FISH法による癌悪性度判定法の開発

利用FISH法开发癌症恶性程度判定方法

• 批准号: 09256204
• 负责人: 稲澤 譲治
• 金额: $ 25.6万
• 依托单位: Tokyo Medical and Dental University (1998-1999)The University of Tokyo (1997)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 1999
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1999 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-09256204/
• 关键词: 癌; 遺伝子増幅; 癌遺伝子; 癌抑制遺伝子; FISH; CGH; 診断; ヒトゲノム; 腫瘍; 染色体異常; SKY; ゲノム; 遺伝子診断

各種病型の腫瘍を対象にゲノム変化をCGH法で全染色体領域にわたり網羅的にスクリーニングし、悪性度に関与する増幅領域を探索した。見つけだされた新規増幅領域を標的に増幅内遺伝子の同定・単離と機能解析を進めた。胃癌(GC),食道扁平上皮癌(ESC),腎細胞(RCC),卵巣癌(OCC),膵臓癌(PC),肝細胞癌(HCC)、悪性線維性組織球腫(MFH)等の固形腫瘍と成人T細胞性白血病(ATL)においてCGHによる染色体コピー数異常の解析を終了した、(計130株以上)。その結果、新規の増幅領域として複数の細胞株で、1q32,3q36-37,4q12,5P15,7q31,8q22-23,9p23,11q12-14,14q13-21,15q26,17q23-24,18p13等を見出したGC株で検出した15q26増幅領域内に、遺伝子増幅により発現亢進する既知遺伝子IQGAP1と新規遺伝子を同定した。未分化型GC株に比較的高頻度に検出した新規11p13増幅領域内に既知遺伝子ならびに新規遺伝子の3種類をそれぞれ同定した。ESC株において1q32増幅領域内でATF3とCENPFが増幅/発現亢進していることを明らかにした。9p23-24増幅の共通増幅領域から新規の癌関連遺伝子GASC1を単離した。本遺伝子は全長4239bp(1056aaをコード)でPHD,PXドメインを有す。本増幅領域は乳癌の罹病性遺伝子の存在領域とも一致する。RCC株の非乳頭型腎細胞癌において5q31-33領域(D5S624-D5S673)の優先的コピー数増加を明らかにした。本領域内にはPDGFRB,CSF1R,FGF1,IL9,CDC25,CDC25Cなどの増殖関連遺伝子が密に存在する。OCC、HCC細胞株で高頻度検出する14q13-21増幅、またESCの3q36-27増幅において、遺伝子増幅により活性化を受けている既知遺伝子を同定した。悪性線維性組織球腫(Malignant Fibrous Histiocytoma;MFH)で見出した8p23.1増幅領域より新規の増幅遺伝子MASL1を単離した。

Various disease type の swollen sores を like に seaborne ゲ ノ ム variations change を CGH method で whole chromosome field に わ た り snare of に ス ク リ ー ニ ン グ し, 悪 degrees に masato and す る を rights of field exploration し た. See the new regulations on the increase in the field of を, the に increase in the content of 伝 sub-regulations, the same determination, and the analysis of the function of 単 separation from と in を. Gastric cancer (GC), esophageal squamous cell carcinoma (ESC), kidney cells (RCC), egg 巣 carcinoma (OCC), a routine Cui carcinoma (PC), hepatocellular carcinoma (HCC), 悪 sex line d organization ball is swollen (MFH in the department), and other の solid shape swollen sores と adult T cell leukemia (ATL) に お い て CGH に よ る chromosome コ ピ ー several abnormal の parsing を end し た, ( More than 130 plants. The そ そ results showed that in the field of the new regulation <s:1> increase, the と <s:1> て て complex <e:1> cell lines で, 1q32,3q36-37,4q12,5P15,7q31,8q22-23,9p23,11q12-14,14q13-21,15q26,17q23-24,18p13, etc. を showed that the <s:1> たGC line で検 showed た15q2 6 rights に, but 伝 child rights within the territory of に よ り 発 now hyperthyroidism す る son already know but 伝 IQGAP1 と new rules but 伝 son を be し た. Undifferentiated type GC strains に comparison of high frequency に 検 out し た new rules 11 p13 に rights of field already know legacy 伝 son な ら び に new rules but 伝 son の 3 kinds を そ れ ぞ れ with fixed し た. ESC strains に お い て 1 q32 raised amplitude domain で ATF3 と CENPF が rights/picture 発 now hyperthyroidism し て い る こ と を Ming ら か に し た. 9p23-24 increase in the common increase area of ら ら new regulations of cancer-related 伝 offspring GASC1を単 separation た. This heritage has a total length of 4239bp(1056aaをコ ド ド)でPHD,PXドメ を を and す. In this increased range, the pathogenic relapses of breast cancer 伝 are present in the same range as と する. RCC plant の non papillary renal cell carcinoma に お い て 5 q31-33 fields (D5S624 D5S673 の priority コ ピ ー number raised を requirement by Ming ら か に し た. This field に は PDGFRB CSF1R, FGF1, IL9, CDC25, CDC25C な ど の raised colonization masato even heritage 伝 son が dense に exist す る. OCC, HCC cell lines high frequency 検 で す 14 q13-21 rights picture, ま る た ESC の 3 q36-27 rights of に お い て, heritage 伝 child rights of に よ り activeness を by け て い る son already know but 伝 を with fixed し た. Youdaoplaceholder0 Malignant Fibrous Histiocytoma (MFH)で shows the た8p23.1 proliferative field よ 悪 new rule of the <s:1> proliferative derivative 伝 MASL1を単 away from the た.

项目成果

Sakabe, T., Inazawa J. et al.: "Identification of a Novel Gene, MASL1, Within an Amplicon at 8p23.1 Detected in Malignant Fibrous Histiocytomas (MFH) by Comparative Genomic Hybridization"Cancer Res. 51. 511-515 (1999)

Sakabe, T., Inazawa J. 等人：“通过比较基因组杂交在恶性纤维组织细胞瘤 (MFH) 中检测到的 8p23.1 扩增子内的新基因 MASL1 的鉴定”Cancer Res。

稲澤譲治 他: "ゲノム医学の新しい展開" 講談社ライフサイエンティフィク, 126頁 (1998)

Joji Inazawa 等人：“基因组医学的新发展”讲谈社生命科学，126 页（1998 年）

Houri,T.et al: "Chromosomal translocation,t(1;11)(q12;p15),in an extragonadal immature teratoma." Cancer Genet.Cytogenet.97. 79-80 (1997)

Houri,T.等人：“性腺外未成熟畸胎瘤中的染色体易位，t(1;11)(q12;p15)。”

Yang, Z-Q., Inazawa J. et al.: "Molecular cytogenetic analysis of 17 renal-cancer cell lines : increased copy number at 5q31-33 in cell lines from nonpapillary carcinomas"Jpn J Cancer Res. 91. 156-163 (2000)

Yang，Z-Q.，Inazawa J.等：“17种肾癌细胞系的分子细胞遗传学分析：非乳头状癌细胞系中5q31-33拷贝数增加”Jpn J Cancer Res。

Mori T,Inazawa J,et al.: "Cloning and characterization of a novel Rad-family gene,Rab36,within the region at 22q11.2 that Is homozygously deleted in malignant rhabdoid tumors" Biochem Biophys Res Commun. 254. 594-600 (1999)

Mori T、Inazawa J 等人：“22q11.2 区域内新型 Rad 家族基因 Rab36 的克隆和表征，该基因在恶性横纹肌样肿瘤中纯合缺失”Biochem Biophys Res Commun。