得(Am J Pathol. 2004)、各種抗癌剤の薬剤耐性獲得メカニズムと特定ゲノム構造異常の解析(Cancer Res. 2004)などの成果を得た.

ポ ス ト シ ー ケ ン ス の cancer research に お い て, basic research で ら れ た results を base plate に be to clinical へ の 応 may use が と な る new し い method of diagnosis, treatment, to prevent の open 発 に な expect much が send せ ら れ て い る. Today back to の research で は, various の cancer に お い て, snare ゲ ノ ム an abnormal structure parsing, エ ピ ジ ェ ネ チ ッ ク heritage 伝 child of the royal institution, system but 伝 発 now な ど の integrative な carcinoma ゲ ノ ム parsing を し, cancer の individualized medical の be presently に endowment す を る achievements に を line っ た. そ の results, (1) 々 の disease type に お い て Analysis of <s:1> CGH in over 900 cases of cancerous cancer: を rows of を, <s:1> results: を"CGH" Databsase "と し て public し た (http://www.cghtmd.jp/cghdatabase/index.html). (2) count 7099 の 総 BAC ク ロ ー ン を configuration し た 5 kinds の high-precision ゲ ノ ム DNA ア レ イ を cropping し た. (3) the CGH ア レ イ に よ り 検 out し た new rules の rights, ホ モ owe field loss よ り new し い carcinoma masato even heritage 伝 son alternate を shows し た. (4) ゲ ノ ム DNA ア レ イ を プ ラ ッ ト フ ォ ー ム に メ チ ル DNA の exploring the law (BAC array - -based MAC; BAMCA method) や ク ロ マ チ ン immune sink method (ChIP - on - ChIP method) の 応 usage を establish し た. (5) small where acute リ ン パ sex leukaemia の t (1; 19) planning よ り new rules の cutoff point fusion heritage 伝 son MEF2D/DAZAP1 を with fixed し た. さ ら に, specific な solid shape swollen sores の carcinoma masato even heritage 伝 で explore は の results below あ る. Esophageal squamous cell carcinoma (ESC) cell line tumor suppressor 伝 offspring LRP1B 伝 offspring (2q22.1)を same as <s:1> た(Cancer Res. 2004). Non-small cell lung cancer (SCLC) の 5 p13 raised の picture mark と し て SKP2 を specific し, そ の hyperfunction が can walk, can infiltrate に masato and す る こ と を Ming ら か に し た (Am J Pathol. 2004). Youdaoplaceholder0, NSCLCで検 issued <s:1> た new regulations ホモ in the field of deficiency ら, lung cancer inhibitor 伝 DBC1を agreed on た(Hum Molec Genet. in press). 32 cases of gastric Cancer cell lines according to CGHアレ アレ analysis を line った new regulation increase をCDK6(7q21.2)に検 exit た(Cancer Sci.) 2005). さ ら に, new rules ホ モ owe field loss を 検 out し target cancer inhibition of heritage 伝 son alternate の MCG22 (仮) with fixed を し た (contribute). そ の how 発 he に, bone marrow and swollen の q21 raised の picture 1 mark PDZK1 と 薬 tonic patience for (Am J Pathol. 2004), a variety of anti-cancer tonic の 薬 tonic patience for メ カ ニ ズ ム と specific ゲ ノ ム tectonic anomaly の parsing (Cancer Res, 2004) な ど た を の achievements.

项目成果

Hirasawa A, Inazawa J et al.: "Association of 17q21-q24 Gain in Ovarian Clear Cell Adenocarcinomas with Poor Prognosis and Identification of PPM1D and APPBP2 as Likely Amplification Targets"Clinical Cancer Research. 9. 1995-2004 (2003)

Hirasawa A、Inazawa J 等人：“卵巢透明细胞腺癌中 17q21-q24 增益与不良预后的关联以及 PPM1D 和 APPBP2 作为可能扩增靶点的识别”临床癌症研究。

Watanabe T,\ Inazawa J. et al.: "A Novel Amplification at 17q21-23 in Ovarian Cancer Cell Lines Detected by Comparative Genomic Hybridization."Gynecol Oncol. (in press). (2001)

Watanabe T, Inazawa J. 等人：“通过比较基因组杂交检测到卵巢癌细胞系 17q21-23 处的新型扩增。”Gynecol Oncol。

Imoto I, Inazawa J, et al.: "Identification of ZASC1 encoding a Kruppel-like zinc finger protein as a novel target for 3q26 amplification in esophageal squamous-cell carcinomas."Cancer Research. 63. 5691-5696 (2003)

Imoto I、Inazawa J 等人：“鉴定编码 Kruppel 样锌指蛋白的 ZASC1 作为食管鳞状细胞癌 3q26 扩增的新靶标。”癌症研究。

Li QL, Ito K, Inazawa J, et al.: "Causal relationship between the loss of RUNX3 expression and gastric cancer"Cell. 109・1. 113-124 (2002)

Li QL、Ito K、Inazawa J 等：“RUNX3 表达缺失与胃癌之间的因果关系”Cell 109・1（2002）。

Okamoto R, Inazawa J, et al.: "Damaged epithelia regenerated by bone marrow #150; derived cells in the human gastrointestinal tract"Nature Medicine. 8・9. 1011-1017 (2002)

Okamoto R、Inazawa J 等：“骨髓再生受损上皮细胞150；人胃肠道中的衍生细胞”Nature Medicine 8·9 (2002)。